Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06791
• Subject: XM_005259065.4
• Aligned Length: 1021
• Identities: 921
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATCTTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGACAACTGATGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.|||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAAATATATATGGGCCTGCATACACTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAAGACGCAGGATCCTATACCTTACACA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATAGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCAACTTATACCTGAAGCTGCCCAAG  444
            ||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCCGAAGCTGCCCAAG  444

Query  445  CCCTACATCACCATCAACAACTCAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAG  518
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTACATCACCATCAACAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAG  518

Query  519  TGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  519  TGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTG  592

Query  593  AAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGA  666

Query  667  GATGGTGGCATGCACAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTC  740
            .||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  TATGGTGGCATCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTC  740

Query  741  ATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTC-GCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTAT  813
            |||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct  741  ATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTAT  813

Query  814  TTTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAG  887
            |.||||||||||||||..||||||||||.|.|||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  814  TCTTGGACAATTAATGAAAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAG  887

Query  888  AGGGCTCTATACTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCT  961
            .|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CGGGCTCTATGTTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCT  961

Query  962  CTGCT---------CCTTCA------GGAATAGGACGTCTACCTCTCATTAATCCAATA  1005
            |||.|         ||..||      |.||||||  ||.|                   
Sbjct  962  CTGGTAAGTGGATCCCAGCATCGTTGGCAATAGG--GTTT-------------------  999