Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06819
- Subject:
- NM_001207015.2
- Aligned Length:
- 1635
- Identities:
- 1234
- Gaps:
- 399
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGTCAATTTCCAAACAGACACTGCAAATGGATGTAAACAAGCTGAACATAACCTTGCTTCGGATCTTCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCAAGGAGTGGCTGCAGCTTTAGGACTCTTACCCCAGCAAGTGCACATCAATCGCCTCATTGGAAAGAAGAACA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTATTGAACTGTTTGTGTCTCCCATAAACCGAAAAACAGGAATTTCTGATGCTCTGCCCTCTGAGGAAGTTCTT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CGTTCACTTAATATCAATGTTTTGCATCAAAGTTTATCCCAGTTTGGAATTACAGAAGTCTCTCCTGAGAAAAA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGTTTTACAAGGGCAGCATGAAGCGGACAAAATCTGGAGCAAAGAAGGATTTTATGCTGTTGTCATTTTTCTCA 370
Query 1 -----------------------------ATGATTCTTCACAGATTAAAAGAAAGATTTCAGCTTTCCTTAAGA 45
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCATCTTTGTTATTATAGTAACGTGTTTGATGATTCTTTACAGATTAAAAGAAAGATTTCAGCTTTCCTTAAGA 444
Query 46 CAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTATCGCCCATCACATTACAGCCAGCACTGTCCGAGGCAAAGAC 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTATCGCCCATCACATTACAGCCAGCACTGTCCGAGGCAAAGAC 518
Query 120 AGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCAAAGGTACTGAATGTTGTCGTGGACCCTCAAGGCCGAGGTG 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCAAAGGTACTGAATGTTGTCGTGGACCCTCAAGGCCGAGGTG 592
Query 194 CTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGTTTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAAGCCCATAGGACTTCAA 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGTTTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAAGCCCATAGGACTTCAA 666
Query 268 AAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGGACATGAGTAGCTTGGGGAACATTGAACCCTTTGTGTCTAT 341
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGGACATGAGTAGCTTGGGGAACATTGAACCCTTTGTGTCTAT 740
Query 342 ACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTATCTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTCACAAGGTCTCAGCTGA 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTATCTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTCACAAGGTCTCAGCTGA 814
Query 416 GGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAACTTTGTGGATCCCAAA 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAACTTTGTGGATCCCAAA 888
Query 490 GAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATCGCTATAAGACCATTTTACCAAATCCCCTCAGCAGAGTGTG 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATCGCTATAAGACCATTTTACCAAATCCCCTCAGCAGAGTGTG 962
Query 564 TTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGCACCTACATTAATGCTAATTATATTAGGGGCTACAGTGGCA 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGCACCTACATTAATGCTAATTATATTAGGGGCTACAGTGGCA 1036
Query 638 AGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCATGATCAACACCGTGGATGATTTCTGGCAGATGGTTTGGCAG 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCATGATCAACACCGTGGATGATTTCTGGCAGATGGTTTGGCAG 1110
Query 712 GAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAACTCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTGTGCTATACTGGCCGGA 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAACTCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTGTGCTATACTGGCCGGA 1184
Query 786 AAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTGGTTATCAGTGTAAATGAATGTGATAACTACACCATTCGAA 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTGGTTATCAGTGTAAATGAATGTGATAACTACACCATTCGAA 1258
Query 860 ACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACATGTGAAGCATTACTGGTACACCTCATGGCCTGATCACAAG 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACATGTGAAGCATTACTGGTACACCTCATGGCCTGATCACAAG 1332
Query 934 ACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCATGCTGGATGTAGAAGAAGACAGACTTGCTTCCCAGGGCCG 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCATGCTGGATGTAGAAGAAGACAGACTTGCTTCCCAGGGCCG 1406
Query 1008 AGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATAGGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCTACATCCATTGGCTGTC 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATAGGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCTACATCCATTGGCTGTC 1480
Query 1082 AACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACTAAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTATGGATAGAGGTGGAATG 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACTAAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTATGGATAGAGGTGGAATG 1554
Query 1156 GTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCAGACTTTCAGCAGAGAC 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCAGACTTTCAGCAGAGAC 1628
Query 1230 TGTCCAG 1236
|||||||
Sbjct 1629 TGTCCAG 1635