Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06722
- Subject:
- XM_017010941.1
- Aligned Length:
- 1129
- Identities:
- 988
- Gaps:
- 134
Alignment
Query 1 ATGGATGTTCTCGCAGAAGCAAATGGCACCTTTGCCTTAAACCTTTTGAAAACGCTGGGTAAAGACAACTCGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAATGTGTTTTTCTCACCCATGAGCATGTCCTGTGCCCTGGCCATGGTCTACATGGGGGCAAAGGGAAACACCG 148
||||||||| |||| |.|||||...
Sbjct 1 -------------------------ATGTCCTGT-------CCAT-------------------GTAAACAGAA 23
Query 149 CTGCACAGATGGC-CCAGATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTC 221
||.| | |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 CTTC--------CTCCATATACTTTCTTTCAATAAAAGTGGCGGTGGTGGAGACATCCACCAGGGCTTCCAGTC 89
Query 222 TCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGGTGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGT 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 TCTTCTCACCGAAGTGAACAAGACTGGCACGCAGTACTTGCTTAGGATGGCCAACAGGCTCTTTGGGGAAAAGT 163
Query 296 CTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTT 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 CTTGTGATTTCCTCTCATCTTTTAGAGATTCCTGCCAAAAATTCTACCAAGCAGAGATGGAGGAGCTTGACTTT 237
Query 370 ATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGA 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 ATCAGCGCCGTAGAGAAGTCCAGAAAACACATAAACACCTGGGTAGCTGAAAAGACAGAAGGTAAAATTGCGGA 311
Query 444 GTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACT 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 GTTGCTCTCTCCGGGCTCAGTGGATCCATTGACAAGGCTGGTTCTGGTGAATGCTGTCTATTTCAGAGGAAACT 385
Query 518 GGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTG 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 GGGATGAACAGTTTGACAAGGAGAACACCGAGGAGAGACTGTTTAAAGTCAGCAAGAATGAGGAGAAACCTGTG 459
Query 592 CAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCC 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CAAATGATGTTTAAGCAATCTACTTTTAAGAAGACCTATATAGGAGAAATATTTACCCAAATCTTGGTGCTTCC 533
Query 666 ATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAG 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 ATATGTTGGCAAGGAACTGAATATGATCATCATGCTTCCGGACGAGACCACTGACTTGAGAACGGTGGAGAAAG 607
Query 740 AACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTC 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 AACTCACTTACGAGAAGTTCGTAGAATGGACGAGGCTGGACATGATGGATGAAGAGGAGGTGGAAGTGTCCCTC 681
Query 814 CCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 CCGCGGTTTAAACTAGAGGAAAGCTACGACATGGAGAGTGTCCTGCGCAACCTGGGCATGACTGATGCCTTCGA 755
Query 888 GCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTG 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 GCTGGGCAAGGCAGACTTCTCTGGAATGTCCCAGACAGACCTGTCTCTGTCCAAGGTCGTGCACAAGTCTTTTG 829
Query 962 TGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTC 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 TGGAGGTCAATGAGGAAGGCACGGAGGCTGCAGCCGCCACAGCTGCCATCATGATGATGCGGTGTGCCAGATTC 903
Query 1036 GTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTG 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 904 GTCCCCCGCTTCTGCGCCGACCACCCCTTCCTTTTCTTCATCCAGCACAGCAAGACCAACGGGATTCTCTTCTG 977
Query 1110 CGGCCGCTTTTCCTCTCCG 1128
|||||||||||||||||||
Sbjct 978 CGGCCGCTTTTCCTCTCCG 996