Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06791
• Subject: NM_002780.5
• Aligned Length: 1286
• Identities: 914
• Gaps: 310

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.|||.|..|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGACAACTGATGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||...||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAAATATATATGGGCCTGCATACACTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAAGACGCAGGATCCTATACCTTACACA  370
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATAGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCAACTTATACCTG------------  432
            |||||||||||.|.|||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||||            
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  433  --------------------------------------------------------------------------  432
                                                                                      
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC  518

Query  433  --------------------------------------------------------------------------  432
                                                                                      
Sbjct  519  TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  433  --------------------------------------------------------------------------  432
                                                                                      
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  433  ---------------------------------------------AAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  461
                                                         ||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740

Query  462  CAACTCAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  535
            |||||.|||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA  814

Query  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888

Query  610  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCACAG  683
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.||||||||||.|.|||
Sbjct  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962

Query  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  831
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||.|.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110

Query  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTC  905
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184

Query  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG-CTCCTTCAGGA-AT  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||| ||      ||| ||
Sbjct 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGACT------GGATAT  1252

Query  978  AGGACGTCTACCTCTCATTAATCCAATA  1005
                    ||||.               
Sbjct 1253  --------TACCC---------------  1257