Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07101
• Subject: NM_001318832.1
• Aligned Length: 1795
• Identities: 1736
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  -----------MAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTPRPNPRSAEGKQTEFIITAEILRELSMECGLNNRIRMIGQ  63
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MEGFSGASWSTMAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTPRPNPRSAEGKQTEFIITAEILRELSMECGLNNRIRMIGQ  74

Query   64  ICEVAKTKKFEEHAVEALWKAVADLLQPERPLEARHAVLALLKAIVQGQGERLGVLRALFFKVIKDYPSNEDLH  137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ICEVAKTKKFEEHAVEALWKAVADLLQPERPLEARHAVLALLKAIVQGQGERLGVLRALFFKVIKDYPSNEDLH  148

Query  138  ERLEVFKALTDNGRHITYLEEELADFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEYIARMVQMICLLCVRTVS  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  149  ERLEVFKALTDNGRHITYLEEELADFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEYIARMVQMICLLCVRTAS  222

Query  212  SVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIVTLCRTINVKELCEPCWKLMRNLLGTHLGHSAIYNMCHLMEDRAY  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  SVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIVTLCRTINVKELCEPCWKLMRNLLGTHLGHSAIYNMCHLMEDRAY  296

Query  286  MEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLRNSPTSVLPSFYQAMACPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQVVAWD  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  MEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLRNSPTSVLPSFYQAMACPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQVVAWD  370

Query  360  ILLNIIERLLQQLQTLDSPELRTIVHDLLTTVEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQS  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ILLNIIERLLQQLQTLDSPELRTIVHDLLTTVEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQS  444

Query  434  IHPAKDGWIQNLQALMERFFRSESRGAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKL  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  IHPAKDGWIQNLQALMERFFRSESRGAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKL  518

Query  508  ATQLLVDLAEGCHTHHFNSLLDIIEKVMARSLSPPPELEERDVAAYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPAS  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATQLLVDLAEGCHTHHFNSLLDIIEKVMARSLSPPPELEERDVAAYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPAS  592

Query  582  HATRVYEMLVSHIQLHYKHSYTLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCVCDYMEPERGS  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  HATRVYEMLVSHIQLHYKHSYTLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCVCDYMEPERGS  666

Query  656  EKKTSGPLSPPTGPPGPAPAGPAVRLGSVPYSLLFRVLLQCLKQESDWEVLKLVLGRLPESLRYKVLIFTSPCS  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  EKKTSGPLSPPTGPPGPAPAGPAVRLGSVPYSLLFRVLLQCLKQESDWKVLKLVLGRLPESLRYKVLIFTSPCS  740

Query  730  VDQLCSALCSMLSGPKTLERLRGAPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYLDKTKQREMVYCLEQGLIHRCASQ  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  VDQLCSALCSMLSGPKTLERLRGAPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYLDKTKQREMVYCLEQGLIHRCASQ  814

Query  804  CVVALSICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAVPLLEFLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTN  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CVVALSICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAVPLLEFLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTN  888

Query  878  PSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDFVPFITKGLRSNVLLSFDDTPEKDSFRARSTSLNERPKSLRIAR  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  889  PSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDFVPFITKGLRSNVLLSFDDTPEKDSFRARSTSLNERPK------  956

Query  952  PPKQGLNNSPPVKEFKESSAAEAFRCRSISVSEHVVRSRIQTSLTSASLGSADENSVAQADDSMKNLHLELTET  1025
                                                  |||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  957  --------------------------------------RIQTSLTSASLGSADENSVAQADDSLKNLHLELTET  992

Query 1026  CLDMMARYVFSNFTAVPKRSPVGEFLLAGGRTKTWLVGNKLVTVTTSVGTGTRSLLGLDSGELQSGPESSSSPG  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  CLDMMARYVFSNFTAVPKRSPVGEFLLAGGRTKTWLVGNKLVTVTTSVGTGTRSLLGLDSGELQSGPESSSSPG  1066

Query 1100  VHVRQTKEAPAKLESQAGQQVSRGARDRVRSMSGGHGLRVGALDVPASQFLGSATSPGPRTAPAAKPEKASAGT  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067  VHVRQTKEAPAKLESQAGQQVSRGARDRVRSMSGGHGLRVGALDVPASQFLGSATSPGPRTAPAAKPEKASAGT  1140

Query 1174  RVPVQEKTNLAAYVPLLTQGWAEILVRRPTGNTSWLMSLENPLSPFSSDINNMPLQELSNALMAAERFKEHRDT  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141  RVPVQEKTNLAAYVPLLTQGWAEILVRRPTGNTSWLMSLENPLSPFSSDINNMPLQELSNALMAAERFKEHRDT  1214

Query 1248  ALYKSLSVPAASTAKPPPLPRSNTDSAVVMEEGSPGEVPVLVEPPGLEDVEAALGMDRRTDAYSRSSSVSSQEE  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215  ALYKSLSVPAASTAKPPPLPRSNTDSAVVMEEGSPGEVPVLVEPPGLEDVEAALGMDRRTDAYSRSSSVSSQEE  1288

Query 1322  KSLHAEELVGRGIPIERVVSSEGGRPSVDLSFQPSQPLSKSSSSPELQTLQDILGDPGDKADVGRLSPEVKARS  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289  KSLHAEELVGRGIPIERVVSSEGGRPSVDLSFQPSQPLSKSSSSPELQTLQDILGDPGDKADVGRLSPEVKARS  1362

Query 1396  QSGTLDGESAAWSASGEDSRGQPEGPLPSSSPRSPSGLRPRGYTISDSAPSRRGKRVERDALKSRATASNAEKV  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363  QSGTLDGESAAWSASGEDSRGQPEGPLPSSSPRSPSGLRPRGYTISDSAPSRRGKRVERDALKSRATASNAEKV  1436

Query 1470  PGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNESQSFERSVQLLDQIPSYDTHKIAVLYVGEGQSNSELAILSNEH  1543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437  PGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNESQSFERSVQLLDQIPSYDTHKIAVLYVGEGQSNSELAILSNEH  1510

Query 1544  GSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGEDGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDVDKHRCDKKRH  1617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511  GSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGEDGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDVDKHRCDKKRH  1584

Query 1618  LGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFNFVHVMVTPLDYECNLVSLQCRKDMEGLVDTSVAKIVSDRNLPFVARQ  1691
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585  LGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFNFVHVIVTPLDYECNLVSLQCRKDMEGLVDTSVAKIVSDRNLPFVARQ  1658

Query 1692  MALHANMASQVHHSRSNPTDIYPSKWIARLRHIKRLRQRICEEAAYSNPSLPLVHPPSHSKAPAQTPAEPTPGY  1765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1659  MALHANMASQVHHSRSNPTDIYPSKWIARLRHIKRLRQRICEEAAYSNPSLPLVHPPSHSKAPAQTPAEPTPGY  1732

Query 1766  EVGQRKRLISSVEDFTEFV  1784
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1733  EVGQRKRLISSVEDFTEFV  1751