Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06989
• Subject: XM_006720657.1
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1537
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGGCCCCTGCGAGGACGATGGCCCGCGCCCGCCTCGCCCCGGCCGGCATCCCTGCCGTCGCCTTGTGGCTTCT  74
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Sbjct    1  ATGGCCCCTGCGAGGACGATGGCCCGCGCCCGCCTCGCCCCGGCCGGCATCCCTGCCGTCGCCTTGTGGCTTCT  74

Query   75  GTGCACGCTCGGCCTCCAGGGCACCCAGGCCGGGCCACCGCCCGCGCCCCCTGGGCTGCCCGCGGGAGCCGACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGCACGCTCGGCCTCCAGGGCACCCAGGCCGGGCCACCGCCCGCGCCCCCTGGGCTGCCCGCGGGAGCCGACT  148

Query  149  GCCTGAACAGCTTTACCGCCGGGGTGCCTGGCTTCGTGCTGGACACCAACGCCTCGGTCAGCAACGGAGCTACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCTGAACAGCTTTACCGCCGGGGTGCCTGGCTTCGTGCTGGACACCAACGCCTCGGTCAGCAACGGAGCTACC  222

Query  223  TTCCTGGAGTCCCCCACCGTGCGCCGGGGCTGGGACTGCGTGCGCGCCTGCTGCACCACCCAGAACTGCAACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTGGAGTCCCCCACCGTGCGCCGGGGCTGGGACTGCGTGCGCGCCTGCTGCACCACCCAGAACTGCAACTT  296

Query  297  GGCGCTAGTGGAGCTGCAGCCCGACCGCGGGGAGGACGCCATCGCCGCCTGCTTCCTCATCAACTGCCTCTACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCGCTAGTGGAGCTGCAGCCCGACCGCGGGGAGGACGCCATCGCCGCCTGCTTCCTCATCAACTGCCTCTACG  370

Query  371  AGCAGAACTTCGTGTGCAAGTTCGCGCCCAGGGAGGGCTTCATCAACTACCTCACGAGGGAAGTGTACCGCTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCAGAACTTCGTGTGCAAGTTCGCGCCCAGGGAGGGCTTCATCAACTACCTCACGAGGGAAGTGTACCGCTCC  444

Query  445  TACCGCCAGCTGCGGACCCAGGGCTTTGGAGGGTCTGGGATCCCCAAGGCCTGGGCAGGCATAGACTTGAAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACCGCCAGCTGCGGACCCAGGGCTTTGGAGGGTCTGGGATCCCCAAGGCCTGGGCAGGCATAGACTTGAAGGT  518

Query  519  ACAACCCCAGGAACCCCTGGTGCTGAAGGATGTGGAAAACACAGATTGGCGCCTACTGCGGGGTGACACGGATG  592
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Sbjct  519  ACAACCCCAGGAACCCCTGGTGCTGAAGGATGTGGAAAACACAGATTGGCGCCTACTGCGGGGTGACACGGATG  592

Query  593  TCAGGGTAGAGAGGAAAGACCCAAACCAGGTGGAACTGTGGGGACTCAAGGAAGGCACCTACCTGTTCCAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAGGGTAGAGAGGAAAGACCCAAACCAGGTGGAACTGTGGGGACTCAAGGAAGGCACCTACCTGTTCCAGCTG  666

Query  667  ACAGTGACTAGCTCAGACCACCCAGAGGACACGGCCAACGTCACAGTCACTGTGCTGTCCACCAAGCAGACAGA  740
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Sbjct  667  ACAGTGACTAGCTCAGACCACCCAGAGGACACGGCCAACGTCACAGTCACTGTGCTGTCCACCAAGCAGACAGA  740

Query  741  AGACTACTGCCTCGCATCCAACAAGGTGGGTCGCTGCCGGGGCTCTTTCCCACGCTGGTACTATGACCCCACGG  814
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Sbjct  741  AGACTACTGCCTCGCATCCAACAAGGTGGGTCGCTGCCGGGGCTCTTTCCCACGCTGGTACTATGACCCCACGG  814

