Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06654
• Subject: NM_008722.3
• Aligned Length: 885
• Identities: 798
• Gaps: 12

Alignment

Query   1  ATGGAAGATTCGATGGACATGGACATGAGCCCCCTGAGGCCCCAGAACTATCTTTTCGGTTGTGAACTAAAGGC  74
           ||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAAGACTCGATGGATATGGACATGAGTCCTCTTAGGCCTCAGAACTACCTTTTCGGCTGTGAACTAAAGGC  74

Query  75  CGACAAAGATTATCACTTTAAGGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTATCTTTAAGAACGGTCAGTTTAG  148
           .||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGACAAAGACTATCACTTTAAAGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTGTCATTAAGAACGGTCAGTTTAG  148

Query 149  GGGCTGGTGCAAAGGATGAGTTGCACATTGTTGAAGCAGAGGCAATGAATTACGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  222
           |.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GAGCAGGGGCAAAAGATGAGTTACACATCGTAGAGGCAGAAGCAATGAACTATGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  222

Query 223  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAGCCAACGGTTTCCCTTGGGGGCTTTGAAATAACACCACCAGTGGT  296
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 223  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAACCAACAGTTTCCCTAGGGGGCTTTGAAATTACACCACCTGTGGT  296

Query 297  CTTAAGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCAGTGCATATTAGTGGACAGCACTTAGTAGCTGTGGAGGAAGATGCAG  370
           ||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297  CTTACGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCTGTGCACATTAGTGGACAGCATCTAGTAGCTGTAGAGGAAGATGCAG  370

Query 371  AGTCAGAAGATGAAGAGGAGGAGGATGTGAAACTCTTAAGTATATCTGGAAAGCGGTCTGCCCCTGGAGGTGGT  444
           ||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 371  AGTCTGAAGATGAAGATGAGGAGGACGTAAAACTCTTAGGCATGTCTGGAAAGCGATCTGCTCCTGGAGGTGGT  444

Query 445  AGCAAGGTTCCGCAGAAAAAAGTAAAACTTGCTGCTGATGAAGATGAT---GACGATGATGATGAAGAGGATGA  515
           |.|||||||||.|||||||||||||||||      |||||||||||||   |||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 445  AACAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACT------TGATGAAGATGATGAGGACGATGATGAGGACGATGAGGA  512

Query 516  TGATGAAGATGATGATGATGATGATTTTGATGATGAGGAAGCTGAAGAAAAAGCGCCAGTGAAGAAATCTATAC  589
           ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|..|||||||||||||||.|||
Sbjct 513  TGATGAGGATGATGATGATGATGATTTTGATGAAGAGGAAACTGAAGAAAAGGTCCCAGTGAAGAAATCTGTAC  586

Query 590  GAGATACTCCAGCCAAAAATGCACAAAAGTCAAATCAGAATGGAAAAGACTCAAAACCATCATCAACACCAAGA  663
           |||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|||||   ||||||||||.|||
Sbjct 587  GAGATACCCCAGCCAAAAATGCACAAAAATCAAACCAAAATGGAAAAGACTTAAAAC---CATCAACACCGAGA  657

Query 664  TCAAAAGGACAAGAATCCTTCAAGAAACAGGAAAAAACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA  737
           |||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658  TCAAAGGGTCAAGAGTCCTTCAAAAAACAGGAAAAGACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA  731

Query 738  CATTAAAGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGTGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAATTCATCAATT  811
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 732  CATTAAGGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGCGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAGTTCATTAATT  805

Query 812  ATGTGAAGAATTGCTTCCGGATGACTGACCAAGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAGTCTCTT  882
           |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 806  ATGTGAAGAATTGTTTCCGGATGACTGACCAGGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAATCTCTT  876