Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06773
- Subject:
- XM_011516398.1
- Aligned Length:
- 1254
- Identities:
- 1168
- Gaps:
- 84
Alignment
Query 1 ATGAGCATCGAGATCCCGGCGGGACTGACGGAGCTGCTGCAGGGCTTCACGGTGGAGGTGCTGAGGCACCAGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCATCGAGATCCCGGCGGGACTGACGGAGCTGCTGCAGGGCTTCACGGTGGAGGTGCTGAGGCACCAGCC 74
Query 75 CGCGGACCTGCTGGAGTTCGCTCTGCAGCACTTCACCCGCCTGCAGCAGGAGAACGAGCGCAAAGGCACCGCGC 148
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGCGGACCTGCTGGAGTTCGCGCTGCAGCACTTCACCCGCCTGCAGCAGGAGAACGAGCGCAAAGGCACCGCGC 148
Query 149 GCTTCTGCCATGAGGGCAGGACCTGGGGGGACCTGGGCGCCGCTGCCGGGGGCGGCACCCCCAGCAAGGGGGTC 222
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTTCGGCCATGAGGGCAGGACCTGGGGGGACCTGGGCGCCGCTGCCGGGGGCGGCACCCCCAGCAAGGGGGTC 222
Query 223 AACTTCGCCGAGGAGCCCATGCAGTCCGACTCCGAGGACGGGGAGGAGGAGGAGGCGGCGCCCGCGGACGCAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACTTCGCCGAGGAGCCCATGCAGTCCGACTCCGAGGACGGGGAGGAGGAGGAGGCGGCGCCCGCGGACGCAGG 296
Query 297 GGCGTTCAATGCTCCAGTAATAAACCGATTCACAAGGCGTGCCTCAGTATGTGCAGAAGCTTATAATCCTGATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCGTTCAATGCTCCAGTAATAAACCGATTCACAAGGCGTGCCTCAGTATGTGCAGAAGCTTATAATCCTGATG 370
Query 371 AAGAAGAAGATGATGCAGAGTCCAGGATTATACATCCAAAAACTGATGATCAAAGAAATAGGTTGCAAGAGGCT 444
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGAAGAAGATGATGCAGAGTCCAG------------------------------------------------- 395
Query 445 TGCAAAGACATCCTGCTGTTTAAGAATCTGGATCCGGAGCAGATGTCTCAAGTATTAGATGCCATGTTTGAAAA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 -----------------------------------GGAGCAGATGTCTCAAGTATTAGATGCCATGTTTGAAAA 434
Query 519 ATTGGTCAAAGATGGGGAGCATGTAATTGATCAAGGTGACGATGGTGACAACTTTTATGTAATTGATAGAGGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 ATTGGTCAAAGATGGGGAGCATGTAATTGATCAAGGTGACGATGGTGACAACTTTTATGTAATTGATAGAGGCA 508
Query 593 CATTTGATATTTATGTGAAATGTGATGGTGTTGGAAGATGTGTTGGTAACTATGATAATCGTGGGAGTTTCGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 CATTTGATATTTATGTGAAATGTGATGGTGTTGGAAGATGTGTTGGTAACTATGATAATCGTGGGAGTTTCGGC 582
Query 667 GAACTGGCCTTAATGTACAATACACCCAGAGCAGCTACAATCACTGCTACCTCTCCTGGTGCTCTGTGGGGTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 GAACTGGCCTTAATGTACAATACACCCAGAGCAGCTACAATCACTGCTACCTCTCCTGGTGCTCTGTGGGGTTT 656
Query 741 GGACAGGGTAACCTTCAGGAGAATAATTGTGAAAAACAATGCCAAAAAGAGAAAAATGTATGAAAGCTTTATTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GGACAGGGTAACCTTCAGGAGAATAATTGTGAAAAACAATGCCAAAAAGAGAAAAATGTATGAAAGCTTTATTG 730
Query 815 AGTCACTGCCATTCCTTAAATCTTTGGAGTTTTCTGAACGCCTGAAAGTAGTAGATGTGATAGGCACCAAAGTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 AGTCACTGCCATTCCTTAAATCTTTGGAGTTTTCTGAACGCCTGAAAGTAGTAGATGTGATAGGCACCAAAGTA 804
Query 889 TACAACGATGGAGAACAAATCATTGCTCAGGGAGATTCGGCTGATTCTTTTTTCATTGTAGAATCTGGAGAAGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 TACAACGATGGAGAACAAATCATTGCTCAGGGAGATTCGGCTGATTCTTTTTTCATTGTAGAATCTGGAGAAGT 878
Query 963 GAAAATTACTATGAAAAGAAAGGGTAAATCAGAAGTGGAAGAGAATGGTGCAGTAGAAATCGCTCGATGCTCGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 GAAAATTACTATGAAAAGAAAGGGTAAATCAGAAGTGGAAGAGAATGGTGCAGTAGAAATCGCTCGATGCTCGC 952
Query 1037 GGGGACAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTAACTAACAAACCTCGAGCAGCTTCTGCCCACGCCATTGGGACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 GGGGACAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTAACTAACAAACCTCGAGCAGCTTCTGCCCACGCCATTGGGACT 1026
Query 1111 GTCAAATGTTTAGCAATGGATGTGCAAGCATTTGAAAGGCTTCTGGGACCTTGCATGGAAATTATGAAAAGGAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 GTCAAATGTTTAGCAATGGATGTGCAAGCATTTGAAAGGCTTCTGGGACCTTGCATGGAAATTATGAAAAGGAA 1100
Query 1185 CATCGCTACCTATGAAGAACAGTTAGTTGCCCTGTTTGGAACGAACATGGATATTGTTGAACCCACTGCA 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 CATCGCTACCTATGAAGAACAGTTAGTTGCCCTGTTTGGAACGAACATGGATATTGTTGAACCCACTGCA 1170