Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06654
- Subject:
- NM_001252260.1
- Aligned Length:
- 885
- Identities:
- 763
- Gaps:
- 51
Alignment
Query 1 ATGGAAGATTCGATGGACATGGACATGAGCCCCCTGAGGCCCCAGAACTATCTTTTCGGTTGTGAACTAAAGGC 74
||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1 ATGGAAGACTCGATGGATATGGACATGAGTCCTCTTAGGCCTCAGAACTACCTTTTC----------------- 57
Query 75 CGACAAAGATTATCACTTTAAGGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTATCTTTAAGAACGGTCAGTTTAG 148
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 58 ----------------------GTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTGTCATTAAGAACGGTCAGTTTAG 109
Query 149 GGGCTGGTGCAAAGGATGAGTTGCACATTGTTGAAGCAGAGGCAATGAATTACGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA 222
|.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 110 GAGCAGGGGCAAAAGATGAGTTACACATCGTAGAGGCAGAAGCAATGAACTATGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA 183
Query 223 ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAGCCAACGGTTTCCCTTGGGGGCTTTGAAATAACACCACCAGTGGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 184 ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAACCAACAGTTTCCCTAGGGGGCTTTGAAATTACACCACCTGTGGT 257
Query 297 CTTAAGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCAGTGCATATTAGTGGACAGCACTTAGTAGCTGTGGAGGAAGATGCAG 370
||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 258 CTTACGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCTGTGCACATTAGTGGACAGCATCTAGTAGCTGTAGAGGAAGATGCAG 331
Query 371 AGTCAGAAGATGAAGAGGAGGAGGATGTGAAACTCTTAAGTATATCTGGAAAGCGGTCTGCCCCTGGAGGTGGT 444
||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 332 AGTCTGAAGATGAAGATGAGGAGGACGTAAAACTCTTAGGCATGTCTGGAAAGCGATCTGCTCCTGGAGGTGGT 405
Query 445 AGCAAGGTTCCGCAGAAAAAAGTAAAACTTGCTGCTGATGAAGATGAT---GACGATGATGATGAAGAGGATGA 515
|.|||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 406 AACAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACT------TGATGAAGATGATGAGGACGATGATGAGGACGATGAGGA 473
Query 516 TGATGAAGATGATGATGATGATGATTTTGATGATGAGGAAGCTGAAGAAAAAGCGCCAGTGAAGAAATCTATAC 589
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|..|||||||||||||||.|||
Sbjct 474 TGATGAGGATGATGATGATGATGATTTTGATGAAGAGGAAACTGAAGAAAAGGTCCCAGTGAAGAAATCTGTAC 547
Query 590 GAGATACTCCAGCCAAAAATGCACAAAAGTCAAATCAGAATGGAAAAGACTCAAAACCATCATCAACACCAAGA 663
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||| ||||||||||.|||
Sbjct 548 GAGATACCCCAGCCAAAAATGCACAAAAATCAAACCAAAATGGAAAAGACTTAAAAC---CATCAACACCGAGA 618
Query 664 TCAAAAGGACAAGAATCCTTCAAGAAACAGGAAAAAACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA 737
|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 TCAAAGGGTCAAGAGTCCTTCAAAAAACAGGAAAAGACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA 692
Query 738 CATTAAAGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGTGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAATTCATCAATT 811
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 693 CATTAAGGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGCGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAGTTCATTAATT 766
Query 812 ATGTGAAGAATTGCTTCCGGATGACTGACCAAGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAGTCTCTT 882
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 767 ATGTGAAGAATTGTTTCCGGATGACTGACCAGGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAATCTCTT 837