Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06683
- Subject:
- XM_011250819.2
- Aligned Length:
- 2414
- Identities:
- 2108
- Gaps:
- 37
Alignment
Query 1 ATGGAGCTGAGGCCCTGGTTGCTATGGGTGGTAGCAGCAACAGGAACCTTGGTCCTGCTAGCAGCTGATGCTCA 74
|||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTGAGATCCTGGTTGCTATGGGTGGTCGCAGCAGCAGGAGCCGTGGTCCTGCTGGCAGCTGATGCTCA 74
Query 75 GGGCCAGAAGGTCTTCACCAACACGTGGGCTGTGCGCATCCCTGGAGGCCCAGCGGTGGCCAACAGTGTGGCAC 148
.|||||||||.|||||||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||..|.||.|||||.|
Sbjct 75 AGGCCAGAAGATCTTCACCAACACCTGGGCCGTGCACATTCCTGGAGGCCCAGCTGTGGCTGATAGGGTGGCGC 148
Query 149 GGAAGCATGGGTTCCTCAACCTGGGCCAGATCTTCGGGGACTATTACCACTTCTGGCATCGAGGAGTGACGAAG 222
.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||.||||||.|||
Sbjct 149 AGAAGCATGGCTTCCACAACCTGGGCCAGATCTTCGGTGACTATTACCACTTCTGGCACAGAGCAGTGACAAAG 222
Query 223 CGGTCCCTGTCGCCTCACCGCCCGCGGCACAGCCGGCTGCAGAGGGAGCCTCAAGTACAGTGGCTGGAACAGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 223 CGGTCCCTGTCGCCTCACCGCCCGCGGCACAGCCGGCTACAGAGGGAGCCTCAAGTAAAGTGGCTGGAGCAGCA 296
Query 297 GGTGGCAAAGCGACGGACTAAACGGGACGTGTACCAGGAGCCCACAGACCCCAAGTTTCCTCAGCAGTGGTACC 370
|||.||.||||||.|..|.||..||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 297 GGTAGCCAAGCGAAGAGCCAAGAGGGACGTGTATCAGGAGCCCACGGACCCCAAGTTCCCCCAGCAGTGGTACC 370
Query 371 TGTCTGGTGTCACTCAGCGGGACCTGAATGTGAAGGCGGCCTGGGCGCAGGGCTACACAGGGCACGGCATTGTG 444
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 TGTCTGGTGTCACTCAGCGAGACCTGAATGTGAAGGAGGCCTGGGCCCAGGGCTTCACAGGCCATGGCATTGTG 444
Query 445 GTCTCCATTCTGGACGATGGCATCGAGAAGAACCACCCGGACTTGGCAGGCAATTATGATCCTGGGGCCAGTTT 518
||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 GTCTCCATCCTGGATGACGGCATTGAGAAGAATCATCCCGACCTAGCAGGCAATTATGACCCTGGAGCCAGTTT 518
Query 519 TGATGTCAATGACCAGGACCCTGACCCCCAGCCTCGGTACACACAGATGAATGACAACAGGCACGGCACACGGT 592
|||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 519 TGACGTGAATGACCAGGACCCCGACCCACAGCCTCGGTACACACAGATGAATGACAACAGGCATGGCACTCGCT 592
Query 593 GTGCGGGGGAAGTGGCTGCGGTGGCCAACAACGGTGTCTGTGGTGTAGGTGTGGCCTACAACGCCCGCATTGG- 665
||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 593 GTGCCGGGGAAGTGGCAGCAGTGGCCAACAATGGTGTCTGTGGCGTAGGTGTAGCTTACAATGCCCGAATTGGA 666
Query 666 -----------------------------AGGGGTGCGCATGCTGGATGGCGAGGTGACAGATGCAGTGGAGGC 710
|||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 GCACCCCTTTTCCCACCCCCTCTGCGGCCAGGGGTGCGGATGTTGGATGGCGAGGTGACTGATGCAGTAGAGGC 740
Query 711 ACGCTCGCTGGGCCTGAACCCCAACCACATCCACATCTACAGTGCCAGCTGGGGCCCCGAGGATGACGGCAAGA 784
