Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06747
• Subject: NR_046402.2
• Aligned Length: 3436
• Identities: 3216
• Gaps: 218

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------ATGGATGGCAAGCGGCGGCCAGGCCCAGG  29
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GTCACGGCGGCGTAGGCTGTGGCGGGAAACGCTGTTTGAAGCGGGATGGATGGCAAGCGGCGGCCAGGCCCAGG  74

Query   30  GCCCGGGGTGCCCCCAAAGCGGGCCCGTGGGGGCCTCTGGGATGATGATGATGCACCTCGGCCATCCCAATTCG  103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCGGGGTGCCCCCAAAGCGGGCCCGTGGGGGCCTCTGGGATGATGATGATGCACCTCGGCCATCCCAATTCG  148

Query  104  AGGAGGACCTGGCACTGATGGAGGAGATGGAGGCAGAACACAGGCTGCAGGAGCAGGAGGAGGAGGAGCTGCAG  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGGACCTGGCACTGATGGAGGAGATGGAGGCAGAACACAGGCTGCAGGAGCAGGAGGAGGAGGAGCTGCAG  222

Query  178  TCAGTCCTGGAGGGGGTTGCAGACGGGCAGGTCCCACCATCAGCCATAGATCCTCGCTGGCTTCGGCCCACACC  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGTCCTGGAGGGGGTTGCAGACGGGCAGGTCCCACCATCAGCCATAGATCCTCGCTGGCTTCGGCCCACACC  296

Query  252  ACCAGCGCTGGACCCCCAGACAGAGCCCCTCATCTTCCAACAGTTGGAGATTGACCATTATGTGGGCCCAGCAC  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  ACCAGCGCTGGACCCCCAGACAGAGCCCCTCATCTTCCAACAGTTGGAGATTGACCATTATGTGGGCCCAGCGC  370

Query  326  AGCCTGTGCCTGGGGGGCCCCCACCATCCCACGGCTCCGTGCCTGTGCTCCGCGCCTTCGGGGTCACCGATGAG  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCTGTGCCTGGGGGGCCCCCACCATCCCGCGGCTCCGTGCCTGTGCTCCGCGCCTTCGGGGTCACCGATGAG  444

Query  400  GGGTTCTCTGTCTGCTGCCACATCCACGGCTTCGCTCCCTACTTCTACACCCCAGCGCCCCCTGGTTTCGGGCC  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGTTCTCTGTCTGCTGCCACATCCACGGCTTCGCTCCCTACTTCTACACCCCAGCGCCCCCTGGTTTCGGGCC  518

Query  474  CGAGCACATGGGTGACCTGCAACGGGAGCTGAACTTGGCCATCAGCCGGGACAGTCGCGGGGGGAGGGAGCTGA  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAGCACATGGGTGACCTGCAACGGGAGCTGAACTTGGCCATCAGCCGGGACAGTCGCGGGGGGAGGGAGCTGA  592

Query  548  CTGGGCCGGCCGTGCTGGCTGTGGAACTGTGCTCCCGAGAGAGCATGTTTGGGTACCACGGGCACGGCCCCTCC  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGGGCCGGCCGTGCTGGCTGTGGAACTGTGCTCCCGAGAGAGCATGTTTGGGTACCACGGGCACGGCCCCTCC  666

Query  622  CCGTTCCTGCGCATCACCGTGGCGCTGCCGCGCCTCGTGGCCCCGGCCCGCCGTCTCCTGGAACAGGGCATCCG  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCGTTCCTGCGCATCACCGTGGCGCTGCCGCGCCTCGTGGCCCCGGCCCGCCGTCTCCTGGAACAGGGCATCCG  740

Query  696  TGTGGCAGGCCTGGGCACGCCCAGCTTCGCGCCCTACGAGGCCAACGTCGACTTTGAGATCCGGTTCATGGTGG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGCAGGCCTGGGCACGCCCAGCTTCGCGCCCTACGAGGCCAACGTCGACTTTGAGATCCGGTTCATGGTGG  814

Query  770  ACACGGACATCGTCGGCTGCAACTGGCTGGAGCTCCCAGCTGGGAAATACGCCCTGAGGCTGAAGGAGAAGGCT  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACACGGACATCGTCGGCTGCAACTGGCTGGAGCTCCCAGCTGGGAAATACGCCCTGAGGCTGAAGGAGAAGGCT  888

