Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06967
- Subject:
- NM_053079.2
- Aligned Length:
- 2135
- Identities:
- 1780
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 ATGGGAATGTCCAAATCACACAGTTTCTTTGGTTATCCCCTGAGCATCTTCTTCATCGTGGTCAATGAGTTTTG 74
|||||.||||||||.||.|...|||.|||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1 ATGGGGATGTCCAAGTCTCGGGGTTGCTTCGGTTACCCGTTGAGCATCTTCTTCATCGTGGTCAATGAATTCTG 74
Query 75 CGAAAGATTTTCCTACTATGGAATGCGAGCAATCCTGATTCTGTACTTCACAAATTTCATCAGCTGGGATGATA 148
.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||||||..||.|||.||.|||||||.||.|
Sbjct 75 TGAAAGATTCTCCTACTATGGCATGCGAGCACTCCTGGTTCTGTACTTCAGGAACTTCCTCGGCTGGGACGACA 148
Query 149 ACCTGTCCACCGCCATCTACCATACGTTTGTGGCTCTGTGCTACCTGACGCCAATTCTCGGAGCTCTTATCGCC 222
|.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 149 ATCTCTCCACGGCCATTTACCATACGTTCGTTGCCCTCTGCTACCTGACTCCAATTCTTGGAGCTCTGATCGCA 222
Query 223 GACTCGTGGCTGGGAAAGTTCAAGACCATTGTGTCGCTCTCCATTGTCTACACAATTGGACAAGCAGTCACCTC 296
||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 223 GACTCGTGGCTGGGGAAGTTCAAGACAATTGTTTCACTATCCATCGTCTACACGATTGGACAAGCAGTCATCTC 296
Query 297 AGTAAGCTCCATTAATGACCTCACAGACCACAACCATGATGGCACCCCCGACAGCCTTCCTGTGCACGTGGTGC 370
.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||..||||||..||.|||||||||||.||||||||.|..|
Sbjct 297 GGTGAGCTCAATTAATGACCTCACAGACCACGACCACAATGGCAGTCCTGACAGCCTTCCCGTGCACGTAGCAC 370
Query 371 TGTCCTTGATCGGCCTGGCCCTGATAGCTCTCGGGACTGGAGGAATCAAACCCTGTGTGTCTGCGTTTGGTGGA 444
|||||.||.|.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 TGTCCATGGTTGGCCTGGCCCTGATAGCCCTTGGTACAGGAGGAATCAAGCCCTGTGTGTCTGCGTTTGGTGGC 444
Query 445 GATCAGTTTGAAGAGGGCCAGGAGAAACAAAGAAACAGATTTTTTTCCATCTTTTACTTGGCTATTAATGCTGG 518
|||||||||||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||.||||||||||||||.||||||||.||.|..||
Sbjct 445 GATCAGTTTGAAGAGGGTCAGGAAAAACAGCGAAACCGGTTCTTTTCCATCTTTTATTTGGCTATCAACGGGGG 518
Query 519 AAGTTTGCTTTCCACAATCATCACACCCATGCTCAGAGTTCAACAATGTGGAATTCACAGTAAACAAGCTTGTT 592
|||..||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 519 AAGCCTGCTCTCCACGATCATCACTCCCATACTCAGAGTTCAACAGTGCGGAATCCACAGTCAACAAGCTTGTT 592
Query 593 ACCCACTGGCCTTTGGGGTTCCTGCTGCTCTCATGGCTGTAGCCCTGATTGTGTTTGTCCTTGGCAGTGGGATG 666
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 ACCCACTGGCCTTCGGGGTTCCAGCGGCTCTCATGGCTGTTGCCCTAATTGTGTTTGTCCTTGGCAGTGGAATG 666
Query 667 TACAAGAAGTTCAAGCCACAGGGCAACATCATGGGTAAAGTGGCCAAGTGCATCGGTTTTGCCATCAAAAATAG 740
||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 667 TACAAGAAGTTCCAGCCCCAGGGCAACATCATGGGCAAAGTGGCCAAGTGCATTGGTTTTGCCATCAAAAACAG 740
Query 741 ATTTAGGCATCGGAGTAAGGCATTTCCCAAGAGGGAGCACTGGCTGGACTGGGCTAAAGAGAAATACGATGAGC 814
.|||.||||.||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 GTTTCGGCACCGAAGTAAGGCATATCCCAAGAGGGAGCACTGGCTGGACTGGGCTAAAGAGAAATACGACGAGC 814
Query 815 GGCTCATCTCCCAAATTAAGATGGTTACGAGGGTGATGTTCCTGTATATTCCACTCCCAATGTTCTGGGCCTTG 888
||||||||||.||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 GGCTCATCTCACAGATTAAGATGGTCACGAAGGTGATGTTCCTGTACATCCCACTCCCCATGTTCTGGGCCTTG 888
Query 889 TTTGACCAGCAGGGCTCCAGGTGGACACTGCAGGCAACAACTATGTCCGGGAAAATCGGAGCTGTTGAAATTCA 962
||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||...||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 889 TTTGACCAGCAGGGTTCCAGATGGACACTGCAAGCAACGACCATGAATGGGAAAATTGGAGCAATTGAAATTCA 962
Query 963 GCCCGATCAGATGCAGACCGTGAACGCCATCCTGATCGTGATCATGGTCCCGATCTTCGATGCTGTGCTGTACC 1036
|||.||.|||||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||||||||||.||..|.||.||||||.||||||
Sbjct 963 GCCGGACCAGATGCAGACGGTGAATGCCATCTTGATTGTCATCATGGTCCCCATTGTGGACGCTGTGGTGTACC 1036
Query 1037 CTCTCATTGCAAAATGTGGCTTCAATTTCACCTCCTTGAAGAAGATGGCAGTTGGCATGGTCCTGGCCTCCATG 1110
|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||.|.|||||.|||.|||||||.||||||
Sbjct 1037 CGCTCATTGCAAAATGTGGTTTCAACTTCACATCCCTGAAGAAGATGACTGTTGGGATGTTCCTGGCGTCCATG 1110
Query 1111 GCCTTTGTGGTGGCTGCCATCGTGCAGGTGGAAATCGATAAAACTCTTCCAGTCTTCCCCAAAGGAAACGAAGT 1184
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||....|||||..||||
Sbjct 1111 GCCTTTGTGGTGGCTGCAATTGTGCAGGTGGAAATCGATAAAACTCTTCCAGTCTTCCCTGGTGGAAATCAAGT 1184
Query 1185 CCAAATTAAAGTTTTGAATATAGGAAACAATACCATGAATATATCTCTTCCTGGAGAGATGGTGACACTTGGCC 1258
|||||||||.||.|||||.||.||||||||||.|||||...|...|.||||||||.|.|..|||||.||||.||
Sbjct 1185 CCAAATTAAGGTCTTGAACATCGGAAACAATAACATGACCGTGCATTTTCCTGGAAATAGTGTGACGCTTGCCC 1258
Query 1259 CAATGTCTCAAACAAATGCATTTATGACTTTTGATGTAAACAAACTGACAAGGATAAACATTTCTTCTCCTGGA 1332
.|||||||||.|||.|..|.||.||||||||.|||.||.||||.||||||||.||||||||.|||||..|||||
Sbjct 1259 AAATGTCTCAGACAGACACGTTCATGACTTTCGATATAGACAAGCTGACAAGCATAAACATATCTTCCTCTGGA 1332
Query 1333 TCACC---AGTCACTGCCGTAACTGACGACTTCAAGCAGGGCCAACGCCACACGCTTCTAGTGTGGGCCCCCAA 1403
||.|| ||||||..|.|||.||.|.||.||..|||||||.||.||.|||||.||||||||||||..|||||.
Sbjct 1333 TCCCCAGGAGTCACCACAGTAGCTCATGATTTTGAGCAGGGTCACCGGCACACCCTTCTAGTGTGGAACCCCAG 1406
Query 1404 TCACTACCAGGTGGTAAAGGATGGTCTTAACCAGAAGCCAGAAAAAGGGGAAAATGGAATCAGATTTGTAAATA 1477
|||.||||..||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1407 TCAATACCGTGTGGTAAAAGATGGTCTTAACCAAAAGCCAGAGAAAGGGGAGAACGGAATCAGGTTTGTCAACA 1480
Query 1478 CTTTTAACGAGCTCATCACCATCACAATGAGTGGGAAAGTTTATGCAAACATCAGCAGCTACAATGCCAGCACA 1551
|..||||||||.|..|||||||||.|||||||||||||||.||||.|||..|||.|||..||||.||||||...
Sbjct 1481 CCCTTAACGAGATGGTCACCATCAAAATGAGTGGGAAAGTATATGAAAATGTCACCAGTCACAACGCCAGCGGC 1554
Query 1552 TACCAGTTTTTTCCTTCTGGCATAAAAGGC--TTCACAATAAGCTCAACAGAGATTCCGCCACAATGTCAACCT 1623
||||||||.||.||||||||| .|||.|| |.||||||||.|.|.||.|.|.|..|.|||...||||.|.||
Sbjct 1555 TACCAGTTCTTCCCTTCTGGC--GAAAAGCAGTACACAATAAACACCACGGCGGTGGCACCAACCTGTCTAACT 1626
Query 1624 AATTTCAATACTTTCTACCTTGAATTTGGTAGTGCTTATACCTATATAGTCCAAAGGAAGAATGACAGCTGCCC 1697
.||||.||..|||.|.|||||||.|||||.||.||.||||||||..|..|||.||||..||.|||..||||||.
Sbjct 1627 GATTTTAAATCTTCCAACCTTGACTTTGGCAGCGCGTATACCTACGTGATCCGAAGGGCGAGTGATGGCTGCCT 1700
Query 1698 TGAAGTGAAGGTGTTTGAAGATATTTCAGCCAACACAGTTAACATGGCTCTGCAAATCCCGCAGTATTTTCTTC 1771
.||||||||||..||||||||.||..||.|||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1701 GGAAGTGAAGGAATTTGAAGACATCCCACCCAACACTGTGAACATGGCTCTGCAGATCCCACAGTACTTCCTTC 1774
Query 1772 TCACCTGTGGCGAAGTGGTCTTCTCTGTCACGGGATTGGAATTCTCATATTCTCAGGCTCCTTCCAACATGAAG 1845
|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1775 TCACCTGCGGCGAGGTGGTCTTCTCTGTCACAGGACTGGAGTTCTCTTATTCCCAGGCTCCGTCTAACATGAAG 1848
Query 1846 TCGGTGCTTCAGGCAGGATGGCTGCTGACCGTGGCTGTTGGCAACATCATTGTGCTCATCGTGGCAGGGGCAGG 1919
||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1849 TCCGTGCTTCAGGCAGGCTGGCTTCTAACTGTGGCGGTCGGCAATATCATTGTGCTCATCGTGGCAGGGGCGGG 1922
Query 1920 CCAGTTCAGCAAACAGTGGGCCGAGTACATTCTATTTGCCGCGTTGCTTCTGGTCGTCTGTGTAATTTTTGCCA 1993
.||.|||..||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct 1923 GCACTTCCCCAAACAGTGGGCTGAGTACATTCTGTTTGCCTCATTGCTTCTGGTTGTCTGCGTGATATTCGCCA 1996
Query 1994 TCATGGCTCGGTTCTATACTTACATCAACCCAGCGGAGATCGAAGCTCAATTTGATGAGGATGAAAAGAAAAA- 2066
||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1997 TCATGGCTCGATTCTACACCTACATCAACCCAGCAGAGATTGAAGCACAGTTTGATGAGGATGAGAAGAAAAAG 2070
Query 2067 --CAGACTGGAAAAGAGTAACCCATAT--TTCATGTCAGGGGCCAAT-TCACAGAAACAGATG 2124
||.| |||||.|| .|||||.||| ||||| .||..|||.| |||||||.|.|.|||
Sbjct 2071 GGCATA--GGAAAGGA-AAACCCGTATTCTTCAT---TGGAACCAGTCTCACAGACAAATATG 2127