Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06722
• Subject: XM_011514672.1
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1127
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCTGTCCATGTAAACAGAACTTCCTCCATCATGCAACCAAGATCACCACGTGCACAGTTCACCGTAGGTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACTCTCCTACAAGACTCCAACGCTGCCACTGACCTAACAGGAGGTGGAGCTCAGGCGGTGATGTTCGCTCACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCTGCTCACCTCCTGCTGCGTGGCCCAGTTCCTAACAGACCACAGACGGATCTGCTGGGGACTCCTGCATATA  222

Query    1  ------------ATGGATGTTCTCGCAGAAGCAAATGGCACCTTTGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAA  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTCTGCCATCATGGATGTTCTCGCAGAAGCAAATGGCACCTTTGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAA  296

Query   63  AGACAACTCGAAGAATGTGTTTTTCTCACCCATGAGCATGTCCTGTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAA  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACAACTCGAAGAATGTGTTTTTCTCACCCATGAGCATGTCCTGTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAA  370

Query  137  AGGGAAACACCGCTGCACAGATGGCCCAGATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAG  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGGAAACACCGCTGCACAGATGGCCCAGATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAG  444

Query  211  GGCTTCCAGTCTCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGGTGGCCAACAGGCTCTT  284
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTTCCAGTCTCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGATGGCCAACAGGCTCTT  518

Query  285  TGGGGAAAAGTCTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGG  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGGAAAAGTCTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGG  592

Query  359  AGCTTGACTTTATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGT  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTTGACTTTATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGT  666

Query  433  AAAATTGCGGAGTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTT  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAATTGCGGAGTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTT  740

Query  507  CAGAGGAAACTGGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGAGGAAACTGGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGG  814

Query  581  AGAAACCTGTGCAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAACCTGTGCAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATC  888

Query  655  TTGGTGCTTCCATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAAC  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGTGCTTCCATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAAC  962

Query  729  GGTGGAGAAAGAACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTGGAGAAAGAACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGG  1036

Query  803  AAGTGTCCCTCCCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACT  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGTGTCCCTCCCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACT  1110

Query  877  GATGCCTTCGAGCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCA  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATGCCTTCGAGCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCA  1184

Query  951  CAAGTCTTTTGTGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGT  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGTCTTTTGTGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGT  1258

Query 1025  GTGCCAGATTCGTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGCCAGATTCGTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGG  1332

Query 1099  ATTCTCTTCTGCGGCCGCTTTTCCTCTCCG  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTCTCTTCTGCGGCCGCTTTTCCTCTCCG  1362