Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06926
• Subject: NM_023281.1
• Aligned Length: 2003
• Identities: 1735
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATGTCGGGGGTCCGGGGC-CTGTCGCGGCTGCTGAGCGCTCGGCGCCTGGCG----CTGGCCAAGGCGTGGCC-  68
            |||.|.||||| .||.|| .|.|||.||||.||..|||..||||||.|||||    ||||    ||||||||| 
Sbjct    1  ATGGCCGGGGT-TGGCGCAGTTTCGAGGCTTCTTCGCGGGCGGCGCTTGGCGTTAACTGG----GGCGTGGCCA  69

Query   69  --AACAGTGTTGC---AAACAGGAACCCGAGGTTTTCACTTCACTGTTGATGGGAACAAGAGGGCATCTGCTAA  137
              ||||.|    |   ||||||  |||.|.||.|||||||||.||||||.||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct   70  GGAACACT----CCAAAAACAG--ACCTGCGGCTTTCACTTCTCTGTTGGTGAGAACAAGAAGGCATCAGCTAA  137

Query  138  AGTTTCAGATTCCATTTCTGCTCAGTATCCAGTAGTGGATCATGAATTTGATGCAGTGGTGGTAGGCGCTGGAG  211
            ||||||||||.|.||||||.||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  138  AGTTTCAGATGCAATTTCTACTCAATACCCAGTGGTGGATCATGAATTTGATGCTGTGGTTGTAGGCGCTGGAG  211

Query  212  GGGCAGGCTTGCGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACAGCATGTGTTACCAAGCTGTTTCCT  285
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||||.||||||
Sbjct  212  GGGCAGGCTTGCGAGCTGCATTTGGCCTTTCTGAGGCAGGGTTTAATACTGCATGCCTTACAAAGCTCTTTCCT  285

Query  286  ACCAGGTCACACACTGTTGCAGCACAGGGAGGAATCAATGCTGCTCTGGGGAACATGGAGGAGGACAACTGGAG  359
            |||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  286  ACCCGATCACATACTGTTGCAGCACAGGGAGGTATCAATGCTGCTCTGGGGAACATGGAAGAGGACAACTGGAG  359

Query  360  GTGGCATTTCTACGACACCGTGAAGGGCTCCGACTGGCTGGGGGACCAGGATGCCATCCACTACATGACGGAGC  433
            .|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  360  ATGGCATTTCTATGACACTGTGAAAGGCTCCGACTGGCTGGGGGATCAGGATGCCATCCATTACATGACAGAGC  433

Query  434  AGGCCCCCGCCGCCGTGGTCGAGCTAGAAAATTATGGCATGCCGTTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTAT  507
            |.||.||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  AAGCTCCTGCCTCTGTGGTTGAGCTAGAAAATTATGGTATGCCATTTAGCAGAACTGAAGATGGGAAGATTTAT  507

Query  508  CAGCGTGCATTTGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGAAAGGGCGGGCAGGCCCATCGGTGCTGCTGTGTGGCTGA  581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  508  CAGCGTGCATTTGGTGGACAGAGCCTCAAGTTTGGGAAAGGCGGGCAGGCTCATCGGTGTTGCTGTGTGGCTGA  581

Query  582  TCGGACTGGCCACTCGCTATTGCACACCTTATATGGAAGGTCTCTGCGATATGATACCAGCTATTTTGTGGAGT  655
            ||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  582  TCGGACAGGCCACTCACTCTTACACACGTTGTATGGAAGATCTCTGCGATATGACACCAGTTATTTTGTGGAAT  655

Query  656  ATTTTGCCTTGGATCTCCTGATGGAGAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATCGCACTGTGCATAGAGGACGGGTCC  729
            |||||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  656  ATTTTGCACTGGATCTTCTGATGGAAAATGGGGAGTGCCGTGGTGTCATTGCACTGTGCATAGAAGATGGGTCC  729

Query  730  ATCCATCGCATAAGAGCAAAGAACACTGTTGTTGCCACAGGAGGCTACGGGCGCACCTACTTCAGCTGCACGTC  803
            ||.||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  730  ATACACCGAATAAGAGCAAAAAACACTGTTATTGCTACTGGGGGCTACGGGCGAACCTACTTCAGCTGTACATC  803

Query  804  TGCCCACACCAGCACTGGCGACGGCACGGCCATGATCACCAGGGCAGGCCTTCCTTGCCAGGACCTAGAGTTTG  877
            ||||||.||||||||.||.||||||||.||||||.||||.|||||.||..|.||||||||||||.||||.||||
Sbjct  804  TGCCCATACCAGCACAGGGGACGGCACAGCCATGGTCACTAGGGCTGGTTTGCCTTGCCAGGACTTAGAATTTG  877

Query  878  TTCAGTTCCACCCCACAGGCATATATGGTGCTGGTTGTCTCATTACGGAAGGATGTCGTGGAGAGGGAGGCATT  951
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  878  TTCAGTTCCACCCCACAGGTATATACGGTGCTGGCTGCCTCATCACAGAAGGGTGTCGTGGAGAGGGGGGGATT  951

Query  952  CTCATTAACAGTCAAGGCGAAAGGTTTATGGAGCGATACGCCCCTGTCGCGAAGGACCTGGCGTCTAGAGATGT  1025
            |||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  952  CTCATCAACAGTCAAGGTGAAAGGTTCATGGAGAGATACGCACCTGTTGCCAAGGACCTGGCATCAAGAGATGT  1025

