Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06785
- Subject:
- NR_001296.3
- Aligned Length:
- 863
- Identities:
- 698
- Gaps:
- 122
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CTCACCTCACAGACACTCCTCTCTGGATCCTCCAGAGCTATAAAGACGGGCCTTCCACCACCAGACAGGCGCAC 74
Query 1 ---------ATGAATCCACTCCTGATCCTTACCTTTGTTGCAGCTGCTGTTGCTGCCCCCTTTGATGATGATGA 65
|||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTACCACCATGAATCCACTCCTGATCCTTGCCTTTGTGGGAGCTGCTGTTGCTGTCCCCTTTGATGATGATGA 148
Query 66 CAAGATCGTTGGGGGCTACATCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTACCACT 139
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 149 CAAGATCGTTGGGGGCTACACCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTCCCACT 222
Query 140 TCTGCGGTGGCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGTCCCGCATCCAGGTG 213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 223 TCTGCGGTGGCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGCCCCACATCCAGGTG 296
Query 214 AGACTGGGAGAGCACAACATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGAACAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCA 287
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGACTGGGAGAGCACAATATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGAGCAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCA 370
Query 288 CCCCAAATACAACAGCCGGACTCTGGACAATGACATCCTGCTGATCAAGCTCTCCTCACCTGCCGTCATCAATT 361
|||||||||||||||....|.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371 CCCCAAATACAACAGGATTATTCTGAACAATGACATCATGCTGATCAAGCTCTCCACACCTGCCGTCATCAATG 444
Query 362 CCCGCGTGTCCGCCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCTGCTGGCACCGAGTCCCTCATCTCCGGCTGGGGC 435
|||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 445 CCCATGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCTGCTGGCACCGAGTGCCTTATCTCCGGCTGGGGC 518
Query 436 AACACTCTGAGTTCTGGTGCCGACTACCCAGACGAGCTGCAGTGCCTGGATGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTGA 509
||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 519 AATACCCTGAGCTCTGGGGCCGACTACCCAGATGAGCTGCAGTGCCTGGACGCTCCTGTGCTGACCCAGGCTAA 592
Query 510 GTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAACAACATGTTCTGTGTGGGCTTCCTCGAGGGAGGCAAGGATT 583
||||.||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGTAAAGCCTCCTACCCTTTAAAGATTACCAGCAACATGTTCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATT 666
Query 584 CCTGCCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTCCAATGGAGAGCTCCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGC 657
|||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTGCCAGGGTGACTCTGGTGGCCCTGTGGTCTGCAATGGACAGCTTCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGC 740
Query 658 TGTGCCCAGAAGAACAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTACAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGC 731
|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTGCCCAGAAGAGAAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTACAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGC 814
Query 732 TGCCAACAGC--------------------------------------- 741
||||||||||
Sbjct 815 TGCCAACAGCTAAAGCCCCTGGTCACTCTGCAGTCTCTATACCAATAAA 863