Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06819
- Subject:
- XM_011538615.2
- Aligned Length:
- 1947
- Identities:
- 1234
- Gaps:
- 711
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCATGTCCAAGGAACCTTTGCCTAACCTTAGGGTGCTTTTCAGGAAACAATGATCATTTTTTGGCAATTAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCAGAAGAAGAGTGGGAAGCCGGTATTCATTTATAAGCATTCACAAGACATTGAGAAGAGCCTGGATATAGCCC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CACAAAAAATCTACAGACATAGCTACCATTCCTCTTCCGAAGCTCAAGTAAGCAAACGCCACCAGATTGTCAAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCAGCATTTCCTAGACCCGCATATGACCCGTCTCTCAATCTGCTGGCCATGGATGGTCAAGATCTTGAAGTGGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AAATCTCCCAATCCCAGCAGCAAATGTAATTGTGGTGACACTGCAAATGGATGTAAACAAGCTGAACATAACCT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TGCTTCGGATCTTCCGCCAAGGAGTGGCTGCAGCTTTAGGACTCTTACCCCAGCAAGTGCACATCAATCGCCTC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ATTGGAAAGAAGAACAGTATTGAACTGTTTGTGTCTCCCATAAACCGAAAAACAGGAATTTCTGATGCTCTGCC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CTCTGAGGAAGTTCTTCGTTCACTTAATATCAATGTTTTGCATCAAAGTTTATCCCAGTTTGGAATTACAGAAG 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 TCTCTCCTGAGAAAAATGTTTTACAAGGGCAGCATGAAGCGGACAAAATCTGGAGCAAAGAAGGATTTTATGCT 666
Query 1 ---------------------------------------------ATGATTCTTCACAGATTAAAAGAAAGATT 29
|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTTGTCATTTTTCTCAGCATCTTTGTTATTATAGTAACGTGTTTGATGATTCTTTACAGATTAAAAGAAAGATT 740
Query 30 TCAGCTTTCCTTAAGACAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTATCGCCCATCACATTACAGCCAGCAC 103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCAGCTTTCCTTAAGACAAGACAAAGAGAAAAACCAGGAGATCCACCTATCGCCCATCACATTACAGCCAGCAC 814
Query 104 TGTCCGAGGCAAAGACAGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCAAAGGTACTGAATGTTGTCGTGGAC 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGTCCGAGGCAAAGACAGTCCACAGCATGGTCCAACCTGAGCAGGCCCCAAAGGTACTGAATGTTGTCGTGGAC 888
Query 178 CCTCAAGGCCGAGGTGCTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGTTTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAA 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTCAAGGCCGAGGTGCTCCTGAGATCAAAGCTACCACCGCTACCTCTGTTTGCCCTTCTCCTTTCAAAATGAA 962
Query 252 GCCCATAGGACTTCAAAAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGGACATGAGTAGCTTGGGGAACATTG 325
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCCATAGGACTTCAAGAGAGAAGAGGGTCCAACGTATCTCTTACATTGGACATGAGTAGCTTGGGGAACATTG 1036
Query 326 AACCCTTTGTGTCTATACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTATCTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTC 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACCCTTTGTGTCTATACCAACACCACGGGAGAAGGTAGCAATGGAGTATCTGCAGTCAGCCAGCCGAATTCTC 1110
Query 400 ACAAGGTCTCAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAA 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACAAGGTCTCAGCTGAGGGACGTCGTGGCAAGTTCACATTTACTCCAAAGTGAATTCATGGAAATACCAATGAA 1184
Query 474 CTTTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATCGCTATAAGACCATTTTACCAAATC 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTTGTGGATCCCAAAGAAATTGATATTCCGCGTCATGGAACTAAAAATCGCTATAAGACCATTTTACCAAATC 1258
Query 548 CCCTCAGCAGAGTGTGTTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGCACCTACATTAATGCTAATTATATT 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCCTCAGCAGAGTGTGTTTAAGACCAAAAAATGTAACCGATTCATTGAGCACCTACATTAATGCTAATTATATT 1332
Query 622 AGGGGCTACAGTGGCAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCATGATCAACACCGTGGATGATTTCTG 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGGGGCTACAGTGGCAAGGAGAAAGCCTTCATTGCCACGCAGGGCCCCATGATCAACACCGTGGATGATTTCTG 1406
Query 696 GCAGATGGTTTGGCAGGAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAACTCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTG 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCAGATGGTTTGGCAGGAAGACAGCCCTGTGATTGTTATGATCACAAAACTCAAAGAAAAAAATGAGAAATGTG 1480
Query 770 TGCTATACTGGCCGGAAAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTGGTTATCAGTGTAAATGAATGTGAT 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGCTATACTGGCCGGAAAAGAGAGGGATATATGGAAAAGTTGAGGTTCTGGTTATCAGTGTAAATGAATGTGAT 1554
Query 844 AACTACACCATTCGAAACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACATGTGAAGCATTACTGGTACACCTC 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACTACACCATTCGAAACCTTGTCTTAAAGCAAGGAAGCCACACCCAACATGTGAAGCATTACTGGTACACCTC 1628
Query 918 ATGGCCTGATCACAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCATGCTGGATGTAGAAGAAGACAGAC 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATGGCCTGATCACAAGACTCCAGACAGTGCCCAGCCCCTCCTACAGCTCATGCTGGATGTAGAAGAAGACAGAC 1702
Query 992 TTGCTTCCCAGGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATAGGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCT 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTGCTTCCCAGGGCCGAGGGCCTGTGGTTGTCCACTGCAGTGCAGGAATAGGTAGAACAGGGTGTTTTATTGCT 1776
Query 1066 ACATCCATTGGCTGTCAACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACTAAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTAT 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACATCCATTGGCTGTCAACAGCTGAAAGAAGAAGGAGTTGTGGATGCACTAAGCATTGTCTGCCAGCTTCGTAT 1850
Query 1140 GGATAGAGGTGGAATGGTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCA 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGATAGAGGTGGAATGGTGCAAACCAGTGAGCAGTATGAATTTGTGCACCATGCTCTGTGCCTGTATGAGAGCA 1924
Query 1214 GACTTTCAGCAGAGACTGTCCAG 1236
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GACTTTCAGCAGAGACTGTCCAG 1947