Query 1026  GGTGTCTCGGTCCATGACTCTGGAGATCCGAGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGC  1099
            .||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  TGTGTCTCGATCCATGACTCTTGAGATCCGTGAAGGAAGAGGCTGTGGCCCTGAGAAAGATCACGTCTACCTGC  1099

Query 1100  AGCTGCACCACCTACCTCCAGAGCAGCTGGCCACGCGCCTGCCTGGCATTTCAGAGACAGCCATGATCTTCGCT  1173
            ||.||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1100  AGTTGCATCATCTGCCTCCTGAGCAACTGGCCACACGTCTACCCGGAATTTCAGAGACGGCCATGATCTTCGCT  1173

Query 1174  GGCGTGGACGTCACGAAGGAGCCGATCCCTGTCCTCCCCACCGTGCATTATAACATGGGCGGCATTCCCACCAA  1247
            ||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1174  GGTGTGGATGTCACTAAGGAGCCCATCCCAGTCCTCCCCACTGTGCATTACAACATGGGTGGGATTCCCACTAA  1247

Query 1248  CTACAAGGGGCAGGTCCTGAGGCACGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCCGGCCTGTACGCCTGTGGGGAGG  1321
            |||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1248  CTACAAGGGACAGGTGCTGAAGCATGTGAATGGCCAGGATCAGATTGTGCCTGGTCTGTATGCCTGTGGGGAGG  1321

Query 1322  CCGCCTGTGCCTCGGTACATGGTGCCAACCGCCTCGGGGCAAACTCGCTCTTGGACCTGGTTGTCTTTGGTCGG  1395
            |.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||..|.
Sbjct 1322  CTGCCTGCGCCTCAGTGCATGGTGCCAACCGGCTTGGAGCAAATTCTCTCTTGGACCTTGTAGTCTTTGGCAGA  1395

Query 1396  GCATGTGCCCTGAGCATCGAAGAGTCATGCAGGCCTGGAGATAAAGTCCCTCCAATTAAACCAAACGCTGGGGA  1469
            ||.||||||||||||||.|.|||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||..||||.|||||.||
Sbjct 1396  GCCTGTGCCCTGAGCATTGCAGAATCTTGCAGGCCTGGAGATAAAGTTCCTTCAATTAAGGCAAATGCTGGAGA  1469

Query 1470  AGAATCTGTCATGAATCTTGACAAATTGAGATTTGCTGATGGAAGCATAAGAACATCGGAACTGCGACTCAGCA  1543
            ||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|.||
Sbjct 1470  AGAATCGGTTATGAATCTTGACAAGTTGAGATTTGCCGATGGAAGTATAAGAACATCAGAACTACGCCTAAACA  1543

Query 1544  TGCAGAAGTCAATGCAAAATCATGCTGCCGTGTTCCGTGTGGGAAGCGTGTTGCAAGAAGGTTGTGGGAAAATC  1617
            ||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||..||||||
Sbjct 1544  TGCAGAAGTCGATGCAGAACCATGCTGCAGTGTTCCGTGTGGGGAGTGTATTGCAAGAAGGCTGTGAAAAAATC  1617

Query 1618  AGCAAGCTCTATGGAGACCTAAAGCACCTGAAGACGTTCGACCGGGGAATGGTCTGGAACACGGACCTGGTGGA  1691
            ||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1618  AGTCAGCTCTATGGAGACCTAAAGCATCTAAAGACATTCGACAGGGGAATGGTTTGGAACACAGACCTGGTGGA  1691

Query 1692  GACCCTGGAGCTGCAGAACCTGATGCTGTGTGCGCTGCAGACCATCTACGGAGCAGAGGCACGGAAGGAGTCAC  1765
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1692  GACCCTGGAGCTGCAGAATCTGATGCTGTGCGCACTGCAGACCATATATGGTGCAGAAGCTCGGAAGGAGTCCC  1765

Query 1766  GGGGCGCGCATGCCAGGGAAGACTACAAGGTGCGGATTGATGAGTACGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGGCAA  1839
            ||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1766  GGGGAGCCCATGCCAGGGAAGATTACAAAGTGCGGGTCGATGAGTATGATTACTCCAAGCCCATCCAGGGACAG  1839

Query 1840  CAGAAGAAGCCCTTTGAGGAGCACTGGAGGAAGCACACCCTGTCCTATGTGGACGTTGGCACTGGGAAGGTCAC  1913
            |||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|....|||||.|||||.||
Sbjct 1840  CAGAAGAAGCCGTTTGGGGAACACTGGAGGAAGCACACCCTCTCATATGTGGACATCAAGACTGGCAAGGTTAC  1913

Query 1914  TCTGGAATATAGACCCGTGATCGACAAAACTTTGAACGAGGCTGACTGTGCCACCGTCCCGCCAGCCATTCGCT  1987
            |.||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||
Sbjct 1914  TTTGGAGTACAGACCTGTTATCGACAAGACCTTGAATGAGGCTGACTGTGCCACCGTACCTCCTGCTATCCGCT  1987

Query 1988  CCTAC  1992
            |||||
Sbjct 1988  CCTAC  1992