Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06889
- Subject:
- NM_001324303.2
- Aligned Length:
- 1919
- Identities:
- 1887
- Gaps:
- 31
Alignment
Query 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC 74
Query 75 CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT 148
Query 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC 222
Query 223 ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG 296
Query 297 ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC 370
Query 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT 444
Query 445 ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCA 518
Query 519 GCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGT 592
Query 593 ATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTG 666
Query 667 GGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA 740
Query 741 GTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTG 814
Query 815 TGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTG 888
Query 889 TCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCA 962
Query 963 GAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATT 1036
Query 1037 ATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCC 1110
Query 1111 ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG 1184
Query 1185 GGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGC 1258
Query 1259 TGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGC 1332
Query 1333 CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAA 1406
Query 1407 GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAA 1480
Query 1481 TCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAAC 1554
Query 1555 CTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAA 1628
Query 1629 TACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCT 1702
Query 1703 CCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTC 1776
Query 1777 TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCCTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGG 1850
Query 1851 CAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGAGAACAGCACAT-------------------------- 1893
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1851 CAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAG-----AGCACATTAGTTCCAGAAGAAAGATGGAAATTC 1914