Query  844  ACGCAGTGCCAGCTGGAGGCGGACGTGCTGTGGTCTGACGTGGTCAGTCACCCACCGGAAGGGCCATGGCAGCG  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACGCAGTGCCAGCTGGAGGCGGACGTGCTGTGGTCTGACGTGGTCAGTCACCCACCGGAAGGGCCATGGCAGCG  962

Query  918  CATTGCGCCCTTGCGCGTGCTCAGCTTCGATATCGAGTGCGCCGGCCGCAAAGGCATCTTCCCTGAGCCTGAGC  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATTGCGCCCTTGCGCGTGCTCAGCTTCGATATCGAGTGCGCCGGCCGCAAAGGCATCTTCCCTGAGCCTGAGC  1036

Query  992  GGGACCCTGTCATCCAGATCTGCTCGCTGGGCCTGCGCTGGGGGGAGCCGGAGCCCTTCCTACGCCTGGCGCTC  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGACCCTGTCATCCAGATCTGCTCGCTGGGCCTGCGCTGGGGGGAGCCGGAGCCCTTCCTACGCCTGGCGCTC  1110

Query 1066  ACCCTGCGGCCCTGTGCCCCCATCCTGGGTGCCAAGGTGCAGAGCTACGAGAAGGAGGAGGACCTGCTGCAGGC  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCTGCGGCCCTGTGCCCCCATCCTGGGTGCCAAGGTGCAGAGCTACGAGAAGGAGGAGGACCTGCTGCAGGC  1184

Query 1140  CTGGTCCACCTTCATCCGTATCATGGACCCCGACGTGATCACCGGTTACAACATCCAGAACTTCGACCTTCCGT  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGGTCCACCTTCATCCGTATCATGGACCCCGACGTGATCACCGGTTACAACATCCAGAACTTCGACCTTCCGT  1258

Query 1214  ACCTCATCTCTCGGGCCCAGACCCTCAAGGTACAAACATTCCCTTTCCTGGGCCGTGTGGCCGGCCTTTGCTCC  1287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCTCATCTCTCGGGCCCAGACCCTCAAGGTACAAACATTCCCTTTCCTGGGCCGTGTGGCCGGCCTTTGCTCC  1332

Query 1288  AACATCCGGGACTCTTCATTCCAGTCCAAGCAGACGGGCCGGCGGGACACCAAGGTTGTCAGCATGGTGGGCCG  1361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACATCCGGGACTCTTCATTCCAGTCCAAGCAGACGGGCCGGCGGGACACCAAGGTTGTCAGCATGGTGGGCCG  1406

Query 1362  CGTGCAGATGGACATGCTGCAGGTGCTGCTGCGGGAGTACAAGCTCCGCTCCTACACGCTCAATGCCGTGAGCT  1435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGTGCAGATGGACATGCTGCAGGTGCTGCTGCGGGAGTACAAGCTCCGCTCCTACACGCTCAATGCCGTGAGCT  1480

Query 1436  TCCACTTCCTGGGCGAGCAGAAGGAGGACGTGCAGCACAGCATCATCACCGACCTGCAGAATGGGAACGACCAG  1509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCACTTCCTGGGCGAGCAGAAGGAGGACGTGCAGCACAGCATCATCACCGACCTGCAGAATGGGAACGACCAG  1554

Query 1510  ACCCGCCGCCGCCTGGCTGTGTACTGCCTGAAGGATGCCTACCTGCCACTGCGGCTGCTGGAGCGGCTCATGGT  1583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCCGCCGCCGCCTGGCTGTGTACTGCCTGAAGGATGCCTACCTGCCACTGCGGCTGCTGGAGCGGCTCATGGT  1628

Query 1584  GCTGGTGAACGCCGTGGAGATGGCGAGGGTCACTGGCGTGCCCCTCAGCTACCTGCTCAGTCGTGGCCAGCAGG  1657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTGGTGAACGCCGTGGAGATGGCGAGGGTCACTGGCGTGCCCCTCAGCTACCTGCTCAGTCGTGGCCAGCAGG  1702

