Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06722
• Subject: NM_001271822.2
• Aligned Length: 1170
• Identities: 1127
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ------------------------------------------ATGGATGTTCTCGCAGAAGCAAATGGCACCTT  32
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGCGGCGCAGAGCCTCCCGGGCCACAGGTCTGCCATCATGGATGTTCTCGCAGAAGCAAATGGCACCTT  74

Query   33  TGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAAAGACAACTCGAAGAATGTGTTTTTCTCACCCATGAGCATGTCCT  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAAAGACAACTCGAAGAATGTGTTTTTCTCACCCATGAGCATGTCCT  148

Query  107  GTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAAAGGGAAACACCGCTGCACAGATGGCCCAGATACTTTCTTTCAAT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAAAGGGAAACACCGCTGCACAGATGGCCCAGATACTTTCTTTCAAT  222

Query  181  AAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTCTCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCA  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTCTCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCA  296

Query  255  GTACTTGCTTAGGGTGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGTCTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCT  328
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTACTTGCTTAGGATGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGTCTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCT  370

Query  329  GCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTTATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATA  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTTATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATA  444

Query  403  AACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGAGTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGAC  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGAGTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGAC  518

Query  477  AAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACTGGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGG  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACTGGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGG  592

Query  551  AGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTGCAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAG  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTGCAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAG  666

Query  625  ACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCCATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCAT  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCCATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCAT  740

Query  699  GCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAGAACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGA  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAGAACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGA  814

Query  773  GGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTCCCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATG  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTCCCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATG  888

Query  847  GAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGAGCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCA  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGAGCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCA  962

Query  921  GACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTGTGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAG  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTGTGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAG  1036

Query  995  CCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTCGTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTT  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTCGTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTT  1110

Query 1069  TTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTGCGGCCGCTTTTCCTCTCCG  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTGCGGCCGCTTTTCCTCTCCG  1170