Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06700
• Subject: XM_017321454.1
• Aligned Length: 1903
• Identities: 1680
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGGAGTCGCCAACAAAGGAGATTGAAGAATTTGAGAGCAACTCTCTGAAATACCTGCAACCGGAACAGATCGA  74
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTCTCCAACCAAGGAAATTGAAGAATTCGAGAGCAACTCTCTGAAACACCTGCAACCTGAGCAGATCGA  74

Query   75  GAAAATCTGGCTTCGGCTCCGCGGGCTGAGGAAATATAAGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTTGGTCAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GAAAATCTGGCTTCGGCTCCGCGGGCTGAGGAAATATAAGAAAACGTCCCAGAGGTTACGGTCTTTGGTCAAGC  148

Query  149  AATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCT  222
            |||||||..||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATTAGAACGAGGAGAGGCCTCTGTGGTAGACCTTAAGAAGAATCTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCT  222

Query  223  GTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCC  296
            ||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GTATATATTGATGAAACAAGGCGACTGCTGGATACAGAGGATGAGCTTAGTGACATTCAATCAGATGCTGTGCC  296

Query  297  TTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGA  370
            |||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  297  TTCAGAAGTTCGGGATTGGCTGGCCTCCACCTTCACACGGCAGATGGGGATGATGCTTAGGAGAAGTGATGAGA  370

Query  371  AGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCA  444
            |||||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  AGCCCAGGTTCAAGAGCATCGTCCATGCGGTGCAAGCTGGGATATTTGTGGAAAGAATGTACAGACGGACATCA  444

Query  445  AACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCATTTGACGT  518
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|.||||||.||.||.||
Sbjct  445  AACATGGTTGGGCTGAGCTATCCACCGGCTGTAATCGATGCATTGAAGGATGTGGATACGTGGTCCTTCGATGT  518

Query  519  CTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATC  592
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGAGATCATGCACTGAAGTTCATTTTCTATGAATTACTCACACGTTATGACC  592

Query  593  TGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAG  666
            |||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  TGATCAGCCGTTTTAAGATACCGATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTCGAAGTGGGTTACAGCAAG  666

Query  667  CACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGAC  740
            |||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CACAAAAATCCTTACCATAACCTGATGCATGCAGCTGACGTCACACAGACTGTGCATTACCTCCTTTATAAGAC  740

Query  741  AGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGC  814
            ||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  741  AGGAGTAGCAAACTGGCTGACAGAGCTGGAGATCTTTGCAATAATCTTTTCGGCTGCCATCCATGACTATGAAC  814

Query  815  ATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTA  888
            ||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  ATACTGGAACTACAAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCAGATCCAGCTATCCTGTACAATGACAGATCTGTC  888

Query  889  CTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCT  962
            ||||||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||.||.|||||||
Sbjct  889  CTGGAGAACCACCACCTGAGTGCAGCCTACCGCCTTCTGCAGGAAGACGAAGAGATGAATATTCTGGTTAACCT  962

Query  963  CTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  963  CTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACTTTGGTTATTGAGATGGTAATGGCCACAGATATGTCCTGTCATT  1036

Query 1037  TCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTT  1110
            ||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  TCCAGCAAATCAAAGCCATGAAGACAGCCCTGCAGCAACCAGAAGCAATTGAGAAGCCGAAAGCCTTATCCCTC  1110

Query 1111  ATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCT  1184
            |||.|.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  ATGTTACACACAGCAGACATCAGTCATCCTGCGAAAGCATGGGACCTGCACCACCGCTGGACCATGTCTCTCCT  1184

Query 1185  GGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGT  1258
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1185  GGAGGAGTTCTTTAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCATTTTCTCCTCTTTGTGACAGAAAGT  1258

Query 1259  CCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGAC  1332
            |.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  CAACCATGGTTGCTCAGTCACAAGTGGGTTTTATTGACTTCATTGTGGAGCCCACCTTCACTGTGCTCACGGAC  1332

Query 1333  ATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAG  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||.||||||||||||||.||||||.|.||.||
Sbjct 1333  ATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATTGACGAAAGCTCCCAGACTGGTGGGACAGGGCAGAGGAGATCAAG  1406

Query 1407  TTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGA  1480
            ||||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||||||||||..|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1407  TTTGAACAGCATCAACTCATCAGATGCAAAGCGATCCGGTGTCAAGAGTTCTGGGTCAGATGGAAGTGCTCCCA  1480

Query 1481  TCAACAATTCTGTCATCTCC-GTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCG  1553
            |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1481  TCAACAATTCTGTCAT-TCCTGTTGACTATAAGAGTTTTAAAGCCACTTGGACTGAGGTGGTGCAGATCAATCG  1553

Query 1554  GGAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCATGGCCG  1627
            ||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.|
Sbjct 1554  GGAGCGGTGGCGAGCCAAGGTACCCAAAGAAGAAAAAGCCAAGAAGGAAGCTGAAGAGAAGGCTCGCCTGGCTG  1627

Query 1628  CAGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAG  1701
            |.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.|..||||||..|||||||||
Sbjct 1628  CTGAGGAAAAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAAGCTGAACAAGGCACAACCAGCAAAGGCGAGAAAAAG  1701

Query 1702  ACGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAATTC  1775
            ||.||.||||||.|.||.|.||||||||||||||||||      |||..||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1702  ACATCAGGAGAAGCCAAAAGTCAAGTCAATGGAACACG------CAAGGGTGATAACCCTCGTGGGAAGAACTC  1769

Query 1776  CAAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGA  1849
            |||||..||.|||   .||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1770  CAAAGGAGAAAAG---GCAGGCGAAAAGCAGCAGAACGGTGACTTGAAAGACGGTAAAAATAAGGCAGACAAGA  1840

Query 1850  AGGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGATTCACAAGAG  1902
            ||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||.||.|.|||
Sbjct 1841  AGGATCACTCCAACACCGGAAATGAGTCAAAGAAAACAGATGATCCAGAGGAG  1893