Query  815  AGCAGATCTGCAAGAGTTTCGTTTATGGAGGCTGCTTGGGCAACAAGAACAACTACCTTCGGGAAGAAGAGTGC  888
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Sbjct  815  AGCAGATCTGCAAGAGTTTCGTTTATGGAGGCTGCTTGGGCAACAAGAACAACTACCTTCGGGAAGAAGAGTGC  888

Query  889  ATTCTAGCCTGTCGGGGTGTGCAA------------------------------------------------GG  914
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Sbjct  889  ATTCTAGCCTGTCGGGGTGTGCAAGGTGGGCCTTTGAGAGGCAGCTCTGGGGCTCAGGCGACTTTCCCCCAGGG  962

Query  915  CCCCTCCATGGAAAGGCGCCATCCAGTGTGCTCTGGCACCTGTCAGCCCACCCAGTTCCGCTGCAGCAATGGCT  988
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Sbjct  963  CCCCTCCATGGAAAGGCGCCATCCAGTGTGCTCTGGCACCTGTCAGCCCACCCAGTTCCGCTGCAGCAATGGCT  1036

Query  989  GCTGCATCGACAGTTTCCTGGAGTGTGACGACACCCCCAACTGCCCCGACGCCTCCGACGAGGCTGCCTGTGAA  1062
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Sbjct 1037  GCTGCATCGACAGTTTCCTGGAGTGTGACGACACCCCCAACTGCCCCGACGCCTCCGACGAGGCTGCCTGTGAA  1110

Query 1063  AAATACACGAGTGGCTTTGACGAGCTCCAGCGCATCCATTTCCCCAGTGACAAAGGGCACTGCGTGGACCTGCC  1136
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Sbjct 1111  AAATACACGAGTGGCTTTGACGAGCTCCAGCGCATCCATTTCCCCAGTGACAAAGGGCACTGCGTGGACCTGCC  1184

Query 1137  AGACACAGGACTCTGCAAGGAGAGCATCCCGCGCTGGTACTACAACCCCTTCAGCGAACACTGCGCCCGCTTTA  1210
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Sbjct 1185  AGACACAGGACTCTGCAAGGAGAGCATCCCGCGCTGGTACTACAACCCCTTCAGCGAACACTGCGCCCGCTTTA  1258

Query 1211  CCTATGGTGGTTGTTATGGCAACAAGAACAACTTTGAGGAAGAGCAGCAGTGCCTCGAGTCTTGTCGCGGCATC  1284
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Sbjct 1259  CCTATGGTGGTTGTTACGGCAACAAGAACAACTTTGAGGAAGAGCAGCAGTGCCTCGAGTCTTGTCGCGGCATC  1332

Query 1285  TCCAAGAAGGATGTGTTTGGCCTGAGGCGGGAAATCCCCATTCCCAGCACAGGCTCTGTGGAGATGGCTGTCGC  1358
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Sbjct 1333  TCCAAGAAGGATGTGTTTGGCCTGAGGCGGGAAATCCCCATTCCCAGCACAGGCTCTGTGGAGATGGCTGTCGC  1406

Query 1359  AGTGTTCCTGGTCATCTGCATTGTGGTGGTGGTAGCCATCTTGGGTTACTGCTTCTTCAAGAACCAGAGAAAGG  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTGTTCCTGGTCATCTGCATTGTGGTGGTGGTAGCCATCTTGGGTTACTGCTTCTTCAAGAACCAGAGAAAGG  1480

Query 1433  ACTTCCACGGACACCACCACCACCCACCACCCACCCCTGCCAGCTCCACTGTCTCCACTACCGAGGACACGGAG  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTTCCACGGACACCACCACCACCCACCACCCACCCCTGCCAGCTCCACTGTCTCCACTACCGAGGACACGGAG  1554

Query 1507  CACCTGGTCTATAACCACACCACCCGGCCCCTC  1539
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Sbjct 1555  CACCTGGTCTATAACCACACCACGCGGCCCCTC  1587