Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06943
- Subject:
- NM_018822.3
- Aligned Length:
- 1512
- Identities:
- 1275
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGAGCTGCCCCGTGCCCGCCTGCTGCGCGCTGCTGCTAGTCCTGGGGCTCTGCCGGGCGCGTCCCCGGAACGC 74
|||..||||||.|..|..|||||||||.|..|.|||.|.||||||||.||||||.|.||||...|.||.||||.
Sbjct 1 ATGCACTGCCCGGGACTGGCCTGCTGCACAATTCTGTTGGTCCTGGGACTCTGCGGCGCGCACTCGCGCAACGT 74
Query 75 ACTGCTGCTCCTCGCGGATGACGGAGGCTTTGAGAGTGGCGCGTACAACAACAGCGCCATCGCCACCCCGCACC 148
.||.|||.|..|.||||||||||||||||||||||||||.|..||||||||||..||||||||||||||.||||
Sbjct 75 GCTACTGATAGTTGCGGATGACGGAGGCTTTGAGAGTGGTGTATACAACAACACTGCCATCGCCACCCCTCACC 148
Query 149 TGGACGCCTTGGCCCGCCGCAGCCTCCTCTTTCGCAATGCCTTCACCTCGGTCAGCAGCTGCTCTCCCAGCCGC 222
||||.|||.||.||||||.||||||..||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 149 TGGATGCCCTGTCCCGCCACAGCCTTATCTTCCGTAACGCCTTCACGTCTGTCAGCAGCTGTTCCCCGAGCCGT 222
Query 223 GCCAGCCTCCTCACTGGCCTGCCCCAGCATCAGAATGGGATGTACGGGCTGCACCAGGACGTGCACCACTTCAA 296
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 223 GCCAGCCTCCTCACCGGCCTGCCCCAGCATCAGAATGGCATGTATGGGCTGCACCAGGATGTGCATCACTTCAA 296
Query 297 CTCCTTCGACAAGGTGCGGAGCCTGCCGCTGCTGCTCAGCCAAGCTGGTGTGCGCACAGGCATCATCGGGAAGA 370
|||.||.||||||||.|.||||||.|||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 CTCTTTTGACAAGGTACAGAGCCTTCCGCTGCTGCTCAACCAGGCCGGAGTGCGCACAGGCATCATTGGGAAGA 370
Query 371 AGCACGTGGGGCCGGAGACCGTGTACCCGTTTGACTTTGCGTACACGGAGGAGAATGGCTCCGTCCTCCAGGTG 444
||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|.|||.||||||||..||||.||..|.||||||
Sbjct 371 AGCACGTGGGTCCGGAGACGGTGTATCCCTTTGACTTTGCATTCACAGAGGAGAACAGCTCTGTGATGCAGGTG 444
Query 445 GGGCGGAACATCACTAGAATTAAGCTGCTCGTCCGGAAATTCCTGCAGACTCAGGATGACCGGCCTTTCTTCCT 518
|||||||||||||||||||||||||..||.||||.||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct 445 GGGCGGAACATCACTAGAATTAAGCAACTGGTCCAGAAATTTCTGCAGACTCAGGATGACAGGCCCTTCTTCCT 518
Query 519 CTACGTCGCCTTCCACGACCCCCACCGCTGTGGGCACTCCCAGCCCCAGTACGGAACCTTCTGTGAGAAGTTTG 592
.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTACGTGGCTTTCCATGACCCGCACCGCTGTGGGCACTCTCAGCCCCAGTATGGAACCTTCTGTGAGAAGTTTG 592
Query 593 GCAACGGAGAGAGCGGCATGGGTCGT--ATCCCAGACTGGACCCCCCAGGCCTACGACCCACTGGACGTGCTGG 664
|||||||||||||.||.||||| || ||.|||||||||||.||||||..|||||||||.|.|||.|||.|||
Sbjct 593 GCAACGGAGAGAGTGGAATGGG--GTACATTCCAGACTGGACACCCCAGATCTACGACCCTCAGGATGTGATGG 664
Query 665 TGCCTTACTTCGTCCCCAACACCCCGGCAGCCCGAGCCGACCTGGCCGCTCAGTACACCACCGTAGGCCGCATG 738
||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.||.||.|||
Sbjct 665 TGCCCTACTTTGTCCCGGACACACCAGCAGCCCGAGCAGACCTAGCTGCTCAGTACACCACCATCGGGCGGATG 738
