Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07108
- Subject:
- NM_006001.3
- Aligned Length:
- 1355
- Identities:
- 1140
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGCGTGAATGCATCTCAGTCCACGTGGGGCAGGCAGGTGTCCAGATGGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTATTG 74
||||||||.||.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1 ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG 74
Query 75 CTTGGAACATGGGATTCAGCCTGATGGGCAGATGCCCAGTGACAAGACCATTGGTGGAGGGGACGACTCCTTCA 148
|.||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA 148
Query 149 CCACCTTCTTCTGTGAAACTGGTGCTGGAAAACACGTACCCCGGGCAGTTTTTGTGGATCTGGAGCCTACGGTC 222
.|||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct 149 ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG 222
Query 223 ATTGATGAGATCCGAAATGG--CCCATACCGACAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTCATCACTGGGAAAGAGGAT 294
.|.|||||..|.||.|..|| ||.||| |.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 223 GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATA--GGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGAT 294
Query 295 GCTGCCAACAACTATGCCCGTGGTCACTATACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCCAGTGCTGGATCGGATCCG 368
||.|||||.||.||.|||.|.||.||.||.|||||.||||||||||||.|.||||..||.|||||.||||||||
Sbjct 295 GCGGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCG 368
Query 369 CAAGCTGTCTGACCAGTGCACAGGACTTCAGGGCTTCCTGGTGTTCCACAGCTTTGGTGGGGGCACTGGCTCTG 442
|||.|||.|.||.|.||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 369 CAAACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTG 442
Query 443 GCTTCACCTCACTCCTGATGGAGCGGCTCTCTGTTGACTATGGCAAGAAATCCAAGCTGGAATTCTCCATCTAC 516
|.|||.|.||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||..||||.|||
Sbjct 443 GGTTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTAC 516
Query 517 CCAGCCCCCCAGGTGTCTACAGCCGTGGTCGAGCCCTACAACTCTATCCTGACCACCCACACCACCCTGGAGCA 590
||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 517 CCAGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACA 590
Query 591 CTCAGACTGTGCCTTCATGGTGGACAACGAAGCAATCTATGACATCTGCCGCCGCAACCTAGACATCGAGCGCC 664
.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 591 TTCTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTC 664
Query 665 CAACCTACACCAACCTCAATCGCCTCATTAGCCAAATTGTCTCCTCCATCACAGCTTCTCTGCGCTTTGACGGG 738
|.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 665 CCACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGG 738
Query 739 GCCCTCAATGTGGACCTGACAGAGTTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCTCGCATCCACTTCCCCCTGGCCAC 812
|||||.|||||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GCCCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCAC 812
Query 813 CTATGCACCAGTCATCTCTGCAGAAAAGGCATACCACGAGCAGCTGTCGGTGGCAGAGATCACCAATGCCTGCT 886
|||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 813 CTACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCT 886
Query 887 TTGAGCCTGCCAACCAGATGGTAAAGTGTGATCCCCGGCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCCTGCTGTACCGT 960
|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|.
Sbjct 887 TCGAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGG 960
Query 961 GGAGATGTGGTGCCCAAGGATGTCAACGCTGCCATTGCCGCCATCAAGACCAAGCGCAGCATTCAGTTTGTGGA 1034
||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||.|||.||||||||.||
Sbjct 961 GGGGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGA 1034
Query 1035 CTGGTGCCCCACAGGCTTCAAGGTTGGTATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGGGGTGACCTGGCCA 1108
.||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1035 TTGGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCA 1108
Query 1109 AGGTGCAGCGTGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACGACCGCCATCGCCGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCACAAG 1182
||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1109 AGGTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAG 1182
Query 1183 TTCGACCTGATGTATGCCAAGAGGGCGTTTGTGCACTGGTATGTGGGTGAGGGCATGGAGGAGGGTGAGTTCTC 1256
|||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1183 TTCGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTC 1256
Query 1257 CGAGGCCCGTGAGGATATGGCTGCCCTGGAGAAGGATTATGAGGAGGTGGGCATCGACTCCTATGAGGACGAGG 1330
.||||||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||...||.|.|||||
Sbjct 1257 TGAGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCCGAGG 1330
Query 1331 ATGAGGGAGAAG----AG----- 1344
.||| ||||| ||
Sbjct 1331 CTGA---AGAAGGTGAAGAATAC 1350