Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06863
- Subject:
- NM_001199003.1
- Aligned Length:
- 1471
- Identities:
- 1265
- Gaps:
- 71
Alignment
Query 1 ATGGCCCAGGGGAATAATTATGGGCAGACCAGCAACGGGGTGGCCGATGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG 74
|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCAGGGAAATAATTATGGACAGACCAGCAACGGGGTGGCGGACGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG 74
Query 75 AAAGATGGAAGACGTCATAGCACGGATGCAAGATGAAAAAAATGGAATTCCTATTCGTACGGTCAAAAGCTTTC 148
||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 AAAGATGGAAGATGTCATAGCACGTATGCAAGACGAGAAAAACGGAATTCCCATCCGTACCGTCAAAAGCTTCC 148
Query 149 TTTCCAAGATACCTAGCGTCTTCTCTGGTTCAGACATTGTTCAATGGTTGATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT 222
||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTTCCAAGATCCCCAGTGTGTTCTCCGGGTCAGACATTGTTCAATGGTTAATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT 222
Query 223 CCAGTGGAGGCGCTCCATTTGGGAACATTAATGGCTGCCCACGGCTACTTCTTTCCAATCTCAGATCATGTCCT 296
|||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAGTGGAGGCTCTCCATTTGGGAACGCTAATGGCTGCCCATGGCTACTTCTTTCCCATCTCAGATCATGTCCT 296
Query 297 CACACTCAAGGATGATGGCACCTTTTACCGGTTTCAAACCCCCTATTTTTGGCCATCAAATTGTTGGGAGCCGG 370
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CACACTCAAGGATGACGGCACCTTCTACCGGTTTCAAACACCCTATTTTTGGCCGTCAAATTGTTGGGAGCCAG 370
Query 371 AAAACACAGATTATGCCGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCACGACTGGAGCTCGCAGACTAT 444
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 371 AAAACACAGACTATGCTGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCAAGGCTAGAGCTAGCAGATTAT 444
Query 445 GAGGCTGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTCATGCAAGCAGAAGC 518
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGCCGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTTATGCAAGCAGAAGC 518
Query 519 ACAAGCAAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAGATTGAAAGGAAGATCCTTGACAGCCAAGAGAGAGCGTTCTGGG 592
||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 519 ACAAGCTAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAAATTGAAAGGAAGATCCTCGATAGTCAAGAGAGAGCATTCTGGG 592
Query 593 ACGTGCACAGGCCCGTGCCTGGATGTGTAAATACAACTGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCAGAATGAGAAAC 666
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 593 ATGTCCACAGGCCTGTGCCTGGATGTGTAAATACTACAGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCCGGATGAGAAAC 666
Query 667 CCCCACAAAACACGGAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGATATTAGAAGTCACAGTCCTACCCACACACCCAC 740
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 667 CCACACAAAACACGAAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGACATCCGAAGTCACAGTCCCACCCACACACCTAC 740
Query 741 ACCAGAAACTAAACCTCCAACAGAAGATGAGTTACAACAACAGATAAAATATTGGCAAATACAGTTAGATAGAC 814
|||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCAGAAACCAAGCCTCCTACAGAAGATGAGCTGCACCAACAGATAAAATACTGGCAAATACAGTTAGATAGAC 814
Query 815 ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTCGCTGACAGTCTACTAAGTTACACGGAACAGTATTTAGAATACGACCCGTTT 888
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 815 ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTTGCTGATAGTCTACTAAGCTATACGGAACAGTATGTAGAATATGACCCGTTT 888
Query 889 CTTTTGCCACCTGACCCTTCTAACCCATGGCTGTCCGATGACACCACTTTCTGGGAACTTGAGGCAAGCAAAGA 962
|||.||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 CTTGTGCCGCCTGACCCTTCCAATCCATGGCTCTCAGATGATACGACTTTCTGGGAACTTGAAGCAAGCAAAGA 962
Query 963 ACCGAGCCAGCAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGCATGGACGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGAGAGAAC 1036
|||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 963 ACCAAGTCAACAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGTATGGATGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGCGAGAGC 1036
Query 1037 AGTTCCTTAAATTTCTAGAGTCAGAATTCAGCTCGGAAAATTTAAGATTCTGGCTGGCAGTGGAGGACCTGAAA 1110
||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 AGTTCCTTAAGTTTCTAGAATCAGAATTCAGCTCAGAGAACTTAAGGTTCTGGTTGGCAGTGGAGGACCTGAAG 1110
Query 1111 AAGAGGCCTATTAAAGAAGTACCCTCAAGAGTTCAGGAAATATGGCAAGAGTTTCTGGCTCCCGGAGCCCCCAG 1184
|..||||||||...|||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1111 AGAAGGCCTATCCGAGAGGTCCCCTCGAGAGTGCAGGAAATATGGCAAGAATTTCTGGCTCCTGGGGCCCCCAG 1184
Query 1185 TGCTATTAACTTGGATTCCAAGAGTTATGACAAAACCACACATAACGTGAAGGAACCTGGACGATACACATTTG 1258
|||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCATTAACTTGGATTCTAAGAGTTATGACAAGACCACACAGAATGTGAAGGAACCAGGACGATACACATTTG 1258
Query 1259 AAGATGCTCAGGAGCACATTTACAAACTGATGAAAAGTGATTCATACCCACGTTTTATAAGATCCAGTGCCTAT 1332
||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259 AAGATGCTCAGGAGCATATTTACAAGCTGATGAAGAGCGACTCATACCCCCGCTTTATAAGATCTAGTGCCTAC 1332
Query 1333 CAGGAGCTTCTACAGGCAAAGAAAAA-----GTCTGGAAA-----CTCAATGGATCGCAGAACATCTTTTGAAA 1396
|||||.||||||||||||||||.||| |.|..|||| |||.| |||.|.||
Sbjct 1333 CAGGAACTTCTACAGGCAAAGAGAAAGAGATGCCATGAAAGGCTGCTCCA-----CGCCGTAC----------- 1390
Query 1397 AATTTGCACAGAATGTGGGGAAATCTCTCACGTCCAAGAGGTTAACAAGCCTTGCTCAGTCTTAC 1461
||.|| ||||| |||||| |.||
Sbjct 1391 --TTAGC--------------------------CCAAG---------AGCCTT------TGTT-- 1410