Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06843
• Subject: NM_002887.4
• Aligned Length: 1980
• Identities: 1979
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACGTACTGGTGTCTGAGTGCTCCGCGCGGCTGCTGCAGCAGGAAGAAGAGATTAAATCTCTGACTGCTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGTACTGGTGTCTGAGTGCTCCGCGCGGCTGCTGCAGCAGGAAGAAGAGATTAAATCTCTGACTGCTGA  74

Query   75  AATTGACCGGTTGAAAAACTGTGGCTGTTTAGGAGCTTCTCCAAATTTGGAGCAGTTACAAGAAGAAAATTTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATTGACCGGTTGAAAAACTGTGGCTGTTTAGGAGCTTCTCCAAATTTGGAGCAGTTACAAGAAGAAAATTTAA  148

Query  149  AATTAAAGTATCGACTGAATATTCTTCGAAAGAGTCTTCAGGCAGAAAGGAACAAACCAACTAAAAATATGATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATTAAAGTATCGACTGAATATTCTTCGAAAGAGTCTTCAGGCAGAAAGGAACAAACCAACTAAAAATATGATT  222

Query  223  AACATTATTAGCCGCCTACAAGAGGTCTTTGGTCATGCAATTAAGGCTGCATATCCAGATTTGGAAAATCCTCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATTATTAGCCGCCTACAAGAGGTCTTTGGTCATGCAATTAAGGCTGCATATCCAGATTTGGAAAATCCTCC  296

Query  297  TCTGCTAGTGACACCAAGTCAGCAGGCCAAGTTTGGGGACTATCAGTGTAATAGTGCTATGGGTATTTCTCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTGCTAGTGACACCAAGTCAGCAGGCCAAGTTTGGGGACTATCAGTGTAATAGTGCTATGGGTATTTCTCAGA  370

Query  371  TGCTCAAAACCAAGGAACAGAAAGTTAATCCAAGAGAAATTGCTGAAAACATTACCAAACACCTCCCAGACAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCTCAAAACCAAGGAACAGAAAGTTAATCCAAGAGAAATTGCTGAAAACATTACCAAACACCTCCCAGACAAT  444

Query  445  GAATGTATTGAAAAAGTTGAAATTGCTGGTCCTGGTTTTATTAATGTCCACTTAAGAAAGGATTTTGTATCAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATGTATTGAAAAAGTTGAAATTGCTGGTCCTGGTTTTATTAATGTCCACTTAAGAAAGGATTTTGTATCAGA  518

Query  519  ACAATTGACCAGTCTTCTAGTGAATGGAGTTCAACTACCTGCTCTGGGAGAGAATAAAAAGGTTATAGTTGACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAATTGACCAGTCTTCTAGTGAATGGAGTTCAACTACCTGCTCTGGGAGAGAATAAAAAGGTTATAGTTGACT  592

Query  593  TTTCCTCCCCTAATATAGCTAAAGAGATGCATGTAGGCCACCTGAGGTCAACTATCATAGGAGAGAGTATAAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTCCTCCCCTAATATAGCTAAAGAGATGCATGTAGGCCACCTGAGGTCAACTATCATAGGAGAGAGTATAAGC  666

Query  667  CGCCTCTTTGAATTTGCAGGGTATGACGTGCTCAGGTTAAATCATGTAGGAGACTGGGGGACCCAGTTTGGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCCTCTTTGAATTTGCAGGGTATGACGTGCTCAGGTTAAATCATGTAGGAGACTGGGGGACCCAGTTTGGCAT  740

Query  741  GCTCATCGCTCACCTGCAAGACAAATTTCCAGATTATCTAACAGTTTCACCTCCTATTGGGGATCTTCAGGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTCATCGCTCACCTGCAAGACAAATTTCCAGATTATCTAACAGTTTCACCTCCTATTGGGGATCTTCAGGTCT  814

Query  815  TTTATAAGGAATCTAAGAAGAGGTTTGATACTGAGGAGGAATTTAAGAAGCGAGCATATCAGTGTGTAGTTCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTATAAGGAATCTAAGAAGAGGTTTGATACTGAGGAGGAATTTAAGAAGCGAGCATATCAGTGTGTAGTTCTG  888

Query  889  CTCCAGGGTAAAAACCCAGATATTACAAAAGCTTGGAAGCTTATCTGTGATGTCTCCCGCCAAGAGTTAAATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCAGGGTAAAAACCCAGATATTACAAAAGCTTGGAAGCTTATCTGTGATGTCTCCCGCCAAGAGTTAAATAA  962

