Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06863
• Subject: NM_001357129.1
• Aligned Length: 1471
• Identities: 1117
• Gaps: 230

Alignment

Query    1  ATGGCCCAGGGGAATAATTATGGGCAGACCAGCAACGGGGTGGCCGATGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG  74
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCAGGGAAATAATTATGGACAGACCAGCAACGGGGTGGCGGACGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG  74

Query   75  AAAGATGGAAGACGTCATAGCACGGATGCAAGATGAAAAAAATGGAATTCCTATTCGTACGGTCAAAAGCTTTC  148
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  AAAGATGGAAGATGTCATAGCACGTATGCAAGACGAGAAAAACGGAATTCCCATCCGTACCGTCAAAAGCTTCC  148

Query  149  TTTCCAAGATACCTAGCGTCTTCTCTGGTTCAGACATTGTTCAATGGTTGATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT  222
            ||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTCCAAGATCCCCAGTGTGTTCTCCGGGTCAGACATTGTTCAATGGTTAATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT  222

Query  223  CCAGTGGAGGCGCTCCATTTGGGAACATTAATGGCTGCCCACGGCTACTTCTTTCCAATCTCAGATCATGTCCT  296
            |||                                                                       
Sbjct  223  CCA-----------------------------------------------------------------------  225

Query  297  CACACTCAAGGATGATGGCACCTTTTACCGGTTTCAAACCCCCTATTTTTGGCCATCAAATTGTTGGGAGCCGG  370
                                                                                      
Sbjct  226  --------------------------------------------------------------------------  225

Query  371  AAAACACAGATTATGCCGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCACGACTGGAGCTCGCAGACTAT  444
                          ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  226  --------------GCTGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCAAGGCTAGAGCTAGCAGATTAT  285

Query  445  GAGGCTGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTCATGCAAGCAGAAGC  518
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  286  GAAGCCGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTTATGCAAGCAGAAGC  359

Query  519  ACAAGCAAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAGATTGAAAGGAAGATCCTTGACAGCCAAGAGAGAGCGTTCTGGG  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  360  ACAAGCTAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAAATTGAAAGGAAGATCCTCGATAGTCAAGAGAGAGCATTCTGGG  433

Query  593  ACGTGCACAGGCCCGTGCCTGGATGTGTAAATACAACTGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCAGAATGAGAAAC  666
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  434  ATGTCCACAGGCCTGTGCCTGGATGTGTAAATACTACAGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCCGGATGAGAAAC  507

Query  667  CCCCACAAAACACGGAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGATATTAGAAGTCACAGTCCTACCCACACACCCAC  740
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  508  CCACACAAAACACGAAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGACATCCGAAGTCACAGTCCCACCCACACACCTAC  581

Query  741  ACCAGAAACTAAACCTCCAACAGAAGATGAGTTACAACAACAGATAAAATATTGGCAAATACAGTTAGATAGAC  814
            |||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  ACCAGAAACCAAGCCTCCTACAGAAGATGAGCTGCACCAACAGATAAAATACTGGCAAATACAGTTAGATAGAC  655

Query  815  ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTCGCTGACAGTCTACTAAGTTACACGGAACAGTATTTAGAATACGACCCGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct  656  ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTTGCTGATAGTCTACTAAGCTATACGGAACAGTATGTAGAATATGACCCGTTT  729

Query  889  CTTTTGCCACCTGACCCTTCTAACCCATGGCTGTCCGATGACACCACTTTCTGGGAACTTGAGGCAAGCAAAGA  962
            |||.||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  730  CTTGTGCCGCCTGACCCTTCCAATCCATGGCTCTCAGATGATACGACTTTCTGGGAACTTGAAGCAAGCAAAGA  803

Query  963  ACCGAGCCAGCAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGCATGGACGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGAGAGAAC  1036
            |||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct  804  ACCAAGTCAACAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGTATGGATGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGCGAGAGC  877

Query 1037  AGTTCCTTAAATTTCTAGAGTCAGAATTCAGCTCGGAAAATTTAAGATTCTGGCTGGCAGTGGAGGACCTGAAA  1110
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  878  AGTTCCTTAAGTTTCTAGAATCAGAATTCAGCTCAGAGAACTTAAGGTTCTGGTTGGCAGTGGAGGACCTGAAG  951

Query 1111  AAGAGGCCTATTAAAGAAGTACCCTCAAGAGTTCAGGAAATATGGCAAGAGTTTCTGGCTCCCGGAGCCCCCAG  1184
            |..||||||||...|||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  952  AGAAGGCCTATCCGAGAGGTCCCCTCGAGAGTGCAGGAAATATGGCAAGAATTTCTGGCTCCTGGGGCCCCCAG  1025

Query 1185  TGCTATTAACTTGGATTCCAAGAGTTATGACAAAACCACACATAACGTGAAGGAACCTGGACGATACACATTTG  1258
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1026  TGCCATTAACTTGGATTCTAAGAGTTATGACAAGACCACACAGAATGTGAAGGAACCAGGACGATACACATTTG  1099

Query 1259  AAGATGCTCAGGAGCACATTTACAAACTGATGAAAAGTGATTCATACCCACGTTTTATAAGATCCAGTGCCTAT  1332
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1100  AAGATGCTCAGGAGCATATTTACAAGCTGATGAAGAGCGACTCATACCCCCGCTTTATAAGATCTAGTGCCTAC  1173

Query 1333  CAGGAGCTTCTACAGGCAAAGAAAAA-----GTCTGGAAA-----CTCAATGGATCGCAGAACATCTTTTGAAA  1396
            |||||.||||||||||||||||.|||     |.|..||||     |||.|     |||.|.||           
Sbjct 1174  CAGGAACTTCTACAGGCAAAGAGAAAGAGATGCCATGAAAGGCTGCTCCA-----CGCCGTAC-----------  1231

Query 1397  AATTTGCACAGAATGTGGGGAAATCTCTCACGTCCAAGAGGTTAACAAGCCTTGCTCAGTCTTAC  1461
              ||.||                          |||||         ||||||      |.||  
Sbjct 1232  --TTAGC--------------------------CCAAG---------AGCCTT------TGTT--  1251