Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06728
- Subject:
- NM_001242466.2
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 1082
- Gaps:
- 279
Alignment
Query 1 ATGTACAATACTGTTTGGAATATGGAAGACCTGGATTTAGAATATGCCAAGACAGATATAAATTGTGGCACAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTGATGTTTTATATAGAAATGGACCCACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATAC 296
|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------ATGCATGGTGATTATAC 17
Query 297 TCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 TCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTG 91
Query 371 ACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 ACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCC 165
Query 445 AAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 AAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA 239
Query 519 AGCTGTAGGGAAAAAATTACATAAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATG 592
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 AGCTGTAGGGAAAAAATTACATGAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATG 313
Query 593 AAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 AAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA 387
Query 667 ATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 ATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAA 461
Query 741 TGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 TGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTA 535
Query 815 GAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 GAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATT 609
Query 889 AAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 AAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCA 683
Query 963 AAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 AAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATT 757
Query 1037 TGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 TGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGG 831
Query 1111 AAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 AAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGG 905
Query 1185 CGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 CGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCT 979
Query 1259 CTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 CTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTA 1053
Query 1333 GCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA 1362
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 GCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA 1083