Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06814
- Subject:
- NM_001131009.2
- Aligned Length:
- 2340
- Identities:
- 1949
- Gaps:
- 390
Alignment
Query 1 ATGGAGCAAGTGGAGATCCTGAGGAAATTCATCCAGAGGGTCCAGGCCATGAAGAGTCCTGACCACAATGGGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGACAACTTCGCCCGGGACTTCATGCGGTTAAGAAGATTGTCTACCAAATATAGAACAGAAAAGATATATCCCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGCCACTGGAGAAAAAGAAGAAAATGTTAAAAAGAACAGATACAAGGACATACTGCCATTTGATCACAGCCGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTTAAATTGACATTAAAGACTCCTTCACAAGATTCAGACTATATCAATGCAAATTTTATAAAGGGCGTCTATGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GCCAAAAGCATATGTAGCAACTCAAGGACCTTTAGCAAATACAGTAATAGATTTTTGGAGGATGATATGGGAGT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATAATGTTGTGATCATTGTAATGGCCTGCCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAATGTGAGCGCTATTGGCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------ATGGCCTGCCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAATGTGAGCGCTATTGGCCT 54
Query 445 TTGTATGGAGAAGACCCCATAACGTTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAGGATGAACAAGCAAGAACAGACTA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TTGTATGGAGAAGACCCCATAACGTTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAGGATGAACAAGCAAGAACAGACTA 128
Query 519 CTTCATCAGGACACTCTTACTTGAATTTCAAAATGAATCTCGTAGGCTGTATCAGTTTCATTATGTGAACTGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 CTTCATCAGGACACTCTTACTTGAATTTCAAAATGAATCTCGTAGGCTGTATCAGTTTCATTATGTGAACTGGC 202
Query 593 CAGACCATGATGTTCCTTCATCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATATCAAGAACAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 CAGACCATGATGTTCCTTCATCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATATCAAGAACAT 276
Query 667 GAAGATGTTCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGAAGAACAGGTGCCATTTGTGCCATAGATTATAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 GAAGATGTTCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGAAGAACAGGTGCCATTTGTGCCATAGATTATAC 350
Query 741 GTGGAATTTACTAAAAGCTGGGAAAATACCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 GTGGAATTTACTAAAAGCTGGGAAAATACCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC 424
Query 815 AAAGGCATTCTGCAGTACAAACAAAGGAGCAATATGAACTTGTTCATAGAGCTATTGCCCAACTGTTTGAAAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 AAAGGCATTCTGCAGTACAAACAAAGGAGCAATATGAACTTGTTCATAGAGCTATTGCCCAACTGTTTGAAAAA 498
Query 889 CAGCTACAACTATATGAAATTCATGGAGCTCAGAAAATTGCTGATGGAGTGAATGAAATTAACACTGAAAACAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CAGCTACAACTATATGAAATTCATGGAGCTCAGAAAATTGCTGATGGAGTGAATGAAATTAACACTGAAAACAT 572
Query 963 GATCAGCTCCATAGAGCCTGAAAAACAAGATTCTCCTCCTCCAAAACCACCAAGGACCCGCAGTTGCCTTGTTG 1036
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 GGTCAGCTCCATAGAGCCTGAAAAACAAGATTCTCCTCCTCCAAAACCACCAAGGACCCGCAGTTGCCTTGTTG 646
Query 1037 AAGGGGATGCTAAAGAAGAAATACTGCAGCCACCGGAACCTCATCCAGTGCCACCCATCTTGACACCTTCTCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 AAGGGGATGCTAAAGAAGAAATACTGCAGCCACCGGAACCTCATCCAGTGCCACCCATCTTGACACCTTCTCCC 720
Query 1111 CCTTCAGCTTTTCCAACAGTCACTACTGTGTGGCAGGACAATGATAGATACCATCCAAAGCCAGTGTTGCATAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CCTTCAGCTTTTCCAACAGTCACTACTGTGTGGCAGGACAATGATAGATACCATCCAAAGCCAGTGTTGCATAT 794
Query 1185 GGTTTCATCAGAACAACATTCAGCAGACCTCAACAGAAACTATAGTAAATCAACAGAACTTCCAGGGAAAAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 GGTTTCATCAGAACAACATTCAGCAGACCTCAACAGAAACTATAGTAAATCAACAGAACTTCCAGGGAAAAATG 868
Query 1259 AATCAACAATTGAACAGATAGATAAAAAATTGGAACGAAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAGGTCCCTCTCCAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 AATCAACAATTGAACAGATAGATAAAAAATTGGAACGAAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAGGTCCCTCTCCAA 942
Query 1333 GAGGGACCAAAAAGTTTTGATGGGAACACACTTTTGAATAGGGGACATGCAATTAAAATTAAATCTGCTTCACC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 GAGGGACCAAAAAGTTTTGATGGGAACACACTTTTGAATAGGGGACATGCAATTAAAATTAAATCTGCTTCACC 1016
Query 1407 TTGTATAGCTGATAAAATCTCTAAGCCACAGGAATTAAGTTCAGATCTAAATGTCGGTGATACTTCCCAGAATT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 TTGTATAGCTGATAAAATCTCTAAGCCACAGGAATTAAGTTCAGATCTAAATGTCGGTGATACTTCCCAGAATT 1090
Query 1481 CTTGTGTGGACTGCAGTGTAACACAATCAAACAAAGTTTCAGTTACTCCACCAGAAGAATCCCAGAATTCAGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 CTTGTGTGGACTGCAGTGTAACACAATCAAACAAAGTTTCAGTTACTCCACCAGAAGAATCCCAGAATTCAGAC 1164
Query 1555 ACACCTCCAAGGCCAGACCGCTTGCCTCTTGATGAGAAAGGACATGTAACGTGGTCATTTCATGGACCTGAAAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 ACACCTCCAAGGCCAGACCGCTTGCCTCTTGATGAGAAAGGACATGTAACGTGGTCATTTCATGGACCTGAAAA 1238
Query 1629 TGCCATACCCATACCTGATTTATCTGAAGGCAATTCCTCAGATATCAACTATCAAACTAGGAAAACTGTGAGTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239 TGCCATACCCATACCTGATTTATCTGAAGGCAATTCCTCAGATATCAACTATCAAACTAGGAAAACTGTGAGTT 1312
Query 1703 TAACACCAAGTCCTACAACACAAGTTGAAACACCTGATCTTGTGGATCATGATAACACTTCACCACTCTTCAGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TAACACCAAGTCCTACAACACAAGTTGAAACACCTGATCTTGTGGATCATGATAACACTTCACCACTCTTCAGA 1386
Query 1777 ACACCCCTCAGTTTTACTAATCCACTTCACTCTGATGACTCAGACTCAGATGAAAGAAACTCTGATGGTGCTGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 ACACCCCTCAGTTTTACTAATCCACTTCACTCTGATGACTCAGACTCAGATGAAAGAAACTCTGATGGTGCTGT 1460
Query 1851 GACCCAGAATAAAACTAATATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTTTCTGCTGCCACTAGTACTGAAAGCATTTCTA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 GACCCAGAATAAAACTAATATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTTTCTGCTGCCACTAGTACTGAAAGCATTTCTA 1534
Query 1925 CTAGGAAAGTATTGCCAATGTCCATTGCTAGACATAATATAGCAGGAACAACACATTCAGGTGCTGAAAAAGAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 CTAGGAAAGTATTGCCAATGTCCATTGCTAGACATAATATAGCAGGAACAACACATTCAGGTGCTGAAAAAGAT 1608
Query 1999 GTTGATGTTAGTGAAGATTCACCTCCTCCCCTACCTGAAAGAACTCCTGAATCGTTTGTGTTAGCAAGTGAACA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 GTTGATGTTAGTGAAGATTCACCTCCTCCCCTACCTGAAAGAACTCCTGAATCGTTTGTGTTAGCAAGTGAACA 1682
Query 2073 TAATACACCTGTAAGATCGGAATGGAGTGAACTTCAAAGTCAGGAACGATCTGAACAAAAAAAGTCTGAAGGCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 TAATACACCTGTAAGATCGGAATGGAGTGAACTTCAAAGTCAGGAACGATCTGAACAAAAAAAGTCTGAAGGCT 1756
Query 2147 TGATAACCTCTGAAAATGAGAAATGTGATCATCCAGCGGGAGGTATTCACTATGAAATGTGCATAGAATGTCCA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 TGATAACCTCTGAAAATGAGAAATGTGATCATCCAGCGGGAGGTATTCACTATGAAATGTGCATAGAATGTCCA 1830
Query 2221 CCTACTTTCAGTGACAAGAGAGAACAAATATCAGAAAATCCAACAGAAGCCACAGATATTGGTTTTGGTAATCG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831 CCTACTTTCAGTGACAAGAGAGAACAAATATCAGAAAATCCAACAGAAGCCACAGATATTGGTTTTGGTAATCG 1904
Query 2295 ATGTGGAAAACCCAAAGGACCAAGAGATCCACCTTCAGAATGGACA 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 ATGTGGAAAACCCAAAGGACCAAGAGATCCACCTTCAGAATGGACA 1950