Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06855
- Subject:
- NM_001260494.1
- Aligned Length:
- 1749
- Identities:
- 1339
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 ATGCCGAAACCAATCAACGTAAGAGTAACTACAATGGATGCTGAGCTGGAATTTGCCATTCAGCCCAATACAAC 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------ATGCTGAGCTGGAATTTGCCATTCAGCCCAATACAAC 37
Query 75 TGGCAAACAACTTTTTGACCAGGTGGTGAAAACAGTTGGTTTGCGTGAGGTCTGGTTTTTTGGGCTGCAGTATG 148
|||||||||||||||||||||
Sbjct 38 TGGCAAACAACTTTTTGACCA----------------------------------------------------- 58
Query 149 TAGACAGCAAAGGTTATTCTACATGGCTTAAACTAAATAAAAAGGTAACACAGCAGGATGTTAAAAAAGAGAAT 222
Sbjct 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Query 223 CCTTTACAGTTCAAGTTTAGAGCTAAATTCTTTCCTGAAGATGTTTCTGAGGAATTAATTCAAGAAATAACCCA 296
Sbjct 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Query 297 GAGACTCTTCTTCTTGCAAGTTAAAGAAGCCATCTTAAATGATGAGATATATTGCCCGCCAGAAACTGCAGTTC 370
Sbjct 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Query 371 TTTTGGCTTCCTATGCTGTCCAAGCCAAGTATGGAGATTACAATAAAGAGATTCATAAGCCAGGCTACCTGGCT 444
Sbjct 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Query 445 AATGATAGACTCCTACCCCAGCGTGTATTGGAACAACACAAACTAACAAAAGAACAGTGGGAAGAAAGAATACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 ----------------------GTGTATTGGAACAACACAAACTAACAAAAGAACAGTGGGAAGAAAGAATACA 110
Query 519 GAACTGGCATGAAGAACATAGAGGAATGTTAAGGGAGGATTCTATGATGGAATACCTGAAGATTGCACAAGATC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111 GAACTGGCATGAAGAACATAGAGGAATGTTAAGGGAGGATTCTATGATGGAATACCTGAAGATTGCACAAGATC 184
Query 593 TAGAAATGTATGGAGTCAACTATTTTGAAATAAAAAATAAAAAAGGAACTGAATTGTGGCTAGGTGTTGATGCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 TAGAAATGTATGGAGTCAACTATTTTGAAATAAAAAATAAAAAAGGAACTGAATTGTGGCTAGGTGTTGATGCT 258
Query 667 TTGGGTCTGAATATTTATGAGCATGACGACAAGTTAACACCTAAAATTGGTTTTCCCTGGAGTGAAATCAGAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 TTGGGTCTGAATATTTATGAGCATGACGACAAGTTAACACCTAAAATTGGTTTTCCCTGGAGTGAAATCAGAAA 332
Query 741 TATTTCATTTAATGACAAAAAATTTGTTATAAAGCCAATCGACAAAAAGGCACCTGATTTTGTGTTTTATGCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 TATTTCATTTAATGACAAAAAATTTGTTATAAAGCCAATCGACAAAAAGGCACCTGATTTTGTGTTTTATGCAC 406
Query 815 CTCGTCTGAGAATCAATAAGAGGATTTTGGCCTTATGTATGGGAAACCATGAACTATACATGCGAAGAAGGAAG 888
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 CTCGTCTGAGAATCAATAAGCGGATTTTGGCCTTATGTATGGGAAACCATGAACTATACATGCGAAGAAGGAAG 480
Query 889 CCTGATACTATTGAAGTACAACAGATGAAGGCTCAGGCTAGGGAGGAGAAACATCAGAAGCAGTTGGAAAGGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CCTGATACTATTGAAGTACAACAGATGAAGGCTCAGGCTAGGGAGGAGAAACATCAGAAGCAGTTGGAAAGGGC 554
Query 963 ACAATTAGAGAATGAAAAGGAGAAAAGAGAAATAGCAGAAAAGGAAAAGGAAAGAATAGAACGTGAAAAGGAAG 1036
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 ACAATTAGAGAATGAAAAGAAGAAAAGAGAAATAGCAGAAAAGGAAAAGGAAAGAATAGAACGTGAAAAGGAAG 628
Query 1037 AGCTAATGGAACGTCTAAAACAAATTGAAGAGCAGACAATTAAAGCTCAGAAAGAACTAGAAGAACAGACTCGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 AGCTAATGGAACGTCTAAAACAAATTGAAGAGCAGACAATTAAAGCTCAGAAAGAACTAGAAGAACAGACTCGA 702
Query 1111 AAAGCTCTAGAACTGGATCAAGAACGAAAACGAGCAAAAGAAGAAGCAGAACGACTTGAAAAGGAGCGTCGAGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 AAAGCTCTAGAACTGGATCAAGAACGAAAACGAGCAAAAGAAGAAGCAGAACGACTTGAAAAGGAGCGTCGAGC 776
Query 1185 TGCTGAAGAGGCAAAGTCTGCCATAGCAAAACAAGCTGCCGACCAGATGAAGAATCAGGAGCAGCTAGCAGCAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 TGCTGAAGAGGCAAAGTCTGCCATAGCAAAACAAGCTGCCGACCAGATGAAGAATCAGGAGCAGCTAGCAGCAG 850
Query 1259 AACTTGCTGAATTCACTGCCAAGATTGCACTTCTAGAGGAAGCCAAGAAGAAAAAGGAAGAGGAAGCTACTGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 AACTTGCTGAATTCACTGCCAAGATTGCACTTCTAGAGGAAGCCAAGAAGAAAAAGGAAGAGGAAGCTACTGAG 924
Query 1333 TGGCAACACAAAGCTTTTGCAGCCCAGGAAGACTTGGAAAAGACCAAAGAAGAGTTAAAAACTGTGATGTCTGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 TGGCAACACAAAGCTTTTGCAGCCCAGGAAGACTTGGAAAAGACCAAAGAAGAGTTAAAAACTGTGATGTCTGC 998
Query 1407 CCCCCCTCCACCTCCACCACCACCAGTCATTCCTCCAACAGAAAACGAACATGATGAACACGATGAGAATAATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 CCCCCCTCCACCTCCACCACCACCAGTCATTCCTCCAACAGAAAACGAACATGATGAACACGATGAGAATAATG 1072
Query 1481 CTGAAGCTAGTGCTGAATTATCAAATGAAGGGGTAATGAACCATAGAAGCGAGGAAGAACGTGTAACCGAAACA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 CTGAAGCTAGTGCTGAATTATCAAATGAAGGGGTAATGAACCATAGAAGCGAGGAAGAACGTGTAACCGAAACA 1146
Query 1555 CAGAAAAATGAGCGTGTTAAGAAGCAACTTCAGGCATTAAGTTCAGAATTAGCCCAAGCCAGAGATGAAACCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 CAGAAAAATGAGCGTGTTAAGAAGCAACTTCAGGCATTAAGTTCAGAATTAGCCCAAGCCAGAGATGAAACCAA 1220
Query 1629 GAAAACACAAAATGATGTTCTTCATGCTGAGAATGTTAAAGCAGGCCGTGATAAGTACAAGACTCTGCGACAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221 GAAAACACAAAATGATGTTCTTCATGCTGAGAATGTTAAAGCAGGCCGTGATAAGTACAAGACTCTGCGACAGA 1294
Query 1703 TTCGACAAGGCAATACAAAGCAGCGTATCGATGAGTTTGAAGCAATG 1749
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 TTCGACAAGGCAATACAAAGCAGCGTATCGATGAGTTTGAAGCAATG 1341
