Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06984
- Subject:
- NM_019727.2
- Aligned Length:
- 1566
- Identities:
- 1409
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCGTCGGGTGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTC 74
||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCAGGAGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGCGACTCCCTCCGCCCTTCCCTGGCATGGATCCGGAGTC 74
Query 75 CGAGGGGGCGGCCGGGGGATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCG 148
.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 75 GGAAGGGGCTGCCGGGGGGTCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGATATTTTCACTGGCG 148
Query 149 CCGCGGTGGTCAGTAAACATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAA 222
||||||..|.||.|||.|..|||||||||||||.|||.|||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 149 CCGCGGCAGCCACTAAGCCCCAGTCTCCAAAGAAAACCACATCCCTTTTTCCTATCAAAAATGGTTCCAAAGAG 222
Query 223 AATGGGATCCATGAAGAACAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAGCTATCCTTGGA 296
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 223 AATGGGATCCATGAGGACCAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAACTATCCCTGGA 296
Query 297 CAGCACACAAAATAATCAGAAGAAGGTGCTAGCCAAAACACTCATTTCTCTTCCTCCTCAGGAAGCCACAAATT 370
|||||||||.|||||.|||||||...|||.||.||||||.||.|.|||||.||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 297 CAGCACACAGAATAACCAGAAGACAATGCCAGGCAAAACCCTTACTTCTCATCCTCCGCAAGAAGCCACAAATT 370
Query 371 CTTCGAAGCCCCAGCCAACCTATGAGGAGCTAGAGGAAGAAGAACAGGAGGATCAATTTGATTTGACAGTCGGT 444
||.|||||||.|||||||.|||||||||||| |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 371 CTCCGAAGCCACAGCCAAGCTATGAGGAGCT---GGAGGAAGAACAGGAGGATCAGTTTGATTTGACAGTTGGT 441
Query 445 ATAACTGATCCTGAGAAGATAGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTT 518
||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 442 ATCACCGATCCTGAGAAGATCGGGGATGGTATGAATGCCTATGTAGCCTACAAAGTCACCACACAGACAAGCTT 515
Query 519 ACCATTGTTCAGAAGCAAACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT 592
|||..||||||||||.|..|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 ACCGATGTTCAGAAGTAGGCAGTTTGCAGTGAAAAGAAGATTCAGTGACTTCCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT 589
Query 593 CCGAGAAGCACTCTCAGAATGGCTTCATTGTCCCTCCACCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTG 666
|.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 590 CAGAGAAGCACTCCCAGAATGGTTTCATTGTGCCTCCTCCACCCGAGAAGAGCCTAATAGGAATGACAAAGGTG 663
Query 667 AAAGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCA 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 664 AAGGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCCGCAGAGTTTCTTGAGAAACGGAGGGCTGCTTTGGAAAGGTACCTTCA 737
Query 741 GAGGATTGTAAATCATCCTACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAGAGCTGCCAC 814
.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||||||||.|
Sbjct 738 AAGAATTGTGAATCATCCCACCATGTTACAGGACCCAGATGTCAGGGAGTTTCTGGAAAAAGAAGAGCTGCCTC 811
Query 815 GTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTTCAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGC 888
|.||.|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 812 GAGCTGTGGGCACGCAGGCTTTGAGTGGCGCTGGTCTCCTTAAGATGTTCAACAAAGCTACAGATGCAGTCAGC 885
Query 889 AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGCTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTCGAGGAGAAACTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA 959
Query 963 GCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCC 1036
||||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 960 GCGCCTACGGAAGCTGCATGCTGTGGTGGAGACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAACTAGCGCTGAACACAGCCC 1033
Query 1037 AGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGCATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTG 1110
.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1034 TGTTTGCCAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCCGAGGACAACACAGCACTTTCTCGAGCGCTCTCCCAACTG 1107
Query 1111 GCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCT 1184
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1108 GCTGAGGTGGAAGAAAAGATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAACT 1181
Query 1185 CCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT 1258
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CCTGAGTGACTATATTCGCCTCCTGGCCATTGTCCGAGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT 1255
Query 1259 GGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAT 1332
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1256 GGCAGGATGCTCAAGCCACGCTGCAGAAGAAGCGGGAGTCTGAGGCACGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAC 1329
Query 1333 AAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGACTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAG 1406
||.|||||||||||.|||||.||||||...||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1330 AAACTGCAGCAGGCTAAGGATGAGATCACAGAGTGGGAATCTCGGGTGACTCAGTATGAAAGGGACTTTGAAAG 1403
Query 1407 GATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAATCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGA 1480
||||||.|||||.||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1404 GATTTCCACAGTTGTCCGAAAGGAAGTGACACGATTTGAGAAAGAGAAGTCCAAGGATTTCAAAAACCACGTGA 1477
Query 1481 TCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCAGCTGGCAAAGTACTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCA 1554
|.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TGAAGTACCTGGAGACACTCCTACATTCCCAGCAGCAGCTGGCAAAATACTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCA 1551
Query 1555 AAGGCCATCTCC 1566
||||||||||||
Sbjct 1552 AAGGCCATCTCC 1563