Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06722
• Subject: XM_011514676.2
• Aligned Length: 1129
• Identities: 988
• Gaps: 134

Alignment

Query    1  ATGGATGTTCTCGCAGAAGCAAATGGCACCTTTGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAAAGACAACTCGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAATGTGTTTTTCTCACCCATGAGCATGTCCTGTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAAAGGGAAACACCG  148
                                     |||||||||       ||||                   |.|||||...
Sbjct    1  -------------------------ATGTCCTGT-------CCAT-------------------GTAAACAGAA  23

Query  149  CTGCACAGATGGC-CCAGATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTC  221
            ||.|        | |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   24  CTTC--------CTCCATATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTC  89

Query  222  TCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGGTGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGT  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   90  TCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGATGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGT  163

Query  296  CTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTT  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  164  CTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTT  237

Query  370  ATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238  ATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGA  311

Query  444  GTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  GTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACT  385

Query  518  GGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTG  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  386  GGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTG  459

Query  592  CAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  CAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCC  533

Query  666  ATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534  ATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAG  607

Query  740  AACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  AACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTC  681

Query  814  CCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  682  CCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGA  755

Query  888  GCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  GCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTG  829

Query  962  TGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTC  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  TGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTC  903

Query 1036  GTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTG  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904  GTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTG  977

Query 1110  CGGCCGCTTTTCCTCTCCG  1128
            |||||||||||||||||||
Sbjct  978  CGGCCGCTTTTCCTCTCCG  996