Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06961
• Subject: NM_178703.4
• Aligned Length: 1797
• Identities: 1619
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGACCAACGGCAGCAAGGTGGCCGACGGGCAGATCTCCACCGAGGTCAGCGAGGCCCCTGTGGCCAATGA  74
            ||||||||..||..||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct    1  ATGGCGACTGACAACAGCAAGGTGGCTGATGGGCAGATCTCTACTGAGGTCAGCGAGGCCCCTGTGGCCAGCGA  74

Query   75  CAAGCCCAAAACCTTGGTGGTCAAGGTGCAGAAGAAGGCGGCAGACCTCCCCGACCGGGACACGTGGAAGGGCC  148
            |||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  CAAGCCCAAAACCCTGGTAGTCAAGGTGCAGAAGAAGGCCGGGGACCTCCCTGACCGGGACACATGGAAGGGAC  148

Query  149  GCTTCGACTTCCTCATGTCCTGTGTGGGCTATGCCATCGGCCTGGGCAACGTCTGGAGGTTCCCCTATCTCTGC  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  GCTTCGACTTCCTCATGTCCTGCGTGGGCTATGCCATCGGCCTGGGCAATGTGTGGAGGTTCCCTTACCTCTGT  222

Query  223  GGGAAAAATGGTGGGGGAGCCTTCCTGATCCCCTATTTCCTGACACTCATCTTTGCGGGGGTCCCACTCTTCCT  296
            ||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  223  GGGAAAAACGGTGGCGGGGCCTTCCTAATCCCATATTTCCTGACGCTCATCTTTGCGGGTGTTCCTCTCTTCCT  296

Query  297  GCTGGAGTGCTCCCTGGGCCAGTACACCTCCATCGGGGGGCTAGGGGTATGGAAGCTGGCTCCTATGTTCAAGG  370
            ..|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  297  TTTGGAGTGCTCCCTAGGCCAGTACACCTCCATTGGGGGCCTGGGCGTATGGAAGCTGGCGCCCATGTTCAAGG  370

Query  371  GCGTGGGCCTTGCGGCTGCTGTGCTATCATTCTGGCTGAACATCTACTACATCGTCATCATCTCCTGGGCCATT  444
            |.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  GTGTGGGCCTCGCGGCAGCTGTGCTGTCCTTCTGGCTGAACATCTACTACATCGTCATCATCTCCTGGGCCATC  444

Query  445  TACTACCTGTACAACTCCTTCACCACGACACTGCCGTGGAAACAGTGCGACAACCCCTGGAACACAGACCGCTG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  TACTACCTGTACAACTCCTTCACCACGACCCTGCCATGGAAACAGTGTGACAACCCGTGGAACACTGACCGCTG  518

Query  519  CTTCTCCAACTACAGCATGGTCAACACTACCAACATGACCAGCGCTGTGGTGGAGTTCTGGGAGCGCAACATGC  592
            ||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCTCCAACTACAGCCTGGTCAATACCACCAACATGACCAGCGCCGTGGTGGAGTTCTGGGAGCGCAACATGC  592

Query  593  ATCAGATGACGGACGGGCTGGATAAGCCAGGTCAGATCCGCTGGCCACTGGCCATCACGCTGGCCATCGCCTGG  666
            |.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  ACCAGATGACAGATGGACTGGACAAGCCAGGACAGATCCGCTGGCCTCTGGCCATCACACTGGCCATTGCCTGG  666

Query  667  ATCCTTGTGTATTTCTGTATCTGGAAGGGTGTTGGCTGGACTGGAAAGGTGGTCTACTTTTCAGCCACATACCC  740
            .|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GTGCTCGTGTATTTCTGCATCTGGAAGGGTGTTGGTTGGACTGGAAAGGTGGTCTACTTCTCAGCCACGTACCC  740

Query  741  CTACATCATGCTGATCATCCTGTTCTTCCGTGGAGTGACGCTGCCCGGGGCCAAGGAGGGCATCCTCTTCTACA  814
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  CTACATCATGCTTATCATCCTGTTCTTCCGTGGAGTGACGCTTCCCGGGGCCAAGGAGGGGATCCTCTTCTACA  814

Query  815  TCACACCCAACTTCCGCAAGCTGTCTGACTCCGAGGTGTGGCTGGATGCGGCAACCCAGATCTTCTTCTCATAC  888
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  TCACACCCAACTTCCGAAAGCTGTCTGATTCTGAGGTGTGGCTTGACGCCGCCACCCAGATCTTCTTCTCCTAC  888

