Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06819
• Subject: NM_001207016.1
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1234
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAACCAGAAAAATGTTTTACAAGGGCAGCATGAAGCGGACAAAATCTGGAGCAAAGAAGGATTTTATGCTGT  74

Query    1  -------------------------------------------ATGATTCTTCACAGATTAAAAGAAAGATTTC  31
                                                       |||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTCATTTTTCTCAGCATCTTTGTTATTATAGTAACGTGTTTGATGATTCTTTACAGATTAAAAGAAAGATTTC  148

Query   32  AGCTTTCCTTAAGACAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTATCGCCCATCACATTACAGCCAGCACTG  105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTTTCCTTAAGACAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTATCGCCCATCACATTACAGCCAGCACTG  222

Query  106  TCCGAGGCAAAGACAGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCAAAGGTACTGAATGTTGTCGTGGACCC  179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCGAGGCAAAGACAGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCAAAGGTACTGAATGTTGTCGTGGACCC  296

Query  180  TCAAGGCCGAGGTGCTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGTTTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAAGC  253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAAGGCCGAGGTGCTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGTTTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAAGC  370

Query  254  CCATAGGACTTCAAAAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGGACATGAGTAGCTTGGGGAACATTGAA  327
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATAGGACTTCAAGAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGGACATGAGTAGCTTGGGGAACATTGAA  444

Query  328  CCCTTTGTGTCTATACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTATCTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTCAC  401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTTTGTGTCTATACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTATCTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTCAC  518

Query  402  AAGGTCTCAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAACT  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGTCTCAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAACT  592

Query  476  TTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATCGCTATAAGACCATTTTACCAAATCCC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATCGCTATAAGACCATTTTACCAAATCCC  666

Query  550  CTCAGCAGAGTGTGTTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGCACCTACATTAATGCTAATTATATTAG  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCAGCAGAGTGTGTTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGCACCTACATTAATGCTAATTATATTAG  740

Query  624  GGGCTACAGTGGCAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCATGATCAACACCGTGGATGATTTCTGGC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGCTACAGTGGCAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCATGATCAACACCGTGGATGATTTCTGGC  814

Query  698  AGATGGTTTGGCAGGAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAACTCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTGTG  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGATGGTTTGGCAGGAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAACTCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTGTG  888

Query  772  CTATACTGGCCGGAAAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTGGTTATCAGTGTAAATGAATGTGATAA  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTATACTGGCCGGAAAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTGGTTATCAGTGTAAATGAATGTGATAA  962

Query  846  CTACACCATTCGAAACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACATGTGAAGCATTACTGGTACACCTCAT  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACACCATTCGAAACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACATGTGAAGCATTACTGGTACACCTCAT  1036

Query  920  GGCCTGATCACAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCATGCTGGATGTAGAAGAAGACAGACTT  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCCTGATCACAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCATGCTGGATGTAGAAGAAGACAGACTT  1110

Query  994  GCTTCCCAGGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATAGGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCTAC  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTTCCCAGGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATAGGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCTAC  1184

Query 1068  ATCCATTGGCTGTCAACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACTAAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTATGG  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATCCATTGGCTGTCAACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACTAAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTATGG  1258

Query 1142  ATAGAGGTGGAATGGTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCAGA  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATAGAGGTGGAATGGTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCAGA  1332

Query 1216  CTTTCAGCAGAGACTGTCCAG  1236
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTTCAGCAGAGACTGTCCAG  1353