Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07140
• Subject: NM_001354726.1
• Aligned Length: 940
• Identities: 746
• Gaps: 193

Alignment

Query   1  MARKRAAGGEPRGRELRSQKSKAKSKARREEEEEDAFEDEKPPKKSLLSKVSQGKRKRGCSHPGGSADGPAKKK  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  VAKVTVKSENLKVIKDEALSDGDDLRDFPSDLKKAHHLKRGATMNEDSNEEEEESENDWEEVEELSEPVLGDVR  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  ESTAFSRSLLPVKPVEIEIETPEQAKTRERSEKIKLEFETYLRRAMKRFNKGVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNN  222
                                                        |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ---------------------------------------------MKRFNKGVHEDTHKVHLLCLLANGFYRNN  29

Query 223  ICSQPDLHAIGLSIIPARFTRVLPRDVDTYYLSNLVKWFIGTFTVNAELSASEQDNLQTTLERRFAIYSARDDE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  30  ICSQPDLHAIGLSIIPARFTRVLPRDVDTYYLSNLVKWFIGTFTVNAELSASEQDNLQTTLERRFAIYSARDDE  103

Query 297  ELVHIFLLILRALQLLTRLVLSLQPIPLKSATAKGKKPSKERLTADPGGSSETSSQVLENHTKPKTSKGTKQEE  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104  ELVHIFLLILRALQLLTRLVLSLQPIPLKSATAKGKKPSKERLTADPGGSSETSSQVLENHTKPKTSKGTKQEE  177

Query 371  TFAKGTCRPSAKGKRNKGGRKKRSKPSSSEEDEGPGDKQEKATQRRPHGRERRVASRVSYKEESGSDEAGSGSD  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178  TFAKGTCRPSAKGKRNKGGRKKRSKPSSSEEDEGPGDKQEKATQRRPHGRERRVASRVSYKEESGSDEAGSGSD  251

Query 445  FELSSGEASDPSDEDSEPGPPKQRKAPAPQRTKAGSKSASRTHRGSHRKDPSLPAASSSSSSSKRGKKMCSDGE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252  FELSSGEASDPSDEDSEPGPPKQRKAPAPQRTKAGSKSASRTHRGSHRKDPSLPAASSSSSSSKRGKKMCSDGE  325

Query 519  KAEKRSIAGIDQWLEVFCEQEEKWVCVDCVHGVVGQPLTCYKYATKPMTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPVWMTV  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326  KAEKRSIAGIDQWLEVFCEQEEKWVCVDCVHGVVGQPLTCYKYATKPMTYVVGIDSDGWVRDVTQRYDPVWMTV  399

Query 593  TRKCRVDAEWWAETLRPYQSPFMDREKKEDLEFQAKHMDQPLPTAIGLYKNHPLYALKRHLLKYEAIYPETAAI  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400  TRKCRVDAEWWAETLRPYQSPFMDREKKEDLEFQAKHMDQPLPTAIGLYKNHPLYALKRHLLKYEAIYPETAAI  473

Query 667  LGYCRGEAVYSRDCVHTLHSRDTWLKKARVVRLGEVPYKMVKGFSNRARKARLAEPQLREENDLGLFGYWQTEE  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474  LGYCRGEAVYSRDCVHTLHSRDTWLKKARVVRLGEVPYKMVKGFSNRARKARLAEPQLREENDLGLFGYWQTEE  547

Query 741  YQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPIGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIVC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548  YQPPVAVDGKVPRNEFGNVYLFLPSMMPIGCVQLNLPNLHRVARKLDIDCVQAITGFDFHGGYSHPVTDGYIVC  621

Query 815  EEFKDVLLTAWENEQAVIERKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKRRYGPKSEAAAPHTDAGGGLSSDEEE  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622  EEFKDVLLTAWENEQAVIERKEKEKKEKRALGNWKLLAKGLLIRERLKRRYGPKSEAAAPHTDAGGGLSSDEEE  695

Query 889  GTSSQAEAARILAASWPQNREDEEKQKLKGGPKKTKREKKAAASHLFPFEKL  940
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 696  GTSSQAEAARILAASWPQNREDEEKQKLKGGPKKTKREKKAAASHLFPFEQL  747