|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 741 ACGTTCGCTGGGCCTGAATCCCAACCACATCCACATCTACAGCGCCAGCTGGGGCCCTGAGGACGACGGCAAGA 814
Query 785 CAGTGGATGGGCCAGCCCGCCTCGCCGAGGAGGCCTTCTTCCGTGGGGTTAGCCAGGGCCGAGGGGGGCTGGGC 858
|.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 CCGTGGATGGACCAGCCCGGCTCGCTGAGGAGGCCTTCTTTCGGGGAGTTAGCCAGGGCCGAGGAGGGCTGGGC 888
Query 859 TCCATCTTTGTCTGGGCCTCGGGGAACGGGGGCCGGGAACATGACAGCTGCAACTGCGACGGCTACACCAACAG 932
||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCATCTTTGTCTGGGCCTCAGGGAATGGGGGCCGGGAACATGACAGCTGCAACTGTGACGGCTACACCAACAG 962
Query 933 TATCTACACGCTGTCCATCAGCAGCGCCACGCAGTTTGGCAACGTGCCGTGGTACAGCGAGGCCTGCTCGTCCA 1006
.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 963 CATCTATACACTGTCCATCAGCAGCGCCACACAGTTCGGCAATGTGCCCTGGTACAGTGAGGCCTGCTCCTCCA 1036
Query 1007 CACTGGCCACGACCTACAGCAGTGGCAACCAGAATGAGAAGCAGATCGTGACGACTGACTTGCGGCAGAAGTGC 1080
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1037 CACTGGCCACCACCTACAGCAGCGGCAACCAGAATGAGAAGCAGATCGTGACAACTGACCTGAGGCAGAAGTGC 1110
Query 1081 ACGGAGTCTCACACGGGCACCTCAGCCTCTGCCCCCTTAGCAGCCGGCATCATTGCTCTCACCCTGGAGGCCAA 1154
||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACAGAATCTCACACAGGCACCTCGGCTTCTGCCCCCTTGGCAGCTGGTATCATTGCTCTCACCCTGGAGGCCAA 1184
Query 1155 TAAGAACCTCACATGGCGGGACATGCAACACCTGGTGGTACAGACCTCGAAGCCAGCCCACCTCAATGCCAACG 1228
.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.|
Sbjct 1185 CAAGAACCTCACCTGGCGGGACATGCAGCACCTGGTAGTGCAGACCTCAAAGCCAGCCCACCTCAACGCTGATG 1258
Query 1229 ACTGGGCCACCAATGGTGTGGGCCGGAAAGTGAGCCACTCATATGGCTACGGGCTTTTGGACGCAGGCGCCATG 1302
|.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1259 ATTGGGCTACCAACGGCGTGGGCCGGAAAGTGAGCCATTCGTATGGCTACGGGCTGTTGGATGCAGGTGCCATG 1332
Query 1303 GTGGCCCTGGCCCAGAATTGGACCACAGTGGCCCCCCAGCGGAAGTGCATCATCGACATCCTCACCGAGCCCAA 1376
|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||....||.|||||
Sbjct 1333 GTGGCTCTGGCCCAGAACTGGACAACAGTGGCCCCCCAGCGGAAGTGCATTGTTGAAATCCTGGTGGAACCCAA 1406
Query 1377 AGACATCGGGAAACGGCTCGAGGTGCGGAAGACCGTGACCGCGTGCCTGGGCGAGCCCAACCACATCACTCGGC 1450
.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|||
Sbjct 1407 GGACATCGGCAAACGGCTAGAGGTGCGCAAGGCGGTGACAGCATGCCTGGGTGAGCCCAACCACATCACCAGGC 1480
Query 1451 TGGAGCACGCTCAGGCGCGGCTCACCCTGTCCTATAATCGCCGTGGCGACCTGGCCATCCACCTGGTCAGCCCC 1524
||||.||||.||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||..||||||||
Sbjct 1481 TGGAACACGTTCAGGCCCGGCTCACCCTGTCTTACAATCGCCGCGGTGACCTGGCTATCCACCTCATCAGCCCC 1554
Query 1525 ATGGGCACCCGCTCCACCCTGCTGGCAGCCAGGCCACATGACTACTCCGCAGATGGGTTTAATGACTGGGCCTT 1598
|||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1555 ATGGGCACCCGCTCCACCCTGTTAGCTGCCAGACCACATGACTACTCTGCTGATGGGTTTAATGATTGGGCTTT 1628