Query 1658  TCAAGGTCGTATCCCAGCTGTTGCGGCAGGCCATGCACGAGGGGCTGCTGATGCCCGTGGTGAAGTCAGAGGGC  1731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCAAGGTCGTATCCCAGCTGTTGCGGCAGGCCATGCACGAGGGGCTGCTGATGCCCGTGGTGAAGTCAGAGGGC  1776

Query 1732  GGCGAGGACTACACGGGAGCCACTGTCATCGAGCCCCTCAAAGGGTACTACGACGTCCCCATCGCCACCCTGGA  1805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGCGAGGACTACACGGGAGCCACTGTCATCGAGCCCCTCAAAGGGTACTACGACGTCCCCATCGCCACCCTGGA  1850

Query 1806  CTTCTCCTCGCTGTACCCGTCCATCATGATGGCCCACAACCTGTGTTACACCACGCTCCTTCGGCCCGGGACTG  1879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTCTCCTCGCTGTACCCGTCCATCATGATGGCCCACAACCTGTGTTACACCACGCTCCTTCGGCCCGGGACTG  1924

Query 1880  CACAGAAACTGGGCCTGACTGAGGATCAGTTCATCAGGACCCCCACCGGGGACGAGTTTGTGAAGACCTCAGTG  1953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CACAGAAACTGGGCCTGACTGAGGATCAGTTCATCAGGACCCCCACCGGGGACGAGTTTGTGAAGACCTCAGTG  1998

Query 1954  CGGAAGGGGCTGCTGCCCCAGATCCTGGAGAACCTGCTCAGTGCCCGGAAGAGGGCCAAGGCCGAGCTGGCCAA  2027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGGAAGGGGCTGCTGCCCCAGATCCTGGAGAACCTGCTCAGTGCCCGGAAGAGGGCCAAGGCCGAGCTGGCCAA  2072

Query 2028  GGAGACAGACCCCCTCCGGCGCCAGGTCCTGGATGGACGGCAGCTGGCGCTGAAGGTGAGCGCCAACTCCGTAT  2101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGAGACAGACCCCCTCCGGCGCCAGGTCCTGGATGGACGGCAGCTGGCGCTGAAGGTGAGCGCCAACTCCGTAT  2146

Query 2102  ACGGCTTCACTGGCGCCCAGGTGGGCAAGTTGCCGTGCCTGGAGATCTCACAGAGCGTCACGGGGTTCGGACGT  2175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ACGGCTTCACTGGCGCCCAGGTGGGCAAGTTGCCGTGCCTGGAGATCTCACAGAGCGTCACGGGGTTCGGACGT  2220

Query 2176  CAGATGATCGAGAAAACCAAGCAGCTGGTGGAGTCTAAGTACACAGTGGAGAATGGCTACAGCACCAGTGCCAA  2249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGATGATCGAGAAAACCAAGCAGCTGGTGGAGTCTAAGTACACAGTGGAGAATGGCTACAGCACCAGTGCCAA  2294

Query 2250  GGTGGTGTATGGTGACACTGACTCCGTCATGTGCCGATTCGGCGTGTCCTCGGTGGCTGAGGCGATGGCCCTGG  2323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGTGGTGTATGGTGACACTGACTCCGTCATGTGCCGATTCGGCGTGTCCTCGGTGGCTGAGGCGATGGCCCTGG  2368

Query 2324  GGCGGGAGGCCGCGGACTGGGTGTCAGGTCACTTCCCGTCGCCCATCCGGCTGGAGTTTGAGAAGGTCTACTTC  2397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGCGGGAGGCCGCGGACTGGGTGTCAGGTCACTTCCCGTCGCCCATCCGGCTGGAGTTTGAGAAGGTCTACTTC  2442

Query 2398  CCATACCTGCTTATCAGCAAGAAGCGCTACGCGGGCCTGCTCTTCTCCTCCCGGCCCGACGCCCACGACCGCAT  2471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCATACCTGCTTATCAGCAAGAAGCGCTACGCGGGCCTGCTCTTCTCCTCCCGGCCCGACGCCCACGACCGCAT  2516

Query 2472  GGACTGCAAGGGCCTGGAGGCCGTGCGCAGGGACAACTGCCCCCTCGTGGCCAACCTGGTCACTGCCTCACTGC  2545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGACTGCAAGGGCCTGGAGGCCGTGCGCAGGGACAACTGCCCCCTCGTGGCCAACCTGGTCACTGCCTCACTGC  2590

