Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06941
• Subject: NM_011891.4
• Aligned Length: 870
• Identities: 784
• Gaps: 3

Alignment

Query   1  ATGATGCCTCAGGAGCAGTACACTCACCACCGGAGCACCATGCCTGGCTCTGTGGGGCCACAGGTATACAAGGT  74
              |||||||||||.|||||..|.||||||.|||||||||||||..||||||.|||||||||..|||||||.||
Sbjct   1  ---ATGCCTCAGGAACAGTATTCCCACCACAGGAGCACCATGCCCAGCTCTGAGGGGCCACACATATACAAAGT  71

Query  75  GGGGATTTACGGCTGGCGGAAACGATGCCTGTATTTCTTTGTCCTGCTCCTCATGATTTTAATACTGGTGAACT  148
           ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  72  GGGGATTTACGGCTGGAGGAAAAGATGCCTGTATTTCTTTGTCCTGCTCCTCATGATTTTAATACTGGTGAACT  145

Query 149  TGGCCATGACCATCTGGATTCTCAAAGTCATGAACTTCACAATTGATGGAATGGGAAACCTGAGGATCACAGAA  222
           |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||
Sbjct 146  TGGCCATGACCATCTGGATTCTCAAGGTCATGAACTTCACAATTGATGGAATGGGAAACTTAAGAATCACAGAA  219

Query 223  AAAGGTCTAAAGCTAGAAGGAGACTCTGAATTCTTACAACCTCTCTACGCCAAAGAAATCCAGTCCCGACCAGG  296
           ||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 220  AAGGGTCTGAAGCTAGAAGGAGACTCAGAATTCTTACAACCTCTCTACGCCAAAGAAATCAAGTCCCGACCAGG  293

Query 297  TAATGCCCTGTACTTCAAGTCTGCCAGAAATGTTACAGTGAACATTCTCAATGACCAGACTAAAGTGCTAACTC  370
           |||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 294  TAATGCCCTATACTTCAAATCTGCCAGGAACGTGACAGTGAACATTCTCAATGATCAGACAAAAGTGCTGACTC  367

Query 371  AGCTTATAACAGGTCCAAAAGCCGTAGAAGCTTATGGTAAAAAATTTGAGGTAAAAACTGTTTCTGGAAAATTG  444
           ||||..|.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||..|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368  AGCTGGTGACAGGTCCGAAGGCTGTGGAAGCATATGGCAAAAGGTTTGAAGTAAAAACTGTTTCTGGAAAATTG  441

Query 445  CTCTTCTCTGCAGACAATAATGAAGTGGTAGTAGGAGCTGAAAGATTACGAGTTTTAGGAGCGGAGGGCACAGT  518
           |||||.|||||.||..|.|.|||||||||.||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 442  CTCTTTTCTGCGGATGACAGTGAAGTGGTCGTGGGAGCTGAGAGATTGAGAGTCTTAGGAGCTGAAGGCACAGT  515

Query 519  GTTCCCTAAATCTATAGAAACACCTAATGTCAGGGCAGACCCCTTCAAAGAACTAAGGTTGGAGTCCCCAACCC  592
           .|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516  CTTCCCCAAATCCATAGAAACACCTAATGTCAGAGCAGACCCCTTCAAGGAACTAAGGTTGGAGTCCCCAACCC  589

Query 593  GGTCTCTAGTGATGGAGGCCCCAAAAGGAGTGGAAATCAATGCAGAAGCTGGCAATATGGAAGCCACCTGCAGG  666
           |.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 590  GATCTCTAGTGATGGAAGCCCCAAAAGGAGTAGAAATAAATGCAGAAGCTGGCAATATGGAAGCCATCTGCAGA  663

Query 667  ACAGAGCTGAGACTGGAATCCAAAGATGGAGAGATTAAGTTAGATGCTGCGAAAATCAGGCTACCTAGACTGCC  740
           |..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 664  AGTGAGCTGAGACTGGAGTCCAAGGATGGAGAGATTAAGTTAGATGCTGCGAAAATCAAACTACCTAGACTGCC  737

Query 741  TCATGGATCCTACACGCCTACAGGAACGAGGCAGAAGGTCTTCGAGATCTGCGTCTGCGCCAATGGGAGATTAT  814
           ||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 738  TCGTGGATCCTACACACCCACAGGAACGAGGCAGAAGGTCTTCGAGGTCTGCGTCTGCGCCAATGGGAGGTTAT  811

Query 815  TCCTGTCTCAGGCAGGAGCTGGGTCCACTTGTCAGATAAACACAAGTGTCTGCCTC  870
           |||||||.|||||||||.||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 812  TCCTGTCCCAGGCAGGAACTGGTTCTACCTGTCAGATAAACACAAGTGTCTGCCTT  867