Query 1599 CATGACAACTCATTCCTGGGATGAGGATCCCTCTGGCGAGTGGGTCCTAGAGATTGAAAACACCAGCGAAGCCA 1672
|||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1629 CATGACAACCCATTCCTGGGATGAGGATCCGGCTGGCGAATGGGTCCTAGAGATTGAAAATACCAGTGAAGCCA 1702
Query 1673 ACAACTATGGGACGCTGACCAAGTTCACCCTCGTACTCTATGGCACCGCCCCTGAGGGGCTGCCCGTACCTCCA 1746
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||..|...|||||||
Sbjct 1703 ACAACTATGGGACGCTGACCAAGTTCACTCTCGTTCTGTATGGCACAGCCCCCGAGGGGCTCTCTACACCTCCA 1776
Query 1747 GAAAGCAGTGGCTGCAAGACCCTCACGTCCAGTCAGGCCTGTGTGGTGTGCGAGGAAGGCTTCTCCCTGCACCA 1820
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|.|||.||||||||
Sbjct 1777 GAAAGCAGCGGCTGCAAGACCCTCACATCCAGCCAGGCCTGCGTGGTGTGTGAGGAAGGTTACTCTCTGCACCA 1850
Query 1821 GAAGAGCTGTGTCCAGCACTGCCCTCCAGGCTTCGCCCCCCAAGTCCTCGATACGCACTATAGCACCGAGAATG 1894
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1851 GAAAAGCTGTGTCCAGCACTGCCCACCAGGCTTCATCCCCCAAGTCCTTGATACACACTACAGCACTGAGAATG 1924
Query 1895 ACGTGGAGACCATCCGGGCCAGCGTCTGCGCCCCCTGCCACGCCTCATGTGCCACATGCCAGGGGCCGGCCCTG 1968
|.|||||||.||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..
Sbjct 1925 ATGTGGAGATCATCCGTGCCAGCGTCTGTACCCCCTGCCACGCCTCATGTGCCACTTGCCAGGGCCCGGCCCCC 1998
Query 1969 ACAGATTGCCTCAGCTGCCCCAGCCACGCCTCCTTGGACCCTGTGGAGCAGACTTGCTCCCGGCAAAGCCAGAG 2042
|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACAGACTGCCTCAGCTGCCCCAGCCATGCCTCCCTGGACCCAGTGGAGCAGACCTGCTCCCGGCAAAGCCAGAG 2072
Query 2043 CAGCCGAGAGTCCCCGCCACAGCAGCAGCCACCTCGGCTGCCCCCGGAGGTGGAGGCGGGGCAACGGCTGCGGG 2116
||||||.|||||.|.|||.|||||||||||.|||...||||.|||.|||||||||..||.||..|||||||.||
Sbjct 2073 CAGCCGGGAGTCTCGGCCTCAGCAGCAGCCTCCTGCACTGCGCCCTGAGGTGGAGATGGAGCCCCGGCTGCAGG 2146
Query 2117 CAGGGCTGCTGCCCTCACACCTGCCTGAGGTGGTGGCCGGCCTCAGCTGCGCCT--TCATCGTGCTGGTCTTCG 2188
|.|| |.||.||||.||||||||.|||||..||||||||||||||| |||| ||||||||||..||||.|
Sbjct 2147 CTGG---GTTGGCCTCTCACCTGCCCGAGGTCCTGGCCGGCCTCAGCT--GCCTTATCATCGTGCTCATCTTTG 2215
Query 2189 TCACTGTCTTCCTGGTCCTGCAGCTGCGCTCTGGCTTTAGTTTTCGGGGGGTGAAGGTGTACACCATGGACCGT 2262
.||..|||||||||.|||||||.|.|.|.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2216 GCATCGTCTTCCTGTTCCTGCATCGGTGTTCGGGCTTCAGCTTCCGGGGAGTGAAAGTGTACACCATGGACCGC 2289
Query 2263 GGCCTCATCTCCTACAAGGGGCTGCCCCCTGAAGCCTGGCAGGAGGAGTGCCCGTCTGACTCAGAAGAGGACGA 2336
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 2290 GGCCTCATCTCCTACAAGGGGCTGCCCCCTGAAGCCTGGCAGGAGGAGTGCCCATCGGACTCAGAGGAGGACGA 2363
Query 2337 GGGCCGGGGCGAGAGGACCGCCTTTATCAAAGACCAGAGCGCCCTC 2382
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2364 GGGCCGGGGCGAGAGGACCGCCTTCATCAAAGACCAGAGCGCCCTT 2409