Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06790
- Subject:
- NM_001031850.4
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 1195
- Gaps:
- 28
Alignment
Query 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT 74
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1 ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG 148
|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|..|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG 148
Query 149 ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC 222
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA 296
|||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||| ||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA 293
Query 297 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 367
Query 371 TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG 444
||.||||||||||.|||||||||.||||||.|||||||.|||||||..|||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 368 TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG 441
Query 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC 518
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 442 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC 515
Query 519 TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA 592
||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 516 TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 589
Query 593 ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 663
Query 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 664 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA 737
Query 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 738 CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA 811
Query 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 812 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT 885
Query 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 959
Query 963 TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT 1036
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 960 TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1033
Query 1037 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGGG 1110
||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG 1107
Query 1111 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1181
Query 1185 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTT--CA-GGAA 1255
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||.|||||||||.|||.| || ||||
Sbjct 1182 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCATGGAA 1255
Query 1256 --CAGGACA---TCTTCCTGGCCTTAATCCATTA 1284
|| |||| ||| |||
Sbjct 1256 ACCA-GACAGAGTCT--------------CAT-- 1272