Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06889
- Subject:
- XM_006499023.2
- Aligned Length:
- 1941
- Identities:
- 1662
- Gaps:
- 57
Alignment
Query 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC 74
|| |.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|..|||||||||.||
Sbjct 1 AT---------GTGTTCAAGCGCTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCACTGCCAGCGTCCAGGCTCTGACCCC 65
Query 75 CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT 148
|||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.|
Sbjct 66 CACCCACTACCTCACCAAGCAGGATGTGGAAAGGCTGAAGGCCTCACTGGACCGCCCCTTCACAGATTTGGAGT 139
Query 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||..||||||||.|||||||.|
Sbjct 140 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGGGTACAGGTGCCAGATGTCAAGAAAGCGTGTACCTTC 213
Query 223 ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG 296
||||..||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 214 ATCAAGTCCAACCTTGATCCCAGCAACGTGGATTCTCTCTTCTATGCAGCCCAGTCCAGCCAGGTCCTCTCAGG 287
Query 297 ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC 370
.||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|..||.|||
Sbjct 288 CTGTGAGATATCTGTTTCAAATGAGACCAAAGAGCTCCTGCTGGCAGCAGTGAGTGAAGACTCCCCCATTGCCC 361
Query 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT 444
||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.||||||||
Sbjct 362 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCACTCAGCGGGTTTGGGCTTCCCTTGGCATCCAATGAAGCCCTCGGTGCCCTT 435
Query 445 ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCA 518
||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 436 ACCGCTCGCCTCGGCAAGGAAGAGACTGTGCTAGCAACGGTCCAGGCTCTGCAGACAGCGTCCCACCTCTCCCA 509
Query 519 GCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGT 592
|||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 510 GCAGGCTGACCTGAGGAACATTGTAGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGGCTGGATGAACTAGGGGGTGTGT 583
Query 593 ATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTG 666
||||.||||||||.|||||||||||....||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 584 ATCTGCAGTTTGAGGAAGGACTGGAGCTCACGGCGCTGTTTGTTGCTGCCACCTACAAGCTCATGGACCACGTG 657
Query 667 GGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA 740
|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 GGGACCGAACCGTCCATGAAGGAGGATCAGGTTATCCAGCTCATGAACACAATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA 731
Query 741 GTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTG 814
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||...|.||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 732 GTCCCTCTCAGAAGCCTTCAGTGTGGCCTCTGCTGCTGCTGCATTGTCCCAGAATCGCTACCACGTACCAGTGG 805
Query 815 TGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTG 888
||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||.||||.|||||||.||
Sbjct 806 TGGTTGTGCCCGAGGGCTCTACTTCTGACACTCAAGAACAGGCTATCCTGAGGTTGCAGGTCAGCAATGTTTTG 879
Query 889 TCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCA 962
||||||||||||.||||.||..|.||.||.||.||.||||||||.||.|..|||.||||.||.||.|||||.||
Sbjct 880 TCTCAGCCTCTGGCTCAAGCTGCAGTGAAGCTGGAGCATGCTAAGTCGGCGGCTACCAGGGCTACCGTCCTGCA 953
Query 963 GAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATT 1036
||||||..||||..|.|.|||.|||.||||||||||.|||||.||||.|||.||.|||.||||||||||.||.|
Sbjct 954 GAAGACGCCCTTTTCGCTTGTGGGGAATGTTTTTGAGCTAAACTTCAAGAATGTTAAACTTTCCAGTGGCTACT 1027
Query 1037 ATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCC 1110
||||||||..||||..||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1028 ATGACTTCTCTGTCCGAGTTGAAGGTGACAGCCGTTACATTGCAAACACTGTAGAGCTTCGAGTCAAGATCTCC 1101
Query 1111 ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACTGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG 1175
Query 1185 GGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGC 1258
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct 1176 GGTGACCTACCCAGCCAAAGCCAAGGGTACATTCATCGCAGACAGCCATCAGAACTTTGCCCTGTTTTTCCAGC 1249
Query 1259 TGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGC 1332
||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1250 TGGTAGATGTGAACACCGGTGCGGAGCTCACCCCTCACCAGACGTTTGTTCGACTTCATAACCAGAAGACTGGC 1323
Query 1333 CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAA 1406
||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1324 CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCTGAGCCAGATAACAAGAATGTATATAAGTTTGAACTGGACACCTCTGAAAGGAA 1397
Query 1407 GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAA 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1398 GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACACTCTACTTAATCATCGGGGATGCCACATTGAAGAACCCAA 1471
Query 1481 TCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAAC 1554
||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||.|
Sbjct 1472 TCCTCTGGAACGTGGCTGACGTGGTTATCAAGTTCCCTGAGGAGGAAGCCCCCTCGACTGTGCTGTCCCAGAGC 1545
Query 1555 CTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAA 1628
||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1546 CTGTTTACCCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGAGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACAGTGGTGTCCAA 1619
Query 1629 TACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCT 1702
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1620 TACATTCACGGCCCTCATCCTCTCGCCCTTGCTCCTGCTCTTTGCACTGTGGATCCGGATTGGAGCCAATGTCT 1693
Query 1703 CCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTC 1776
||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||
Sbjct 1694 CCAACTTCACATTTGCTCCTAGCACAGTTATCTTCCACCTGGGACATGCTGCGATGCTGGGCCTCATGTATATC 1767
Query 1777 TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||..||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1768 TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCCTCAAGTACCTGGCTGTCCTGGGCACTGTGACGTTTCTGGCTGG 1841
Query 1851 CAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGA------------------------------------------ 1882
|||.||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1842 CAACCGAATGCTGGCCCAGCATGCAGTTAAGAGGATCGCTGCAGAGCAGAGCAGTAGATTGGCAAAATATAGGA 1915
Query 1883 ------GAACAGCACAT 1893
|||||||||||
Sbjct 1916 CACTACGAACAGCACAT 1932