Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06722
• Subject: NM_001271823.1
• Aligned Length: 1185
• Identities: 1127
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGATGTTCTCGCAGA  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTCAAGGCAAAGAGGAAACTTTAACTACAAATTGGCATTTAAGTCTGCCATCATGGATGTTCTCGCAGA  74

Query   18  AGCAAATGGCACCTTTGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAAAGACAACTCGAAGAATGTGTTTTTCTCAC  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCAAATGGCACCTTTGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAAAGACAACTCGAAGAATGTGTTTTTCTCAC  148

Query   92  CCATGAGCATGTCCTGTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAAAGGGAAACACCGCTGCACAGATGGCCCAG  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGAGCATGTCCTGTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAAAGGGAAACACCGCTGCACAGATGGCCCAG  222

Query  166  ATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTCTCTTCTCACCGAAGTGAA  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTCTCTTCTCACCGAAGTGAA  296

Query  240  CAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGGTGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGTCTTGTGATTTCCTCTCAT  313
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGATGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGTCTTGTGATTTCCTCTCAT  370

Query  314  CTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTTATCAGCGCCGTAGAGAAG  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTTATCAGCGCCGTAGAGAAG  444

Query  388  TCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGAGTTGCTCTCTCCGGGCTC  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGAGTTGCTCTCTCCGGGCTC  518

Query  462  AGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACTGGGATGAACAGTTTGACA  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACTGGGATGAACAGTTTGACA  592

Query  536  AGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTGCAAATGATGTTTAAGCAA  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTGCAAATGATGTTTAAGCAA  666

Query  610  TCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCCATATGTTGGCAAGGAACT  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCCATATGTTGGCAAGGAACT  740

Query  684  GAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAGAACTCACTTACGAGAAGT  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAGAACTCACTTACGAGAAGT  814

Query  758  TCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTCCCGCGGTTTAAACTAGAG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTCCCGCGGTTTAAACTAGAG  888

Query  832  GAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGAGCTGGGCAAGGCAGACTT  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGAGCTGGGCAAGGCAGACTT  962

Query  906  CTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTGTGGAGGTCAATGAGGAAG  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTGTGGAGGTCAATGAGGAAG  1036

Query  980  GCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTCGTCCCCCGCTTCTGCGCC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTCGTCCCCCGCTTCTGCGCC  1110

Query 1054  GACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTGCGGCCGCTTTTCCTCTCC  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTGCGGCCGCTTTTCCTCTCC  1184

Query 1128  G  1128
            |
Sbjct 1185  G  1185