Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06902
• Subject: NM_001318064.1
• Aligned Length: 792
• Identities: 695
• Gaps: 97

Alignment

Query   1  MHVIKRDGRQERVMFDKITSRIQKLCYGLNMDFVDPAQITMKVIQGLYSGVTTVELDTLAAETAATLTTKHPDY  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AILAARIAVSNLHKETKKVFSDVMEDLYNYINPHNGKHSPMVAKSTLDIVLANKDRLNSAIIYDRDFSYNYFGF  148
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------MEDLYNYINPHNGKHSPMVAKSTLDIVLANKDRLNSAIIYDRDFSYNYFGF  51

Query 149  KTLERSYLLKINGKVAERPQHMLMRVSVGIHKEDIDAAIETYNLLSERWFTHASPTLFNAGTNRPQLSSCFLLS  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  52  KTLERSYLLKINGKVAERPQHMLMRVSVGIHKEDIDAAIETYNLLSERWFTHASPTLFNAGTNRPQLSSCFLLS  125

Query 223  MKDDSIEGIYDTLKQCALISKSAGGIGVAVSCIRATGSYIAGTNGNSNGLVPMLRVYNNTARYVDQGGNKRPGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126  MKDDSIEGIYDTLKQCALISKSAGGIGVAVSCIRATGSYIAGTNGNSNGLVPMLRVYNNTARYVDQGGNKRPGA  199

Query 297  FAIYLEPWHLDIFEFLDLKKNTGKEEQRARDLFFALWIPDLFMKRVETNQDWSLMCPNECPGLDEVWGEEFEKL  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200  FAIYLEPWHLDIFEFLDLKKNTGKEEQRARDLFFALWIPDLFMKRVETNQDWSLMCPNECPGLDEVWGEEFEKL  273

Query 371  YASYEKQGRVRKVVKAQQLWYAIIESQTETGTPYMLYKDSCNRKSNQQNLGTIKCSNLCTEIVEYTSKDEVAVC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274  YASYEKQGRVRKVVKAQQLWYAIIESQTETGTPYMLYKDSCNRKSNQQNLGTIKCSNLCTEIVEYTSKDEVAVC  347

Query 445  NLASLALNMYVTSEHTYDFKKLAEVTKVVVRNLNKIIDINYYPVPEACLSNKRHRPIGIGVQGLADAFILMRYP  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348  NLASLALNMYVTSEHTYDFKKLAEVTKVVVRNLNKIIDINYYPVPEACLSNKRHRPIGIGVQGLADAFILMRYP  421

Query 519  FESAEAQLLNKQIFETIYYGALEASCDLAKEQGPYETYEGSPVSKGILQYDMWNVTPTDLWDWKVLKEKIAKYG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422  FESAEAQLLNKQIFETIYYGALEASCDLAKEQGPYETYEGSPVSKGILQYDMWNVTPTDLWDWKVLKEKIAKYG  495

Query 593  IRNSLLIAPMPTASTAQILGNNESIEPYTSNIYTRRVLSGEFQIVNPHLLKDLTERGLWHEEMKNQIIACNGSI  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496  IRNSLLIAPMPTASTAQILGNNESIEPYTSNIYTRRVLSGEFQIVNPHLLKDLTERGLWHEEMKNQIIACNGSI  569

Query 667  QSIPEIPDDLKQLYKTVWEISQKTVLKMAAERGAFIDQSQSLNIHIAEPNYGKLTSMHFYGWKQGLKTGMYYLR  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570  QSIPEIPDDLKQLYKTVWEISQKTVLKMAAERGAFIDQSQSLNIHIAEPNYGKLTSMHFYGWKQGLKTGMYYLR  643

Query 741  TRPAANPIQFTLNKEKLKDKEKVSKEEEEKERNTAAMVCSLENRDECLMCGS  792
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644  TRPAANPIQFTLNKEKLKDKEKVSKEEEEKERNTAAMVCSLENRDECLMCGS  695