Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06819
- Subject:
- NM_002849.4
- Aligned Length:
- 1971
- Identities:
- 1234
- Gaps:
- 735
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGAGAGCAGTCTGCTTCCCTGCGCTGTGCCTGCTCCTTAATCTTCACGCTGCAGGGTGCTTTTCAGGAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAATGATCATTTTTTGGCAATTAATCAGAAGAAGAGTGGGAAGCCGGTATTCATTTATAAGCATTCACAAGACA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TTGAGAAGAGCCTGGATATAGCCCCACAAAAAATCTACAGACATAGCTACCATTCCTCTTCCGAAGCTCAAGTA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AGCAAACGCCACCAGATTGTCAATTCAGCATTTCCTAGACCCGCATATGACCCGTCTCTCAATCTGCTGGCCAT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGATGGTCAAGATCTTGAAGTGGAAAATCTCCCAATCCCAGCAGCAAATGTAATTGTGGTGACACTGCAAATGG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 ATGTAAACAAGCTGAACATAACCTTGCTTCGGATCTTCCGCCAAGGAGTGGCTGCAGCTTTAGGACTCTTACCC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CAGCAAGTGCACATCAATCGCCTCATTGGAAAGAAGAACAGTATTGAACTGTTTGTGTCTCCCATAAACCGAAA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AACAGGAATTTCTGATGCTCTGCCCTCTGAGGAAGTTCTTCGTTCACTTAATATCAATGTTTTGCATCAAAGTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 TATCCCAGTTTGGAATTACAGAAGTCTCTCCTGAGAAAAATGTTTTACAAGGGCAGCATGAAGCGGACAAAATC 666
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGAT 5
|||||
Sbjct 667 TGGAGCAAAGAAGGATTTTATGCTGTTGTCATTTTTCTCAGCATCTTTGTTATTATAGTAACGTGTTTGATGAT 740
Query 6 TCTTCACAGATTAAAAGAAAGATTTCAGCTTTCCTTAAGACAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTAT 79
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCTTTACAGATTAAAAGAAAGATTTCAGCTTTCCTTAAGACAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTAT 814
Query 80 CGCCCATCACATTACAGCCAGCACTGTCCGAGGCAAAGACAGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCA 153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGCCCATCACATTACAGCCAGCACTGTCCGAGGCAAAGACAGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCA 888
Query 154 AAGGTACTGAATGTTGTCGTGGACCCTCAAGGCCGAGGTGCTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGT 227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGGTACTGAATGTTGTCGTGGACCCTCAAGGCCGAGGTGCTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGT 962
Query 228 TTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAAGCCCATAGGACTTCAAAAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGG 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAAGCCCATAGGACTTCAAGAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGG 1036
Query 302 ACATGAGTAGCTTGGGGAACATTGAACCCTTTGTGTCTATACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTAT 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACATGAGTAGCTTGGGGAACATTGAACCCTTTGTGTCTATACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTAT 1110
Query 376 CTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTCACAAGGTCTCAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAG 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTCACAAGGTCTCAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAG 1184
Query 450 TGAATTCATGGAAATACCAATGAACTTTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATC 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAATTCATGGAAATACCAATGAACTTTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATC 1258
Query 524 GCTATAAGACCATTTTACCAAATCCCCTCAGCAGAGTGTGTTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGC 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GCTATAAGACCATTTTACCAAATCCCCTCAGCAGAGTGTGTTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGC 1332
Query 598 ACCTACATTAATGCTAATTATATTAGGGGCTACAGTGGCAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCAT 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACCTACATTAATGCTAATTATATTAGGGGCTACAGTGGCAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCAT 1406
Query 672 GATCAACACCGTGGATGATTTCTGGCAGATGGTTTGGCAGGAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAAC 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GATCAACACCGTGGATGATTTCTGGCAGATGGTTTGGCAGGAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAAC 1480
Query 746 TCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTGTGCTATACTGGCCGGAAAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTG 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTGTGCTATACTGGCCGGAAAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTG 1554
Query 820 GTTATCAGTGTAAATGAATGTGATAACTACACCATTCGAAACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACA 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTTATCAGTGTAAATGAATGTGATAACTACACCATTCGAAACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACA 1628
Query 894 TGTGAAGCATTACTGGTACACCTCATGGCCTGATCACAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCA 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGTGAAGCATTACTGGTACACCTCATGGCCTGATCACAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCA 1702
Query 968 TGCTGGATGTAGAAGAAGACAGACTTGCTTCCCAGGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATA 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGCTGGATGTAGAAGAAGACAGACTTGCTTCCCAGGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATA 1776
Query 1042 GGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCTACATCCATTGGCTGTCAACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACT 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCTACATCCATTGGCTGTCAACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACT 1850
Query 1116 AAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTATGGATAGAGGTGGAATGGTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACC 1189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTATGGATAGAGGTGGAATGGTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACC 1924
Query 1190 ATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCAGACTTTCAGCAGAGACTGTCCAG 1236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCAGACTTTCAGCAGAGACTGTCCAG 1971
