Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06818
- Subject:
- XM_011527190.1
- Aligned Length:
- 3372
- Identities:
- 2290
- Gaps:
- 1068
Alignment
Query 1 ATGGCTGGGGCTGGCGGGGGCCTCGGGGTCTGGGGGAACCTGGTGCTGCTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGGGGCTGGCGGGGGCCTCGGGGTCTGGGGGAACCTGGTGCTGCTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGC 74
Query 75 CAGGGCGCCT---------------------GCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCA 127
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGGGCGCCTGACCTTCCTTCCCAATTCTCAGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCA 148
Query 128 CCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGT 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGT 222
Query 202 ACTGGAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGG 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGGAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGG 296
Query 276 GTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCA 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCA 370
Query 350 CAGCTCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTC 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGCTCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTC 444
Query 424 CCCGACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCG 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCGACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCG 518
Query 498 AAGCACAGCACACACCAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGG 571
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGCACAGCACACACTAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGG 592
Query 572 GAAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGA 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGA 666
Query 646 GTGGAGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCAC 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GTGGAGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGAC 740
Query 720 CTACTGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGG 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTACTGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGG 814
Query 794 ATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAG 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAG 888
Query 868 ATTGTCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGC 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTGTCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGC 962
Query 942 CCTGACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTG 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCTGACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTG 1036
Query 1016 GCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTG 1089
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTG 1110
Query 1090 TTTTCCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCC 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTTTCCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCC 1184
Query 1164 AGTGAGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCAT 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGTGAGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCAT 1258
Query 1238 ACCCTCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAAT 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCCTCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAAT 1332
Query 1312 ACCAGTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGC 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACCAGTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGC 1406
Query 1386 ACGTGGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGA 1459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACGTGGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGA 1480
Query 1460 CCAACAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCA 1533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAACAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCA 1554
Query 1534 TGGGTCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGA 1607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGGGTCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGA 1628
Query 1608 AGCTGGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTG 1681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGCTGGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTG 1702
Query 1682 CAGCCACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGG 1755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGCCACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGG 1776
Query 1756 AAGGCCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAG 1829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGGCCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAG 1850
Query 1830 GGGGCAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCC 1903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGGGCAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCC 1924
Query 1904 TGGAACCCGGGACGCTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTC 1977
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGAACCCGGGACGTTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTC 1998
Query 1978 TGTGCGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTT 2051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGTGCGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTT 2072
Query 2052 GATCTGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACA 2125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GATCTGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACA 2146
Query 2126 GATCTTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACC 2199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GATCTTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACC 2220
Query 2200 ATCTGGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCG-GAG 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||.| ||.
Sbjct 2221 ATCTGGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGG----ATTGCTGAGAA 2290
Query 2273 CCTTTGTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCT-----GCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATA 2341
.|| ||| .||.|.|||||| ||||| ||||||.|.|..|
Sbjct 2291 GCT------GCA----------------GCTTGGGGGCCTTCAAGGCTGA---------TGAAGATGGGCCA-- 2331
Query 2342 AGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTC 2415
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2416 GCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGT 2489
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2490 GGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGC 2563
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2564 CCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTC 2637
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2638 ATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTG 2711
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2712 GCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGT 2785
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2786 GTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAA 2859
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2860 GTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCA 2933
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 2934 ATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGC 3007
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 3008 TTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACA 3081
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 3082 GGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGT 3155
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 3156 AAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCC 3229
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 3230 TGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATC 3303
Sbjct 2332 -------------------------------------------------------------------------- 2331
Query 3304 TACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTC 3345
Sbjct 2332 ------------------------------------------ 2331
