Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06665
- Subject:
- NM_001171814.1
- Aligned Length:
- 1317
- Identities:
- 902
- Gaps:
- 414
Alignment
Query 1 ATGTTTTCCAAACTGGCACATTTGCAGAGGTTTGCTGTACTTAGTCGCGGAGTTCATTCTTCAGTGGCTTCTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TACATCTGTTGCAACTAAAAAAACAGTCCAAGGCCCTCCAACCTCTGATGACATTTTTGAAAGGGAATATAAGT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGGTGCACACAACTACCATCCTTTACCTGTAGCCCTGGAGAGAGGAAAAGGTATTTACTTATGGGATGTAGAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GGCAGAAAATATTTTGACTTCCTGAGTTCTTACAGTGCTGTCAACCAAGGGCATTGTCACCCCAAGATTGTGAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGCTCTGAAGAGTCAAGTGGACAAATTGACCTTAACATCTAGAGCTTTCTATAATAACGTACTTGGTGAATATG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGAGTATATTACTAAACTTTTCAACTACCACAAAGTTCTTCCTATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------ATGAATACAGGAGTGGAGGCTGGAGAGACT 30
Query 445 GCCTGTAAACTAGCTCGTAAGTGGGGCTATACCGTGAAGGGCATTCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 GCCTGTAAACTAGCTCGTAAGTGGGGCTATACCGTGAAGGGCATTCAGAAATACAAAGCAAAGATTGTTTTTGC 104
Query 519 AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 AGCTGGGAACTTCTGGGGTAGGACGTTGTCTGCTATCTCCAGTTCCACAGACCCAACCAGTTACGATGGTTTTG 178
Query 593 GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 GACCATTTATGCCGGGATTCGACATCATTCCCTATAATGATCTGCCCGCACTGGAGCGTGCTCTTCAGGATCCA 252
Query 667 AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 AATGTGGCTGCGTTCATGGTAGAACCAATTCAGGGTGAAGCAGGCGTTGTTGTTCCGGATCCAGGTTACCTAAT 326
Query 741 GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 GGGAGTGCGAGAGCTCTGCACCAGGCACCAGGTTCTCTTTATTGCTGATGAAATACAGACAGGATTGGCCAGAA 400
Query 815 CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 CTGGTAGATGGCTGGCTGTTGATTATGAAAATGTCAGACCTGATATAGTCCTCCTTGGAAAGGCCCTTTCTGGG 474
Query 889 GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 GGCTTATACCCTGTGTCTGCAGTGCTGTGTGATGATGACATCATGCTGACCATTAAGCCAGGGGAGCATGGGTC 548
Query 963 CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 CACATACGGTGGCAATCCACTAGGCTGCCGAGTGGCCATCGCAGCCCTTGAGGTTTTAGAAGAAGAAAACCTTG 622
Query 1037 CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 CTGAAAATGCAGACAAATTGGGCATTATCTTGAGAAATGAACTCATGAAGCTACCTTCTGATGTTGTAACTGCC 696
Query 1111 GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAACGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 GTAAGAGGAAAAGGATTATTAAACGCTATTGTCATTAAAGAAACCAAAGATTGGGATGCTTGGAAGGTGTGTCT 770
Query 1185 ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 ACGACTTCGAGATAATGGACTTCTGGCCAAGCCAACCCATGGCGACATTATCAGGTTTGCGCCTCCGCTGGTGA 844
Query 1259 TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTATCTTTC 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 845 TCAAGGAGGATGAGCTTCGAGAGTCCATTGAAATTATTAACAAGACCATCTTGTCTTTC 903