Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06791
• Subject: NM_021016.4
• Aligned Length: 1284
• Identities: 949
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||.||||||.||||||.||||||||||||||||||..||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCAAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGACAACTGATGGAC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||
Sbjct  149  ACGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAAGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAAATATATATGGGCCTGCATACACTGGACGAGA  296
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATACGTAGTAGATGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAAGACGCAGGATCCTATACCTTACACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATAGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCAACTTATACCT-------------  431
            ||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||             
Sbjct  371  TCGTAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGAAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  432  --------------------------------------------------------------------------  431
                                                                                      
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTATACCCCAGGGAGGACATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518

Query  432  --------------------------------------------------------------------------  431
                                                                                      
Sbjct  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGTTGTCCAAAA  592

Query  432  --------------------------------------------------------------------------  431
                                                                                      
Sbjct  593  ACAAAAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  432  --------------------------------------------GAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  461
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740

Query  462  CAACTCAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  535
            |||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814

Query  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888

Query  610  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCACAG  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||.|.|||
Sbjct  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962

Query  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  1036

Query  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCGGACTCTAACCCACCAGCAGAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110

Query  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTC  905
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184

Query  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAATAG  979
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCATGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGCTCCTTCAGGAACAG  1258

Query  980  GACGTCTACCTCTCATTAATCCAATA  1005
            |||.|||.|||..|.||||||||.||
Sbjct 1259  GACATCTTCCTGGCCTTAATCCATTA  1284