Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06889
• Subject: NM_001324305.1
• Aligned Length: 1941
• Identities: 1892
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC  74

Query   75  CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT  148

Query  149  CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC  222

Query  223  ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG  296

Query  297  ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC  370

Query  371  AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT  444

Query  445  ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGC---------------------------------------  479
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct  445  ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCGAGGGTGTGGAGCACCGTTCTGGAATCCCGTTCGTTGTT  518

Query  480  ---------AACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCAGCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGG  544
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAGCAAGAGAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCAGCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGG  592

Query  545  AGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGTATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAA  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGTATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAA  666

Query  619  ACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTGGGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGA  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTGGGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGA  740

Query  693  TCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGG  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGG  814

Query  767  CCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTGTGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTGTGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCC  888

Query  841  GACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTGTCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGT  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTGTCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGT  962

Query  915  TAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCAGAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGG  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCAGAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGG  1036

Query  989  ATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATTATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGT  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATTATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGT  1110

Query 1063  GACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCCACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGA  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCCACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGA  1184

Query 1137  TCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGG  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGG  1258

Query 1211  GCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGCTGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAA  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGCTGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAA  1332

Query 1285  CTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCC  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCC  1406

Query 1359  AGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAAGATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCA  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAAGATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCA  1480

Query 1433  CCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAATCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTC  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAATCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTC  1554

Query 1507  ATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAACCTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCA  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAACCTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCA  1628

Query 1581  GCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAATACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGC  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAATACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGC  1702

Query 1655  CGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCTCCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACG  1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCTCCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACG  1776

Query 1729  ATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTCTACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCA  1802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTCTACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCA  1850

Query 1803  GACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGGCAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAG  1876
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACCTTGAAGTACCTGGCCATCCTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGGCAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAG  1924

Query 1877  TCAAGAGAACAGCACAT  1893
            |||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCAAGAGAACAGCACAT  1941