Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06863
- Subject:
- XM_030253949.1
- Aligned Length:
- 1471
- Identities:
- 1216
- Gaps:
- 122
Alignment
Query 1 ATGGCCCAGGGGAATAATTATGGGCAGACCAGCAACGGGGTGGCCGATGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG 74
|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCAGGGAAATAATTATGGACAGACCAGCAACGGGGTGGCGGACGAATCACCCAACATGCTGGTGTACAG 74
Query 75 AAAGATGGAAGACGTCATAGCACGGATGCAAGATGAAAAAAATGGAATTCCTATTCGTACGGTCAAAAGCTTTC 148
||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 AAAGATGGAAGATGTCATAGCACGTATGCAAGACGAGAAAAACGGAATTCCCATCCGTACCGTCAAAAGCTTCC 148
Query 149 TTTCCAAGATACCTAGCGTCTTCTCTGGTTCAGACATTGTTCAATGGTTGATAAAGAACTTAACTATAGAAGAT 222
||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 149 TTTCCAAGATCCCCAGTGTGTTCT-------------------------------------------------- 172
Query 223 CCAGTGGAGGCGCTCCATTTGGGAACATTAATGGCTGCCCACGGCTACTTCTTTCCAATCTCAGATCATGTCCT 296
|.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 173 -CCGTGGAGGCTCTCCATTTGGGAACGCTAATGGCTGCCCATGGCTACTTCTTTCCCATCTCAGATCATGTCCT 245
Query 297 CACACTCAAGGATGATGGCACCTTTTACCGGTTTCAAACCCCCTATTTTTGGCCATCAAATTGTTGGGAGCCGG 370
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 246 CACACTCAAGGATGACGGCACCTTCTACCGGTTTCAAACACCCTATTTTTGGCCGTCAAATTGTTGGGAGCCAG 319
Query 371 AAAACACAGATTATGCCGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCACGACTGGAGCTCGCAGACTAT 444
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 320 AAAACACAGACTATGCTGTTTACCTCTGCAAGAGAACAATGCAAAACAAGGCAAGGCTAGAGCTAGCAGATTAT 393
Query 445 GAGGCTGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTCATGCAAGCAGAAGC 518
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 394 GAAGCCGAGAGCCTGGCCAGGCTGCAGAGAGCATTTGCCCGGAAGTGGGAGTTCATTTTTATGCAAGCAGAAGC 467
Query 519 ACAAGCAAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAGATTGAAAGGAAGATCCTTGACAGCCAAGAGAGAGCGTTCTGGG 592
||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 468 ACAAGCTAAAGTGGACAAGAAGAGAGACAAAATTGAAAGGAAGATCCTCGATAGTCAAGAGAGAGCATTCTGGG 541
Query 593 ACGTGCACAGGCCCGTGCCTGGATGTGTAAATACAACTGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCAGAATGAGAAAC 666
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 542 ATGTCCACAGGCCTGTGCCTGGATGTGTAAATACTACAGAAGTGGACATTAAGAAGTCATCCCGGATGAGAAAC 615
Query 667 CCCCACAAAACACGGAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGATATTAGAAGTCACAGTCCTACCCACACACCCAC 740
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 616 CCACACAAAACACGAAAGTCTGTCTATGGTTTACAAAATGACATCCGAAGTCACAGTCCCACCCACACACCTAC 689
Query 741 ACCAGAAACTAAACCTCCAACAGAAGATGAGTTACAACAACAGATAAAATATTGGCAAATACAGTTAGATAGAC 814
|||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 690 ACCAGAAACCAAGCCTCCTACAGAAGATGAGCTGCACCAACAGATAAAATACTGGCAAATACAGTTAGATAGAC 763
Query 815 ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTCGCTGACAGTCTACTAAGTTACACGGAACAGTATTTAGAATACGACCCGTTT 888
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 764 ATCGGTTAAAAATGTCAAAAGTTGCTGATAGTCTACTAAGCTATACGGAACAGTATGTAGAATATGACCCGTTT 837
Query 889 CTTTTGCCACCTGACCCTTCTAACCCATGGCTGTCCGATGACACCACTTTCTGGGAACTTGAGGCAAGCAAAGA 962
|||.||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 838 CTTGTGCCGCCTGACCCTTCCAATCCATGGCTCTCAGATGATACGACTTTCTGGGAACTTGAAGCAAGCAAAGA 911
Query 963 ACCGAGCCAGCAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGCATGGACGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGAGAGAAC 1036
|||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 912 ACCAAGTCAACAGAGGGTAAAACGATGGGGTTTTGGTATGGATGAGGCATTGAAAGACCCAGTTGGGCGAGAGC 985
Query 1037 AGTTCCTTAAATTTCTAGAGTCAGAATTCAGCTCGGAAAATTTAAGATTCTGGCTGGCAGTGGAGGACCTGAAA 1110
||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 986 AGTTCCTTAAGTTTCTAGAATCAGAATTCAGCTCAGAGAACTTAAGGTTCTGGTTGGCAGTGGAGGACCTGAAG 1059
Query 1111 AAGAGGCCTATTAAAGAAGTACCCTCAAGAGTTCAGGAAATATGGCAAGAGTTTCTGGCTCCCGGAGCCCCCAG 1184
|..||||||||...|||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1060 AGAAGGCCTATCCGAGAGGTCCCCTCGAGAGTGCAGGAAATATGGCAAGAATTTCTGGCTCCTGGGGCCCCCAG 1133
Query 1185 TGCTATTAACTTGGATTCCAAGAGTTATGACAAAACCACACATAACGTGAAGGAACCTGGACGATACACATTTG 1258
|||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1134 TGCCATTAACTTGGATTCTAAGAGTTATGACAAGACCACACAGAATGTGAAGGAACCAGGACGATACACATTTG 1207
Query 1259 AAGATGCTCAGGAGCACATTTACAAACTGATGAAAAGTGATTCATACCCACGTTTTATAAGATCCAGTGCCTAT 1332
||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1208 AAGATGCTCAGGAGCATATTTACAAGCTGATGAAGAGCGACTCATACCCCCGCTTTATAAGATCTAGTGCCTAC 1281
Query 1333 CAGGAGCTTCTACAGGCAAAGAAAAA-----GTCTGGAAA-----CTCAATGGATCGCAGAACATCTTTTGAAA 1396
|||||.||||||||||||||||.||| |.|..|||| |||.| |||.|.||
Sbjct 1282 CAGGAACTTCTACAGGCAAAGAGAAAGAGATGCCATGAAAGGCTGCTCCA-----CGCCGTAC----------- 1339
Query 1397 AATTTGCACAGAATGTGGGGAAATCTCTCACGTCCAAGAGGTTAACAAGCCTTGCTCAGTCTTAC 1461
||.|| ||||| |||||| |.||
Sbjct 1340 --TTAGC--------------------------CCAAG---------AGCCTT------TGTT-- 1359