Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06793
• Subject: XM_011526987.3
• Aligned Length: 979
• Identities: 544
• Gaps: 383

Alignment

Query   1  ------------ATGCACGCAGCAGAG-------ATCATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAG--AGCA  53
                       |.|.|.||.||||||       |.|.||||                  |.|||.||  || |
Sbjct   1  ATGTCCTTGGCAAGGGAAGCTGCAGAGAAAACATACCTTGGG------------------CGGCAAAGTAAG-A  55

Query  54  C---ATCAAATGGAAG------GGGCT-CCTGCTCACAGTGGAGACTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAAC  117
           |   |.|.||  ||||      |..|| |.||||| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  56  CTGAAACTAA--GAAGATTCCAGCACTGCATGCTC-CAATGGAGACTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAAA  126

Query 118  TTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGACTGTGATCTTAACCTGTAATCCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTGTG  191
           ||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127  TTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTGTG  200

Query 192  GTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCATAGGATGCAGCTGTCTGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTAT  265
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201  GTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTAT  274

Query 266  TTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATATGGAACTCAGGGAGTGCCAGCCGCAGTGAC  339
           |.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 275  TGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGAC  348

Query 340  CCAGTCACCCTGAATCTCCTCC----------------------------------------------------  361
           |||.||||||||||||||||||                                                    
Sbjct 349  CCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTTAAAACCCAGGGAGAA  422

Query 362  --------------------------------------------------------------------------  361
                                                                                     
Sbjct 423  TAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGA  496

Query 362  --------------------------------------------------------------------------  361
                                                                                     
Sbjct 497  GCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAAT  570

Query 362  --------------------------------------------------------------------------  361
                                                                                     
Sbjct 571  GAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAGTTACCCAGTCACCCTGAATGT  644

Query 362  -----ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTTCCCTTCAGTCACCTCTTACTATTCAGGAGAGAACCTCGACTTGT  430
                ||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||..|||||||||...||||.||||||
Sbjct 645  CCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGT  718

Query 431  CCTGCTTC-GCAGACTCTAACCCACCAGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACA  503
           |||| ||| ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719  CCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACA  791

Query 504  AAAGCTCTTTATCCCTCAAATTACTCCAAAGCATAATGGGCTCTATGCTTGCTCTGCTCGTAACTCAGCCACTG  577
           |||||||||||||||.|||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 792  AAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTG  865

Query 578  GCGAGGAAAGCTCCACATCCTTGACAATCAGAGT-----------CATTGCTCCTCCAGGATTAGGAACTTTTG  640
           ||.||||||||||||.||||.|||||.|.|.|||           ||||.|.|                     
Sbjct 866  GCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGACTGGACATTACCC---------------------  918

Query 641  CTTTCAATAATCCAACG  657
                            
Sbjct 919  -----------------  918