Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06728
- Subject:
- XM_017009586.1
- Aligned Length:
- 1913
- Identities:
- 1329
- Gaps:
- 565
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGTGAGTTACTATTCCTTACAGCAAAAGAACCTCATCAGAACCGCAGGCTGGAAAGAGCTTTGACTCTCCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGATCTTGCAGAGCAGTTTGCCCCTCCTGACATTGCCCCGCCTCTTCTTATCAAGCTCGTGGAAGCCATTGAAA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGAAAGGTCTGGAATGTTCAACTCTATACAGAACACAGAGCTCCAGCAACCTGGCAGAATTACGACAGCTTCTT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GATTGTGATACACCCTCCGTGGACTTGGAAATGATCGATGTGCACGTTTTGGCTGACGCTTTCAAACGCTATCT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CCTGGACTTACCAAATCCTGTCATTCCAGCAGCCGTTTACAGTGAAATGATTTCTTTAGCTCCAGAAGTACAAA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GCTCCGAAGAATATATTCAGCTATTGAAGAAGCTTATTAGGTCGCCTAGCATACCTCATCAGTATTGGCTTACG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGTACAA---TA 10
||| ||| ||
Sbjct 445 CTTCAGTATTTGTTAAAACATTTCTTCAAGCTCTCTCAAACCTCCAGCAAAAATCTGTTGAATG--CAAGAGTA 516
Query 11 CTGTTTGGAATATGGAAGACCT-GGATTT--AGAATATGCCA--AGACAGAT---ATAA-ATTGTGGCACAGAC 75
||.|.||.||| |...||.||| .|.||| |||.|.| || ||.|||.| |||| |.|| .|.||
Sbjct 517 CTCTCTGAAAT-TTTCAGCCCTATGCTTTTCAGATTCT--CAGCAGCCAGCTCTGATAATACTG-----AAAAC 582
Query 76 TTGAT----GTTTTATATAGA-----------------AATGGA-----------CC--CACCAGCACTGCCTC 115
.|.|| || |||||| |||||| || |||||||||||||||
Sbjct 583 CTCATAAAAGT----TATAGAAATTTTAATCTCAACTGAATGGAATGAACGACAGCCTGCACCAGCACTGCCTC 652
Query 116 CTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACAACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGG 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 CTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACAACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGG 726
Query 190 TACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAATGAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACG 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 TACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAATGAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACG 800
Query 264 AGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATACTCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAA 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 801 AGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATACTCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAA 874
Query 338 TATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTGACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCAC 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 TATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTGACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCAC 948
Query 412 TACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCCAAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCA 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 TACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCCAAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCA 1022
Query 486 ACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGAAGCTGTAGGGAAAAAATTACATAAATATAACACTCAGTTTC 559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1023 ACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGAAGCTGTAGGGAAAAAATTACATGAATATAACACTCAGTTTC 1096
Query 560 AAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGG 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 AAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGG 1170
Query 634 ACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAAATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAA 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 ACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAAATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAA 1244
Query 708 AGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAATGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGT 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 AGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAATGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGT 1318
Query 782 TGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTAGAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAG 855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTAGAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAG 1392
Query 856 TATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATTAAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATA 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 TATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATTAAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATA 1466
Query 930 CTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCAAAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAG 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1467 CTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCAAAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAG 1540
Query 1004 ACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATTTGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGC 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 ACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATTTGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGC 1614
Query 1078 AACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGGAAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACA 1151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 AACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGGAAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACA 1688
Query 1152 GGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGGCGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCT 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689 GGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGGCGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCT 1762
Query 1226 ATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCTCTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTT 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1763 ATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCTCTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTT 1836
Query 1300 GTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTAGCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA 1362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 GTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTAGCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA 1899