Query 739 GACCAAGGAGTTGGACTGGTGCTCCAGGAGCTGCGTGACGCCGGTGTCCTGAACGACACACTGGTGATCTTCAC 812
||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|..||.|||||.|||||||||||.||..|.||||||||
Sbjct 739 GACCAAGGGGTAGGTCTGGTGCTCCAGGAGCTGCGAGGTGCTGGTGTGCTGAACGACACCCTCATCATCTTCAC 812
Query 813 GTCCGACAACGGGATCCCCTTCCCCAGCGGCAGGACCAACCTGTACTGGCCGGGCACTGCTGAACCCTTACTGG 886
.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 813 ATCTGACAATGGTATCCCTTTCCCCAGCGGCAGGACCAACCTGTACTGGCCCGGTACAGCCGAGCCTTTGCTGG 886
Query 887 TGTCATCCCCGGAGCACCCAAAACGCTGGGGCCAAGTCAGCGAGGCCTACGTGAGCCTCCTAGACCTCACGCCC 960
|||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 887 TGTCATCTCCAGAGCACCCACAGCGCTGGGGCCAGGTCAGCGACGCCTACGTGAGCCTTCTAGACCTCACCCCT 960
Query 961 ACCATCTTGGATTGGTTCTCGATCCCGTACCCCAGCTACGCCATCTTTGGCTCGAAGACCATCCACCTCACTGG 1034
||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 961 ACCATCCTGGACTGGTTCTCCATCCCGTACCCCAGCTATGCCATCTTTGGCTCAAAGACGATCCAGCTCACAGG 1034
Query 1035 CCGGTCCCTCCTGCCGGCGCTGGAGGCCGAGCCCCTCTGGGCCACCGTCTTTGGCAGCCAGAGCCACCACGAGG 1108
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 CCGATCCCTCCTGCCGGCGCTGGAGGCAGAGCCCCTTTGGGCCACTGTCTTCAGCAGCCAGAGCCACCACGAGG 1108
Query 1109 TCACCATGTCCTACCCCATGCGCTCCGTGCAGCACCGGCACTTCCGCCTCGTGCACAACCTCAACTTCAAGATG 1182
||||||||||||||||.||||||||.|||.|.||||.|.|||||||||||.|.||||||||.|.||||||||||
Sbjct 1109 TCACCATGTCCTACCCGATGCGCTCGGTGTACCACCAGAACTTCCGCCTCATTCACAACCTGAGCTTCAAGATG 1182
Query 1183 CCCTTTCCCATCGACCAGGACTTCTACGTCTCACCCACCTTCCAGGACCTCCTGAACCGCACTACAGCTGGTCA 1256
||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||..|.||.|.
Sbjct 1183 CCATTTCCCATCGACCAAGATTTCTATGTCTCGCCGACCTTCCAGGACCTCCTGAACCGAACCACCACAGGCCG 1256
Query 1257 GCCCACGGGCTGGTACAAGGACCTCCGTCATTACTACTACCGGGCGCGCTGGGAGCTCTACGACCGGAGCCGGG 1330
||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||..||||||||.|||||||||...|||||||
Sbjct 1257 GCCCACGGGCTGGTACAAGGACCTCCACCGTTACTACTACCGGGAACGCTGGGAACTCTACGACATCAGCCGGG 1330
Query 1331 ACCCCCACGAGACCCAGAACCTGGCCACCGACCCGCGCTTTGCTCAGCTTCTGGAGATGCTTCGGGA----CCA 1400
||||.|..|||||.|.||||||||||.|.|||||...|||.|||||..|.||||||||||| || .||
Sbjct 1331 ACCCTCGAGAGACACGGAACCTGGCCGCTGACCCAGACTTGGCTCAAGTGCTGGAGATGCT----GAAAGCTCA 1400
Query 1401 GCTGGCCAAGTGGCAGTGGGAGACCCACGACCCCTGGGTGTGCGCCCCCGACGGCGTCCTGGAGGAGAAGCTCT 1474
|||.|.|||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.
Sbjct 1401 GCTTGTCAAGTGGCAATGGGAGACACATGACCCCTGGGTGTGCGCCCCAGATGGAGTCCTGGAGGAAAAGCTCA 1474
Query 1475 CTCCCCAGTGCCAGCCCCTCCACAATGAGCTG 1506
|.||||||||||..||.||.||||||||.||.
Sbjct 1475 CACCCCAGTGCCGACCGCTTCACAATGAACTC 1506