Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06819
Subject:
NM_001161837.1
Aligned Length:
549
Identities:
378
Gaps:
137

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MHRNTRSVSTPTLQMDITKLNITLLRIFRQGVAAALGLLPQQVHINRLIEKKNQVELFVSPGNRKPGETQALQA  74

Query   1  ---------------------------------------------------------------MILHRLKERFQ  11
                                                                          ||..|||||.|
Sbjct  75  EEVLRSLNVDGLHQSLPQFGITDVAPEKNVLQGQHEADKIWSKEGFYAVVIFLSIFIIIVTCLMIIYRLKERLQ  148

Query  12  LSLRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPKVLNVVVDPQGRGAPEIKATTATSVCPSPFKMKP  85
           ||||||||||||||||||..|.|.|||||.||||||.||||||||||||||...|||...|.||||||||.|||
Sbjct 149  LSLRQDKEKNQEIHLSPIARQQAQSEAKTTHSMVQPDQAPKVLNVVVDPQGQCTPEIRNSTSTSVCPSPFRMKP  222

Query  86  IGLQKRRGSNVSLTLDMSSLGNIEPFVSIPTPREKVAMEYLQSASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNF  159
           ||||.||||||||||||||||..||||...||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  IGLQERRGSNVSLTLDMSSLGSVEPFVAVSTPREKVAMEYLQSASRVLTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNF  296

Query 160  VDPKEIDIPRHGTKNRYKTILPNPLSRVCLRPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVDDFWQ  233
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297  VDPKEIDIPRHGTKNRYKTILPNPLSRVCLRPKNITDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVNDFWQ  370

Query 234  MVWQEDSPVIVMITKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHVKHYWYTSW  307
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  MVWQEDSPVIVMITKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVTGVTECDNYTIRNLVLKQGSHTQHVKHYWYTSW  444

Query 308  PDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGPVVVHCSAGIGRTGCFIATSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRMD  381
           ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 445  PDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASEGRGPVVVHCSAGIGRTGCFIATSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRVD  518

Query 382  RGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ  412
           ||||||||||||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 519  RGGMVQTSEQYEFVHHALCLFESRLSPETVE  549