Query  963  AATCTATGATGCATTGGACGTCTCTTTAATAGAGAGAGGGGAATCCTTCTATCAAGATAGGATGAATGATATTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATCTATGATGCATTGGACGTCTCTTTAATAGAGAGAGGGGAATCCTTCTATCAAGATAGGATGAATGATATTG  1036

Query 1037  TAAAGGAATTTGAAGATAGAGGATTTGTGCAGGTGGATGATGGCAGAAAGATTGTATTTGTCCCAGGGTGTTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAAAGGAATTTGAAGATAGAGGATTTGTGCAGGTGGATGATGGCAGAAAGATTGTATTTGTCCCAGGGTGTTCC  1110

Query 1111  ATACCATTAACCATAGTAAAATCAGATGGAGGTTATACCTATGATACATCTGACCTGGCTGCTATTAAACAAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATACCATTAACCATAGTAAAATCAGATGGAGGTTATACCTATGATACATCTGACCTGGCTGCTATTAAACAAAG  1184

Query 1185  ACTATTTGAGGAAAAAGCAGATATGATTATCTATGTTGTGGACAATGGACAATCTGTGCACTTCCAGACAATAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTATTTGAGGAAAAAGCAGATATGATTATCTATGTTGTGGACAATGGACAATCTGTGCACTTCCAGACAATAT  1258

Query 1259  TTGCTGCTGCTCAAATGATTGGTTGGTATGACCCTAAAGTAACTCGAGTCTTCCATGCTGGATTTGGTGTGGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTGCTGCTGCTCAAATGATTGGTTGGTATGACCCTAAAGTAACTCGAGTCTTCCATGCTGGATTTGGTGTGGTG  1332

Query 1333  CTAGGGGAAGACAAGAAAAAGTTTAAAACACGTTCGGGTGAAACAGTGCGCCTCATGGATCTTCTGGGAGAAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTAGGGGAAGACAAGAAAAAGTTTAAAACACGTTCGGGTGAAACAGTGCGCCTCATGGATCTTCTGGGAGAAGG  1406

Query 1407  ACTAAAACGATCCATGGACAAGTTGAAGGAAAAAGAAAGAGACAAGGTCTTAACTGCAGAGGAATTGAATGCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACTAAAACGATCCATGGACAAGTTGAAGGAAAAAGAAAGAGACAAGGTCTTAACTGCAGAGGAATTGAATGCTG  1480

Query 1481  CTCAGACATCCGTTGCATATGGCTGCATCAAATATGCTGACCTTTCCCATAACCGGTTGAATGACTACATCTTC  1554
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCAGACATCCGTTGCGTATGGCTGCATCAAATATGCTGACCTTTCCCATAACCGGTTGAATGACTACATCTTC  1554

Query 1555  TCCTTTGACAAAATGCTAGATGACAGAGGAAATACAGCTGCTTACTTGTTGTATGCCTTCACTAGAATCAGGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCCTTTGACAAAATGCTAGATGACAGAGGAAATACAGCTGCTTACTTGTTGTATGCCTTCACTAGAATCAGGTC  1628

Query 1629  TATTGCACGTCTGGCCAATATTGATGAAGAAATGCTCCAAAAAGCTGCTCGAGAAACCAAGATTCTTTTGGATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TATTGCACGTCTGGCCAATATTGATGAAGAAATGCTCCAAAAAGCTGCTCGAGAAACCAAGATTCTTTTGGATC  1702

Query 1703  ATGAGAAGGAATGGAAACTAGGCCGGTGCATTTTACGGTTCCCTGAGATTCTGCAAAAGATTTTAGATGACTTA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGAGAAGGAATGGAAACTAGGCCGGTGCATTTTACGGTTCCCTGAGATTCTGCAAAAGATTTTAGATGACTTA  1776

Query 1777  TTTCTCCACACTCTCTGTGATTATATATATGAGCTGGCAACTGCTTTCACAGAGTTCTATGATAGCTGCTACTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTCTCCACACTCTCTGTGATTATATATATGAGCTGGCAACTGCTTTCACAGAGTTCTATGATAGCTGCTACTG  1850

Query 1851  TGTGGAGAAAGATAGACAGACTGGAAAAATATTGAAGGTGAACATGTGGCGTATGCTGCTATGTGAAGCAGTAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGTGGAGAAAGATAGACAGACTGGAAAAATATTGAAGGTGAACATGTGGCGTATGCTGCTATGTGAAGCAGTAG  1924

Query 1925  CTGCTGTCATGGCCAAGGGGTTTGATATCCTGGGAATAAAACCTGTCCAAAGGATG  1980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGCTGTCATGGCCAAGGGGTTTGATATCCTGGGAATAAAACCTGTCCAAAGGATG  1980