Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06984
- Subject:
- NM_148955.4
- Aligned Length:
- 1566
- Identities:
- 1370
- Gaps:
- 195
Alignment
Query 1 ATGGCGTCGGGTGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCGGGTGGTGGTGGCTGTAGCGCTTCGGAGAGACTGCCTCCGCCCTTCCCCGGCCTGGAGCCGGAGTC 74
Query 75 CGAGGGGGCGGCCGGGGGATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAGGGGGCGGCCGGGGGATCAGAACCCGAGGCTGGGGACAGCGACACCGAGGGGGAGGACATTTTCACCGGCG 148
Query 149 CCGCGGTGGTCAGTAAACATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGCGGTGGTCAGTAAACATCAGTCTCCAAAGATAACTACATCCCTTCTTCCCATCAACAATGGCTCCAAAGAA 222
Query 223 AATGGGATCCATGAAGAACAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGCAGATGCCACAGTGGAGCTATCCTTGGA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATGGGATCCATGAAGAACAAGACCAAGAGCCACAGGATCTCTTTGC--------------------------- 269
Query 297 CAGCACACAAAATAATCAGAAGAAGGTGCTAGCCAAAACACTCATTTCTCTTCCTCCTCAGGAAGCCACAAATT 370
Sbjct 270 -------------------------------------------------------------------------- 269
Query 371 CTTCGAAGCCCCAGCCAACCTATGAGGAGCTAGAGGAAGAAGAACAGGAGGATCAATTTGATTTGACAGTCGGT 444
Sbjct 270 -------------------------------------------------------------------------- 269
Query 445 ATAACTGATCCTGAGAAGATAGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 --------------------AGGGGATGGTATGAATGCATATGTAGCCTACAAAGTTACAACACAGACAAGCTT 323
Query 519 ACCATTGTTCAGAAGCAAACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 ACCATTGTTCAGAAGCAAACAGTTTGCAGTAAAAAGAAGATTTAGTGACTTTCTGGGTCTTTATGAGAAGCTTT 397
Query 593 CCGAGAAGCACTCTCAGAATGGCTTCATTGTCCCTCCACCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTG 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 CCGAGAAGCACTCTCAGAATGGCTTCATTGTCCCTCCGCCCCCGGAGAAGAGCCTCATAGGGATGACAAAAGTG 471
Query 667 AAAGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 AAAGTTGGGAAGGAAGATTCTTCTTCTGCAGAATTTCTTGAAAAACGGAGGGCCGCTTTAGAAAGGTACCTTCA 545
Query 741 GAGGATTGTAAATCATCCTACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAGAGCTGCCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 GAGGATTGTAAATCATCCTACCATGTTACAGGACCCTGACGTCAGAGAGTTCTTGGAAAAAGAAGAGCTGCCAC 619
Query 815 GTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTTCAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 GTGCCGTGGGTACCCAGACATTGAGTGGTGCTGGTCTCCTCAAGATGTTCAACAAAGCCACAGATGCCGTCAGC 693
Query 889 AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGCTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 AAAATGACCATCAAGATGAATGAATCAGACATTTGGTTTGAGGAGAAGCTCCAGGAGGTAGAGTGTGAGGAGCA 767
Query 963 GCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GCGCTTACGGAAACTGCATGCTGTTGTAGAAACTCTAGTCAACCATAGGAAAGAGCTAGCGCTGAACACAGCCC 841
Query 1037 AGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGCATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 AGTTTGCAAAGAGTCTAGCCATGCTTGGGAGCTCTGAGGACAACACGGCATTGTCACGGGCACTCTCCCAGCTG 915
Query 1111 GCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 GCTGAGGTGGAAGAAAAAATTGAGCAGCTCCACCAGGAACAGGCCAACAATGACTTCTTCCTCCTTGCTGAGCT 989
Query 1185 CCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 CCTGAGTGACTACATTCGCCTCCTGGCCATAGTCCGCGCTGCCTTCGACCAGCGCATGAAGACATGGCAGCGCT 1063
Query 1259 GGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 GGCAGGATGCCCAAGCCACACTGCAGAAGAAGCGGGAGGCCGAGGCTCGGCTGCTGTGGGCCAACAAGCCTGAT 1137
Query 1333 AAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGACTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 AAGCTGCAGCAGGCCAAGGACGAGATCCTCGAGTGGGAGTCTCGGGTGACTCAATATGAAAGGGACTTCGAGAG 1211
Query 1407 GATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAATCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 GATTTCAACAGTGGTCCGAAAAGAAGTGATACGGTTTGAGAAAGAGAAATCCAAGGACTTCAAGAACCACGTGA 1285
Query 1481 TCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCAGCTGGCAAAGTACTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 TCAAGTACCTTGAGACACTCCTTTACTCACAGCAGCAGCTGGCAAAGTACTGGGAAGCCTTCCTTCCTGAGGCA 1359
Query 1555 AAGGCCATCTCC 1566
||||||||||||
Sbjct 1360 AAGGCCATCTCC 1371