Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07000
- Subject:
- XM_006711496.3
- Aligned Length:
- 1680
- Identities:
- 1613
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGGAGGAATCTGTGAACCAAATGCAGCCACTGAATGAGAAGCAGATAGCCAATTCTCAGGATGGATATGTATG 74
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGAATCTGTAAACCAAATGCAGCCACTGAATGAGAAGCAGATAGCCAATTCTCAGGATGGATATGTATG 74
Query 75 GCAAGTCACTGACATGAATCGACTACACCGGTTCTTATGTTTCGGTTCTGAAGGTGGGACTTATTATATCAAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAAGTCACTGACATGAATCGACTACACCGGTTCTTATGTTTCGGTTCTGAAGGTGGGACTTATTATATCAAAG 148
Query 149 AACAGAAGTTGGGCCTTGAAAATGCTGAAGCTTTAATTAGATTGATTGAAGATGGCAGAGGATGTGAAGTGATA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAGAAGTTGGGCCTTGAAAATGCTGAAGCTTTAATTAGATTGATTGAAGATGGCAGAGGATGTGAAGTGATA 222
Query 223 CAAGAAATAAAGTCATTTAGTCAAGAAGGCAGAACCACAAAGCAAGAGCCTATGCTCTTTGCACTTGCCATTTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGAAATAAAGTCATTTAGTCAAGAAGGCAGAACCACAAAGCAAGAGCCTATGCTCTTTGCACTTGCCATTTG 296
Query 297 TTCCCAGTGCTCCGACATAAGCACAAAACAAGCAGCATTTAAAGCTGTTTCTGAAGTTTGTCGCATTCCTACCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCCCAGTGCTCCGACATAAGCACAAAACAAGCAGCATTTAAAGCTGTTTCTGAAGTTTGTCGCATTCCTACCC 370
Query 371 ATCTCTTTACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGATCTGAAGGAAAGCATGAAATGTGGCATGTGGGGTCGTGCCCTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCTCTTTACTTTTATCCAGTTTAAGAAAGATCTGAAGGAAAGCATGAAATGTGGCATGTGGGGTCGTGCCCTC 444
Query 445 CGGAAGGCTATAGCGGACTGGTACAATGAGAAAGGTGGCATGGCCCTTGCTCTGGCAGTTACAAAATATAAACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGGAAGGCTATAGCGGACTGGTACAATGAGAAAGGTGGCATGGCCCTTGCTCTGGCAGTTACAAAATATAAACA 518
Query 519 GAGAAATGGCTGGTCTCACAAAGATCTATTAAGATTGTCACATCTTAAACCTTCCAGTGAAG------------ 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGAAATGGCTGGTCTCACAAAGATCTATTAAGATTGTCACATCTTAAACCTTCCAGTGAAGTGAAACTTGAAA 592
Query 581 ------------------------------------------------------GACTTGCAATTGTGACCAAA 600
||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGACAGCCACTCAGAAGGGTGGGTTCACATTTCAGTTCTGTGGACTTAAGCCAAGACTTGCAATTGTGACCAAA 666
Query 601 TATATTACAAAGGGCTGGAAAGAAGTTCATGAATTGTATAAAGAAAAAGCACTCTCTGTGGAGACTGAAAAATT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATATTACAAAGGGCTGGAAAGAAGTTCATGAATTGTATAAAGAAAAAGCACTCTCTGTGGAGACTGAAAAATT 740
Query 675 ATTAAAGTATCTGGAGGCTGTAGAGAAAGTGAAGCGCACAAGAGATGAGCTAGAAGTCATTCATCTAATAGAAG 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTAAAGTATCTGGAGGCTGTAGAGAAAGTGAAGCGCACAAGAGATGAGCTAGAAGTCATTCATCTAATAGAAG 814
Query 749 AACATAGATTAGTTAGAGAACATCTTTTAACAAATCACTTAAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCTTTGTTACAA 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACATAGATTAGTTAGAGAACATCTTTTAACAAATCACTTAAAGTCTAAAGAGGTATGGAAGGCTTTGTTACAA 888
Query 823 GAAATGCCGCTTACTGCATTACTAAGGAATCTAGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTACTTGAACCAGGAAATTC 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAATGCCGCTTACTGCATTACTAAGGAATCTAGGAAAGATGACTGCTAATTCAGTACTTGAACCAGGAAATTC 962
Query 897 AGAAGTATCTTTAGTATGTGAAAAACTGTGTAATGAAAAACTATTAAAAAAGGCTCGTATACATCCATTTCATA 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAAGTATCTTTAGTATGTGAAAAACTGTGTAATGAAAAACTATTAAAAAAGGCTCGTATACATCCATTTCATA 1036
Query 971 TTTTGATCGCATTAGAAACTTACAAGACAGGTCATGGTCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGCGCCCTGATGAAGAA 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTTTGATCGCATTAGAAACTTACAAGACAGGTCATGGTCTCAGAGGGAAACTGAAGTGGCGCCCTGATGAAGAA 1110
Query 1045 ATTTTGAAAGCATTGGATGCTGCTTTTTATAAAACATTTAAGACAGTTGAACCAACTGGAAAACGTTTCTTACT 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATTTTGAAAGCATTGGATGCTGCTTTTTATAAAACATTTAAGACAGTTGAACCAACTGGAAAACGTTTCTTACT 1184
Query 1119 AGCTGTTGATGTCAGTGCTTCTATGAACCAAAGAGTTTTGGGTAGTATACTCAACGCTAGTACAGTTGCTGCAG 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGCTGTTGATGTCAGTGCTTCTATGAACCAAAGAGTTTTGGGTAGTATACTCAACGCTAGTACAGTTGCTGCAG 1258
Query 1193 CAATGTGCATGGTTGTCACACGAACAGAAAAAGATTCTTATGTAGTTGCTTTTTCCGATGAAATGGTACCATGT 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAATGTGCATGGTTGTCACACGAACAGAAAAAGATTCTTATGTAGTTGCTTTTTCCGATGAAATGGTACCATGT 1332
Query 1267 CCAGTGACTACAGATATGACCTTACAACAGGTTTTAATGGCTATGAGTCAGATCCCAGCAGGTGGAACTGATTG 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCAGTGACTACAGATATGACCTTACAACAGGTTTTAATGGCTATGAGTCAGATCCCAGCAGGTGGAACTGATTG 1406
Query 1341 CTCTCTTCCAATGATCTGGGCTCAGAAGACAAACACACCTGCTGATGTCTTCATTGTATTCACTGATAATGAGA 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTCTCTTCCAATGATCTGGGCTCAGAAGACAAACACACCTGCTGATGTCTTCATTGTATTCACTGATAATGAGA 1480
Query 1415 CCTTTGCTGGAGGTGTCCATCCTGCTATTGCTCTGAGGGAGTATCGAAAGAAAATGGATATTCCAGCTAAATTG 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCTTTGCTGGAGGTGTCCATCCTGCTATTGCTCTGAGGGAGTATCGAAAGAAAATGGATATTCCAGCTAAATTG 1554
Query 1489 ATTGTTTGTGGAATGACATCAAATGGTTTCACCATTGCAGACCCAGATGATAGAGGCATGTTGGATATGTGCGG 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTGTTTGTGGAATGACATCAAATGGTTTCACCATTGCAGACCCAGATGATAGAGGCATGTTGGATATGTGCGG 1628
Query 1563 CTTTGATACTGGAGCTCTGGATGTAATTCGAAATTTCACATTAGATATGATT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTTTGATACTGGAGCTCTGGATGTAATTCGAAATTTCACATTAGATATGATT 1680