Query 2546  GCCGCCTGCTCATCGACCGAGACCCTGAGGGCGCGGTGGCTCACGCACAGGACGTCATCTCGGACCTGCTGTGC  2619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GCCGCCTGCTCATCGACCGAGACCCTGAGGGCGCGGTGGCTCACGCACAGGACGTCATCTCGGACCTGCTGTGC  2664

Query 2620  AACCGCATCGATATCTCCCAGCTGGTCATCACCAAGGAGCTGACCCGCGCGGCCTCCGACTATGCCGGCAAGCA  2693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AACCGCATCGATATCTCCCAGCTGGTCATCACCAAGGAGCTGACCCGCGCGGCCTCCGACTATGCCGGCAAGCA  2738

Query 2694  GGCCCACGTGGAGCTGGCCGAGAGGATGAGGAAGCGGGACCCCGGGAGTGCGCCCAGCCTGGGCGACCGCGTCC  2767
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 2739  GGCCCACGTGGAGCTGGCCGA-----------------------------------------------------  2759

Query 2768  CCTACGTGATCATCAGTGCCGCCAAGGGTGTGGCCGCCTACATGAAGTCGGAGGACCCGCTGTTCGTGCTGGAG  2841
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2760  --------------------------------------------------GAGGACCCGCTGTTCGTGCTGGAG  2783

Query 2842  CACAGCCTGCCCATTGACACGCAGTACTACCTGGAGCAGCAGCTGGCCAAGCCCCTCCTGCGCATCTTCGAGCC  2915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2784  CACAGCCTGCCCATTGACACGCAGTACTACCTGGAGCAGCAGCTGGCCAAGCCCCTCCTGCGCATCTTCGAGCC  2857

Query 2916  CATCCTGGGCGAGGGCCGTGCCGAGGCTGTGCTACTGCGGGGGGACCACACGCGCTGCAAGACGGTGCTCACGG  2989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2858  CATCCTGGGCGAGGGCCGTGCCGAGGCTGTGCTACTGCGGGGGGACCACACGCGCTGCAAGACGGTGCTCACGG  2931

Query 2990  GCAAGGTGGGCGGCCTCCTGGCCTTCGCCAAACGCCGCAACTGCTGCATTGGCTGCCGCACAGTGCTCAGCCAC  3063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932  GCAAGGTGGGCGGCCTCCTGGCCTTCGCCAAACGCCGCAACTGCTGCATTGGCTGCCGCACAGTGCTCAGCCAC  3005

Query 3064  CAGGGAGCCGTGTGTGAGTTCTGCCAGCCCCGGGAGTCTGAGCTGTATCAGAAGGAGGTATCCCATCTGAATGC  3137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006  CAGGGAGCCGTGTGTGAGTTCTGCCAGCCCCGGGAGTCTGAGCTGTATCAGAAGGAGGTATCCCATCTGAATGC  3079

Query 3138  CCTGGAGGAGCGCTTCTCGCGCCTCTGGACGCAGTGCCAGCGCTGCCAGGGCAGCCTGCACGAGGACGTCATCT  3211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080  CCTGGAGGAGCGCTTCTCGCGCCTCTGGACGCAGTGCCAGCGCTGCCAGGGCAGCCTGCACGAGGACGTCATCT  3153

Query 3212  GCACCAGCCGGGACTGCCCCATCTTCTACATGCGCAAGAAGGTGCGGAAGGACCTGGAAGACCAGGAGCAGCTC  3285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154  GCACCAGCCGGGACTGCCCCATCTTCTACATGCGCAAGAAGGTGCGGAAGGACCTGGAAGACCAGGAGCAGCTC  3227

Query 3286  CTGCGGCGCTTCGGACCCCCTGGACCTGAGGCCTGG--------------------------------------  3321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct 3228  CTGCGGCGCTTCGGACCCCCTGGACCTGAGGCCTGGTGACCTTGCAAGCATCCCATGGGGCGGGGGCGGGACCA  3301

Query 3322  --------------------------------  3321
                                            
Sbjct 3302  GGGAGAATTAATAAAGTTCTGGACTTTTGCTA  3333