Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06790
• Subject: NM_001206650.2
• Aligned Length: 1284
• Identities: 847
• Gaps: 393

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCATATAACCTGGAAAGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  149  ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC  222
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  371  TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
                                                                        |||||||||||||.
Sbjct   65  ------------------------------------------------------------TGGAGACTCCCAAA  78

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||.||..||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct   79  CCCTCCATCTCCAGCAGCAATTTCAACCCCAGGGAGGCCACGGAGGCTGTGATTTTAACCTGTGATCCTGAGAC  152

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA  592
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||
Sbjct  153  TCCAGATGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGCTGTCTGAAA  226

Query  593  ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            .|||.||||||||||..|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  CCAACAGGACCCTCTACCTATTTGGTGTCACAAACTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  300

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  374

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTCAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  448

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACGCATTGAAAACAGGATCCTCATT  522

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  596

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  1036
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  670

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            |||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  671  CAGGACAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  744

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTTTCTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  818

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAACAG  1258
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||..||||||||           ||.|
Sbjct  819  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCGTGACAGTCAGAGTCTCTG-----------ACTG  881

Query 1259  GACATCTTCCTGGCCTTAATCCATTA  1284
            |||||...||                
Sbjct  882  GACATTACCC----------------  891