Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07127
- Subject:
- NM_009506.2
- Aligned Length:
- 1257
- Identities:
- 1091
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGCACTTGCTGGGCTTCTTCTCTGTGGCGTGTTCTCTGCTCGCCGCTGCGCTGCTCCCGGGTCCTCGCGAGGC 74
||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||..||||.||||||||
Sbjct 1 ATGCACTTGCTGTGCTTCTTGTCTCTGGCGTGTTCCCTGCTCGCCGCTGCGCTGATCCCCAGTCCGCGCGAGGC 74
Query 75 GCCCGCCGCCGCCGCCGCCTTCGAGTCCGGACTCGACCTCTCGGACGCGGAGCCCGACGCGGGCGAGGCCACGG 148
|||||||.|||.|||||||||||||||.|||||.|.|.|||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 75 GCCCGCCACCGTCGCCGCCTTCGAGTCGGGACTGGGCTTCTCGGAAGCGGAGCCCGACGGGGGCGAGGTCAAGG 148
Query 149 CTTATGCAAGCAAAGATCTGGAGGAGCAGTTACGGTCTGTGTCCAGTGTAGATGAACTCATGACTGTACTCTAC 222
|||.||.|.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||.||||.||.|||
Sbjct 149 CTTTTGAAGGCAAAGACCTGGAGGAGCAGTTGCGGTCTGTGTCCAGCGTAGATGAGCTGATGTCTGTCCTGTAC 222
Query 223 CCAGAATATTGGAAAATGTACAAGTGTCAGCTAAGGAAAGGAGGCTGGCAACATAACAGAGAACAGGCCAACCT 296
|||||.||.|||||||||||||||||.|||||..|||||||.||||||| |.|||.|||.|||
Sbjct 223 CCAGACTACTGGAAAATGTACAAGTGCCAGCTGCGGAAAGGCGGCTGGC------------AGCAGCCCACCCT 284
Query 297 CAACTCAAGGACAGAAGAGACTATAAAATTTGCTGCAGCACATTATAATACAGAGATCTTGAAAAGTATTGATA 370
|||..|.|||||||..||.|.|.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 285 CAATACCAGGACAGGGGACAGTGTAAAATTTGCTGCTGCACATTATAACACAGAGATCCTGAAAAGTATTGATA 358
Query 371 ATGAGTGGAGAAAGACTCAATGCATGCCACGGGAGGTGTGTATAGATGTGGGGAAGGAGTTTGGAGTCGCGACA 444
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||
Sbjct 359 ATGAGTGGAGAAAGACTCAATGCATGCCACGTGAGGTGTGTATAGATGTGGGGAAGGAGTTTGGAGCAGCCACA 432
Query 445 AACACCTTCTTTAAACCTCCATGTGTGTCCGTCTACAGATGTGGGGGTTGCTGCAATAGTGAGGGGCTGCAGTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 433 AACACCTTCTTTAAACCTCCATGTGTGTCCGTCTACAGATGTGGGGGTTGCTGCAACAGCGAGGGGCTGCAGTG 506
Query 519 CATGAACACCAGCACGAGCTACCTCAGCAAGACGTTATTTGAAATTACAGTGCCTCTCTCTCAAGGCCCCAAAC 592
|||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 507 CATGAACACCAGCACAGGTTACCTCAGCAAGACGTTGTTTGAAATTACAGTGCCTCTCTCACAAGGCCCCAAAC 580
Query 593 CAGTAACAATCAGTTTTGCCAATCACACTTCCTGCCGATGCATGTCTAAACTGGATGTTTACAGACAAGTTCAT 666
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 CAGTCACAATCAGTTTTGCCAATCACACTTCCTGCCGGTGCATGTCTAAACTGGATGTTTACAGACAAGTTCAT 654
Query 667 TCCATTATTAGACGTTCCCTGCCAGCAACACTACCACAGTGTCAGGCAGCGAACAAGACCTGCCCCACCAATTA 740
||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||
Sbjct 655 TCAATTATTAGACGTTCTCTGCCAGCAACATTACCACAGTGTCAGGCAGCTAACAAGACATGTCCAACAAACTA 728
Query 741 CATGTGGAATAATCACATCTGCAGATGCCTGGCTCAGGAAGATTTTATGTTTTCCTCGGATGCTGGAGATGACT 814
..||||||||||..||||.|||.||||||||||||||.|.||||||||.||||..||..|||.||.||||||||
Sbjct 729 TGTGTGGAATAACTACATGTGCCGATGCCTGGCTCAGCAGGATTTTATCTTTTATTCAAATGTTGAAGATGACT 802
Query 815 CAACAGATGGATTCCATGACATCTGTGGACCAAACAAGGAGCTGGATGAAGAGACCTGTCAGTGTGTCTGCAGA 888
||||..|||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..
Sbjct 803 CAACCAATGGATTCCATGATGTCTGTGGACCCAACAAGGAGCTGGATGAAGACACCTGTCAGTGTGTCTGCAAG 876
Query 889 GCGGGGCTTCGGCCTGCCAGCTGTGGACCCCACAAAGAACTAGACAGAAACTCATGCCAGTGTGTCTGTAAAAA 962
|.||||||||||||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 877 GGGGGGCTTCGGCCATCTAGTTGTGGACCCCACAAAGAACTAGATAGAGACTCATGTCAGTGTGTCTGTAAAAA 950
Query 963 CAAACTCTTCCCCAGCCAATGTGGGGCCAACCGAGAATTTGATGAAAACACATGCCAGTGTGTATGTAAAAGAA 1036
||||||.|||||.|....||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 951 CAAACTTTTCCCTAATTCATGTGGAGCCAACAGGGAATTTGATGAGAATACATGTCAGTGTGTATGTAAAAGAA 1024
Query 1037 CCTGCCCCAGAAATCAACCCCTAAATCCTGGAAAATGTGCCTGTGAATGTACAGAAAGTCCACAGAAATGCTTG 1110
|.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||.|||||.
Sbjct 1025 CGTGTCCAAGAAATCAGCCCCTGAATCCTGGGAAATGTGCCTGTGAATGTACAGAAAACACACAGAAGTGCTTC 1098
Query 1111 TTAAAAGGAAAGAAGTTCCACCACCAAACATGCAGCTGTTACAGACGGCCATGTACGAACCGCCAGAAGGCTTG 1184
.|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||.||||.||.|.||||..|||
Sbjct 1099 CTTAAAGGGAAGAAGTTCCACCATCAAACATGCAGTTGTTACAGAAGACCGTGTGCGAATCGACTGAAGCATTG 1172
Query 1185 TGAGCCAGGATTTTCATATAGTGAAGAAGTGTGTCGTTGTGTCCCTTCATATTGGCAAAGACCACAAATGAGC 1257
|||.||||||.|.||.|.||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||.||||.|||||..|||.|
Sbjct 1173 TGATCCAGGACTGTCCTTTAGTGAAGAAGTATGCCGCTGTGTCCCATCGTATTGGAAAAGGCCACATCTGAAC 1245