Query  889  GGGCTGGGCCTGGGGTCCCTGATCGCTCTCGGGAGCTACAACTCTTTCCACAACAATGTCTACAGGGACTCCAT  962
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GGGCTGGGCCTGGGGTCCCTGATTGCTCTGGGAAGCTACAACTCTTTCCACAACAATGTGTACAGGGACTCCAT  962

Query  963  CATCGTCTGCTGCATCAATTCGTGCACCAGCATGTTCGCAGGATTCGTCATCTTCTCCATCGTGGGCTTCATGG  1036
            ||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCGTTTGCTGCATCAACTCCTGCACCAGCATGTTTGCCGGATTCGTCATCTTCTCCATCGTGGGCTTCATGG  1036

Query 1037  CCCATGTCACGAAGAGGTCCATTGCTGATGTGGCGGCCTCAGGCCCCGGGCTGGCGTTCCTGGCATACCCAGAG  1110
            |.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||
Sbjct 1037  CTCATGTCACCAAGAGGTCCATAGCTGATGTGGCAGCCTCAGGCCCGGGGCTGGCATTCTTGGCGTACCCTGAG  1110

Query 1111  GCGGTGACCCAGCTGCCTATCTCCCCACTCTGGGCCATCCTCTTCTTCTCCATGCTGTTGATGCTGGGCATTGA  1184
            ||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTGTGACACAGCTACCCATCTCTCCCCTCTGGGCTATCCTCTTCTTCTCCATGCTGCTGATGCTGGGCATTGA  1184

Query 1185  CAGCCAGTTCTGCACTGTGGAGGGCTTCATCACAGCCCTGGTGGATGAGTACCCCAGGCTCCTCCGCAACCGCA  1258
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||.
Sbjct 1185  CAGCCAGTTCTGTACCGTGGAGGGCTTCATCACTGCCCTGGTGGACGAGTACCCCAGACTTCTCCGCAATCGCC  1258

Query 1259  GAGAGCTCTTCATTGCTGCTGTCTGCATCATCTCCTACCTGATCGGTCTCTCTAACATCACTCAGGGGGGTATT  1332
            |.||.||||||||||||||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1259  GTGAACTCTTCATTGCTGCCGTGTGCATCGTGTCCTACCTGATTGGCCTGTCTAACATCACCCAGGGTGGCATT  1332

Query 1333  TATGTCTTCAAACTCTTTGACTACTACTCTGCCAGTGGCATGAGCCTGCTGTTCCTCGTGTTCTTTGAATGTGT  1406
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1333  TATGTCTTCAAACTGTTTGATTATTACTCTGCCAGCGGCATGAGCTTGCTGTTCCTGGTTTTCTTCGAGTGTGT  1406

Query 1407  CTCTATTTCCTGGTTTTACGGTGTCAACCGATTCTATGACAATATCCAAGAGATGGTTGGATCCAGGCCCTGCA  1480
            |||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  CTCCATTTCCTGGTTTTATGGTGTCAACCGGTTCTATGACAACATCCAGGAGATGGTTGGCTCCAGGCCCTGCA  1480

Query 1481  TCTGGTGGAAACTCTGCTGGTCTTTCTTCACACCAATCATTGTGGCGGGCGTGTTCATTTTCAGTGCTGTGCAG  1554
            ||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTGGTGGAAGCTGTGCTGGTCCTTTTTCACACCCATCATTGTGGCGGGCGTGTTTCTCTTCAGTGCTGTGCAG  1554

Query 1555  ATGACGCAACTCACCATGGGAAACTATGTTTTCCCCAAGTGGGGCCAGGGTGTGGGCTGGCTGATGGCTCTGTC  1628
            |||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  ATGACACCACTCACCATGGGAAGCTATGTTTTCCCCAAGTGGGGCCAGGGCGTGGGCTGGCTCATGGCTCTGTC  1628

Query 1629  TTCCATGGTCCTCATCCCCGGGTACATGGCCTACATGTTCCTCACCTTAAAGGGCTCCCTGAAGCAGCGCATCC  1702
            .||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1629  CTCCATGGTGCTCATCCCCGGGTACATGGCTTACATGTTCCTCACCCTGAAGGGCTCCCTGAAGCAGCGTCTCC  1702

Query 1703  AAGTCATGGTCCAGCCCAGCGAAGACATCGTTCGCCCAGAGAATGGTCCTGAGCAGCCCCAGGCGGGCAGCTCC  1776
            |.||||||.|.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1703  AGGTCATGATTCAGCCCAGTGAAGATATTGTGCGCCCTGAGAATGGCCCTGAGCAGCCGCAGGCTGGCAGCTCA  1776

Query 1777  ACCAGCAAGGAGGCCTACATC  1797
            .||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCAGCAAGGAGGCCTACATC  1797